MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p2

Total Repeats: 2168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016586	CGG	2	6	101790	101795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016586	GC	3	6	101856	101861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_016586	GGC	2	6	101878	101883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016586	CCT	2	6	102497	102502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_016586	GAT	2	6	102596	102601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016586	CCG	2	6	102629	102634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_016586	CAG	2	6	102723	102728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016586	GAC	2	6	102734	102739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016586	CGT	2	6	102742	102747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_016586	GTC	2	6	102749	102754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016586	CAGC	2	8	102791	102798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
512	NC_016586	CTCG	2	8	102799	102806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
513	NC_016586	GCGGCA	2	12	102832	102843	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_016586	TGT	2	6	102853	102858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016586	GGT	2	6	102971	102976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016586	GGC	3	9	103025	103033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_016586	CCGG	2	8	103071	103078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_016586	CCA	2	6	103094	103099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_016586	GC	3	6	103130	103135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_016586	GGC	2	6	103159	103164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016586	T	6	6	103212	103217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016586	TCT	2	6	103266	103271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016586	CGC	2	6	103370	103375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_016586	CTC	2	6	103385	103390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_016586	GAATC	2	10	103405	103414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_016586	GCG	2	6	103562	103567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016586	GGC	2	6	103570	103575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016586	ACC	2	6	103578	103583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_016586	GGT	2	6	103607	103612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016586	GCG	2	6	103616	103621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016586	GTC	2	6	103640	103645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016586	GCAG	2	8	103648	103655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_016586	TCA	2	6	103672	103677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_016586	G	9	9	103774	103782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016586	CGG	2	6	103815	103820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_016586	CGC	2	6	103835	103840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_016586	CGC	2	6	104036	104041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_016586	GCA	2	6	104049	104054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_016586	CGGC	2	8	104095	104102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_016586	CAG	2	6	104113	104118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_016586	TCA	2	6	104169	104174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016586	CGCTC	2	10	104185	104194	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
543	NC_016586	CAAGAT	2	12	104227	104238	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
544	NC_016586	TC	3	6	104277	104282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_016586	ACA	2	6	104298	104303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016586	CGC	2	6	104333	104338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_016586	GCA	2	6	104393	104398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016586	GCC	2	6	104431	104436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_016586	CGG	2	6	104479	104484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_016586	ACG	2	6	104496	104501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016586	CG	3	6	104500	104505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_016586	G	6	6	104603	104608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016586	GCG	2	6	104611	104616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016586	AAGCG	2	10	104641	104650	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
555	NC_016586	GAC	2	6	104706	104711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016586	GAA	2	6	104748	104753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016586	ATT	2	6	104765	104770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016586	ATC	2	6	104834	104839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_016586	TCTT	2	8	104908	104915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_016586	CTT	2	6	104946	104951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016586	GACC	2	8	105001	105008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_016586	GTCA	2	8	105030	105037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_016586	GGA	2	6	109723	109728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016586	GAT	2	6	112381	112386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016586	GCG	2	6	112397	112402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_016586	CGAGC	2	10	112422	112431	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
567	NC_016586	GGCCGG	2	12	112438	112449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016586	AGGGC	2	10	112474	112483	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
569	NC_016586	GGC	3	9	112549	112557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016586	AGG	2	6	112572	112577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016586	GCG	2	6	112586	112591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016586	GCG	2	6	112608	112613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_016586	TGG	2	6	112626	112631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016586	CGCC	2	8	112675	112682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
575	NC_016586	CGC	2	6	112707	112712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_016586	GCG	2	6	112713	112718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_016586	GTCG	2	8	112731	112738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
578	NC_016586	GAA	2	6	112744	112749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016586	CTG	2	6	112751	112756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_016586	GCT	2	6	112777	112782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016586	GCGT	2	8	112795	112802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_016586	GGT	2	6	112807	112812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016586	GC	3	6	112885	112890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_016586	CAT	2	6	112921	112926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016586	CCT	2	6	112975	112980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_016586	GAC	2	6	113126	113131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016586	CCT	2	6	113148	113153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_016586	CGGA	2	8	113157	113164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
589	NC_016586	TGC	2	6	113184	113189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016586	GCC	2	6	113229	113234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_016586	CCGTT	2	10	113251	113260	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
592	NC_016586	GTCCT	2	10	113303	113312	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
593	NC_016586	CCGGT	2	10	113364	113373	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
594	NC_016586	CTT	2	6	113416	113421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016586	GA	3	6	113451	113456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016586	GCC	2	6	113471	113476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_016586	AGC	2	6	113550	113555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016586	GCT	2	6	113557	113562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_016586	TAA	3	9	113594	113602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016586	TA	3	6	113614	113619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016586	TC	3	6	113723	113728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_016586	AAC	2	6	113735	113740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_016586	GCCA	2	8	113759	113766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
604	NC_016586	TGC	2	6	113902	113907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_016586	CGG	2	6	113995	114000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_016586	AAG	2	6	114018	114023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016586	CGG	2	6	114064	114069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_016586	CGG	2	6	114072	114077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016586	ACA	2	6	114108	114113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_016586	CAAAAG	2	12	114198	114209	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
611	NC_016586	GTCA	2	8	114310	114317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_016586	TCT	2	6	114366	114371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_016586	GCG	2	6	114515	114520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016586	TCG	2	6	114554	114559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016586	ACGG	2	8	114574	114581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
616	NC_016586	ACG	2	6	114630	114635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_016586	GTT	2	6	114646	114651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016586	AC	3	6	114669	114674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_016586	GCC	2	6	114764	114769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_016586	CCGG	2	8	114786	114793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_016586	CCG	2	6	114819	114824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_016586	CGC	2	6	114945	114950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_016586	GCC	3	9	115031	115039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_016586	ATG	2	6	115085	115090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016586	GCA	2	6	115119	115124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_016586	CCTG	2	8	115137	115144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_016586	GCC	2	6	115160	115165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_016586	GCG	2	6	115221	115226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016586	TGG	2	6	115359	115364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016586	GAT	2	6	115453	115458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016586	GCG	2	6	115549	115554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_016586	CGG	2	6	115617	115622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016586	CGC	2	6	115659	115664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_016586	CGG	2	6	115684	115689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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636	NC_016586	CAG	2	6	115717	115722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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903	NC_016586	G	6	6	218193	218198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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912	NC_016586	G	6	6	230125	230130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
913	NC_016586	TCCG	2	8	230139	230146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
914	NC_016586	CCGCT	2	10	232120	232129	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
915	NC_016586	TGCC	2	8	232168	232175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
916	NC_016586	GCG	2	6	232196	232201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
917	NC_016586	A	6	6	232243	232248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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919	NC_016586	CAGG	2	8	232346	232353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
920	NC_016586	CGGG	2	8	232370	232377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
921	NC_016586	GCC	2	6	232418	232423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
922	NC_016586	CACG	2	8	232441	232448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
923	NC_016586	GCC	2	6	232449	232454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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933	NC_016586	CATC	2	8	235784	235791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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938	NC_016586	CAG	2	6	237615	237620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
939	NC_016586	ATG	2	6	237628	237633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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941	NC_016586	CGGAA	2	10	237680	237689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
942	NC_016586	CTTT	2	8	237737	237744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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945	NC_016586	CCG	2	6	240805	240810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
946	NC_016586	GCGG	2	8	241510	241517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
947	NC_016586	GCCC	2	8	241527	241534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
948	NC_016586	AAG	2	6	241541	241546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
949	NC_016586	GCC	2	6	241574	241579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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954	NC_016586	GC	3	6	242790	242795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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988	NC_016586	CGGGG	2	10	257917	257926	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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1000	NC_016586	CTC	2	6	266333	266338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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