MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4

Total Repeats: 1685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016587	CCCA	2	8	562622	562629	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1502	NC_016587	A	6	6	562702	562707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016587	A	6	6	562710	562715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016587	CCG	2	6	562791	562796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_016587	ATC	3	9	562804	562812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_016587	ATG	2	6	563310	563315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016587	GAA	2	6	563347	563352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016587	A	7	7	565003	565009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016587	CCA	2	6	565021	565026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_016587	AGC	2	6	565032	565037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_016587	AGC	2	6	565580	565585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_016587	TCCG	2	8	566749	566756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_016587	CGG	2	6	566793	566798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_016587	C	6	6	566804	566809	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1515	NC_016587	CAC	2	6	573457	573462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_016587	AGA	2	6	573479	573484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016587	TGC	2	6	573498	573503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_016587	CGG	2	6	573535	573540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016587	CGA	2	6	573651	573656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_016587	CCT	2	6	573663	573668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_016587	C	6	6	573726	573731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1522	NC_016587	CGC	2	6	573736	573741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_016587	AGC	2	6	573783	573788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_016587	ACC	2	6	573795	573800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_016587	CGG	2	6	574452	574457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_016587	GGA	2	6	578241	578246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016587	CG	4	8	597930	597937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_016587	CCG	2	6	598024	598029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_016587	GCC	2	6	598069	598074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_016587	AAT	2	6	600066	600071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016587	GA	3	6	600129	600134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016587	C	6	6	601354	601359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1533	NC_016587	AGGG	2	8	601394	601401	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016587	GCT	2	6	601411	601416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_016587	C	6	6	601421	601426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1536	NC_016587	CG	3	6	601464	601469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_016587	CAT	2	6	601471	601476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_016587	CCT	2	6	601477	601482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_016587	CCGACA	2	12	601486	601497	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_016587	CCG	2	6	601879	601884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_016587	CGAA	2	8	603524	603531	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_016587	CAA	2	6	603548	603553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_016587	TCG	2	6	603654	603659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_016587	A	6	6	603695	603700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016587	AT	3	6	603710	603715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016587	CCGG	2	8	603750	603757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_016587	G	6	6	603863	603868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016587	GGC	2	6	604905	604910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_016587	CGGT	2	8	604930	604937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_016587	GCA	2	6	604980	604985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_016587	CAT	2	6	604988	604993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_016587	GCG	2	6	605066	605071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016587	CGGG	2	8	605089	605096	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_016587	GC	3	6	606648	606653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_016587	ATC	2	6	607702	607707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_016587	AG	3	6	607755	607760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016587	GTC	4	12	607995	608006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_016587	GGC	2	6	608036	608041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_016587	CCG	2	6	608052	608057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_016587	GCC	2	6	608094	608099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_016587	CT	3	6	608454	608459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_016587	GATG	2	8	608527	608534	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016587	GAC	2	6	611608	611613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_016587	CAA	2	6	611690	611695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_016587	CG	3	6	611770	611775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_016587	AAC	2	6	611797	611802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_016587	CGCGA	2	10	611803	611812	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1568	NC_016587	CCGG	2	8	611838	611845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_016587	TCG	2	6	611852	611857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_016587	C	6	6	611868	611873	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1571	NC_016587	CCG	2	6	611876	611881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_016587	CCCA	2	8	614756	614763	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1573	NC_016587	CAT	2	6	614803	614808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_016587	GCA	2	6	614840	614845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_016587	GAC	2	6	614865	614870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016587	CCG	2	6	614894	614899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_016587	G	6	6	614986	614991	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016587	TCCGT	2	10	616317	616326	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1579	NC_016587	CGGC	2	8	616364	616371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_016587	C	6	6	616390	616395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1581	NC_016587	ACA	2	6	617058	617063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_016587	CCGC	2	8	617856	617863	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1583	NC_016587	GCT	2	6	617896	617901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_016587	GCT	2	6	617910	617915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_016587	CTT	2	6	619220	619225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_016587	CTGCG	2	10	619230	619239	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1587	NC_016587	CCGG	2	8	619245	619252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_016587	CG	4	8	619273	619280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_016587	CGGC	2	8	619327	619334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_016587	GC	3	6	619340	619345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_016587	GCC	2	6	619383	619388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_016587	CGG	2	6	619499	619504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_016587	CCGGA	2	10	619527	619536	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1594	NC_016587	CAA	2	6	619541	619546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_016587	GGC	2	6	619547	619552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_016587	AAC	2	6	619575	619580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_016587	GGCG	2	8	619966	619973	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_016587	CG	3	6	619972	619977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_016587	GC	3	6	619981	619986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_016587	CGGA	2	8	620595	620602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_016587	CCTC	2	8	620654	620661	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1602	NC_016587	TCCCG	2	10	620662	620671	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1603	NC_016587	TTC	2	6	620681	620686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_016587	C	7	7	620686	620692	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1605	NC_016587	C	6	6	620741	620746	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1606	NC_016587	CCG	2	6	620752	620757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_016587	GTC	2	6	620833	620838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_016587	GCCC	3	12	624843	624854	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1609	NC_016587	TCT	2	6	624924	624929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_016587	TCC	2	6	624933	624938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_016587	GGC	2	6	624964	624969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_016587	CCGC	2	8	624986	624993	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1613	NC_016587	GGC	2	6	625007	625012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_016587	CAG	2	6	626696	626701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_016587	TCCC	2	8	626724	626731	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1616	NC_016587	CCGG	2	8	627713	627720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_016587	GGCC	2	8	627751	627758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_016587	TGG	2	6	628602	628607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016587	GCG	3	9	628608	628616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_016587	CCG	2	6	630209	630214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_016587	CAA	2	6	630287	630292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_016587	GT	3	6	630309	630314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016587	TCAA	2	8	631040	631047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_016587	C	6	6	632974	632979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1625	NC_016587	GGA	2	6	632980	632985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016587	ATT	2	6	633056	633061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016587	CGG	2	6	633063	633068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_016587	G	6	6	633067	633072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016587	TCCC	2	8	633109	633116	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1630	NC_016587	TCCC	2	8	633165	633172	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1631	NC_016587	CAA	2	6	634137	634142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_016587	ACAA	2	8	634192	634199	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_016587	ACA	2	6	634215	634220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_016587	CGC	2	6	634236	634241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_016587	ACAA	2	8	635768	635775	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_016587	CGG	2	6	635857	635862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_016587	GGA	2	6	635876	635881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_016587	GCCC	2	8	635922	635929	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1672	NC_016587	C	6	6	643244	643249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1673	NC_016587	CGG	2	6	643256	643261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1675	NC_016587	GCCG	2	8	643282	643289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1677	NC_016587	GCCC	2	8	643330	643337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1681	NC_016587	CCCG	2	8	643486	643493	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1682	NC_016587	CCA	2	6	643514	643519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1683	NC_016587	CCG	2	6	643535	643540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1684	NC_016587	CCCT	2	8	645223	645230	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1685	NC_016587	TGG	2	6	645247	645252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.