MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p2

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016586	ACGGG	2	10	64	73	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016586	AATCA	2	10	1020	1029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016586	AGAGG	2	10	1968	1977	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016586	TTGAA	2	10	1986	1995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016586	ATCCC	2	10	3164	3173	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_016586	GACCG	2	10	6721	6730	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016586	TTCGG	2	10	11215	11224	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016586	TCGTG	2	10	12109	12118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016586	AATCA	2	10	13955	13964	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016586	AGAGG	2	10	15357	15366	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016586	TTGAA	2	10	15375	15384	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016586	ATCCC	2	10	16554	16563	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_016586	CGCAC	2	10	17508	17517	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_016586	ACCGT	2	10	18270	18279	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016586	CGCCA	2	10	18317	18326	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_016586	AGGGG	2	10	32210	32219	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016586	CGTCC	2	10	39324	39333	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_016586	TCCCC	2	10	40209	40218	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_016586	TGACA	2	10	55244	55253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016586	GCCGT	2	10	63324	63333	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016586	GATTC	2	10	79608	79617	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016586	AGGCA	2	10	100933	100942	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016586	GAATC	2	10	103405	103414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016586	CGCTC	2	10	104185	104194	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_016586	AAGCG	2	10	104641	104650	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016586	CGAGC	2	10	112422	112431	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016586	AGGGC	2	10	112474	112483	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016586	CCGTT	2	10	113251	113260	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016586	GTCCT	2	10	113303	113312	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016586	CCGGT	2	10	113364	113373	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016586	TTGGT	2	10	128618	128627	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016586	GGTCC	2	10	138655	138664	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016586	GCGTC	2	10	155525	155534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016586	AAGGG	2	10	167170	167179	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016586	GATCG	2	10	171608	171617	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016586	GCGGA	2	10	176728	176737	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016586	CGGGG	2	10	185370	185379	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016586	AGCCG	3	15	188922	188936	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016586	CCTCT	2	10	193939	193948	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016586	TGGAA	2	10	207317	207326	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016586	CGGGG	2	10	208501	208510	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016586	GCCGG	2	10	230091	230100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016586	CCGCT	2	10	232120	232129	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_016586	CGGAA	2	10	237680	237689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016586	GCACG	2	10	242800	242809	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_016586	CCATC	2	10	243686	243695	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_016586	TCCCC	2	10	250137	250146	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
48	NC_016586	AGGGG	2	10	252748	252757	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016586	CGGGG	2	10	257917	257926	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016586	TGGGG	2	10	269039	269048	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016586	CTTTC	2	10	274395	274404	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016586	GCAAA	2	10	286031	286040	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016586	GGCGG	2	10	286100	286109	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016586	ATGTC	2	10	298297	298306	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016586	AGTTG	2	10	322484	322493	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016586	CCATT	2	10	339332	339341	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016586	TGCCC	2	10	360538	360547	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_016586	GGCAT	2	10	363251	363260	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016586	CTCAT	2	10	366160	366169	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016586	TGCAC	2	10	368082	368091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016586	AATCC	2	10	377781	377790	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016586	TCCCG	2	10	406132	406141	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_016586	CATGC	2	10	406793	406802	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016586	CGCGT	2	10	412824	412833	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016586	CAACG	2	10	423097	423106	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_016586	TTCTT	2	10	435254	435263	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016586	TTCCC	2	10	438344	438353	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_016586	CTCAC	2	10	443019	443028	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_016586	CCTCC	2	10	444228	444237	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
70	NC_016586	AAGGA	2	10	449848	449857	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016586	CGCAA	2	10	450695	450704	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016586	AAGCG	2	10	452057	452066	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016586	CTGCC	2	10	455984	455993	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_016586	TCCCG	2	10	483306	483315	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_016586	GAGAA	2	10	527149	527158	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016586	GGAGA	2	10	529015	529024	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016586	CCGAA	2	10	529050	529059	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016586	CCGGG	2	10	559500	559509	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_016586	GGATT	2	10	559515	559524	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016586	ATCGC	2	10	564587	564596	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016586	GCCGC	2	10	564643	564652	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_016586	GCAGA	2	10	569388	569397	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016586	GCCGG	2	10	570349	570358	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016586	CCGGC	2	10	583215	583224	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016586	CCCTG	2	10	595382	595391	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_016586	GGCAG	2	10	597699	597708	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016586	CGGAA	2	10	607738	607747	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016586	GCGGG	2	10	611273	611282	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016586	CCGGC	2	10	611768	611777	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_016586	CGCCC	2	10	611819	611828	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
91	NC_016586	ATGTT	2	10	613996	614005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016586	ATAAC	2	10	614006	614015	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016586	CCGTT	2	10	614152	614161	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016586	GCCGT	2	10	622851	622860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016586	CCCCT	2	10	627430	627439	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_016586	CGGCA	2	10	634942	634951	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_016586	GTCCG	2	10	645160	645169	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_016586	GCCCC	2	10	652353	652362	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
99	NC_016586	GGACC	2	10	653151	653160	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016586	TTCGC	2	10	658959	658968	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016586	CCGGG	2	10	682856	682865	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016586	TGCGG	2	10	687941	687950	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016586	GATCC	2	10	693729	693738	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016586	CCGAC	2	10	694087	694096	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_016586	CGGGA	2	10	707281	707290	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016586	CCCTT	2	10	714212	714221	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_016586	TGGGG	2	10	726665	726674	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016586	TCCCG	2	10	731574	731583	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_016586	CCAGC	2	10	738451	738460	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_016586	GGGGA	2	10	745551	745560	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016586	TTCGG	2	10	748405	748414	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016586	TTCGG	2	10	749252	749261	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016586	TCGTG	2	10	749299	749308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.