MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 chromosome

Total Repeats: 344

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016513	CACAA	2	10	3205	3214	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016513	CCTTA	2	10	8605	8614	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016513	ATAAA	2	10	14318	14327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016513	AAAAT	2	10	18065	18074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016513	ATAAA	2	10	20308	20317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016513	AAATA	3	15	25975	25989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016513	AATTT	2	10	47693	47702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016513	ATGCA	2	10	47765	47774	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016513	TAAAA	2	10	48333	48342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016513	ATGTA	2	10	48394	48403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016513	TAAAT	2	10	51601	51610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016513	AATGG	2	10	59472	59481	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016513	GAATT	2	10	64067	64076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016513	AATTA	2	10	68164	68173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016513	TAAAT	2	10	71281	71290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016513	TTATT	2	10	72558	72567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016513	ATTCA	2	10	76377	76386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016513	ATAAA	2	10	78389	78398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016513	CGCAC	2	10	105164	105173	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_016513	TTGAA	2	10	118341	118350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016513	CTTTT	2	10	118411	118420	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016513	TAAAA	2	10	124458	124467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016513	CGTGC	2	10	126250	126259	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016513	GTAGC	2	10	135909	135918	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016513	TCGCT	2	10	140983	140992	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016513	ATTCA	2	10	141017	141026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016513	AATTT	2	10	145476	145485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016513	CTTTT	2	10	155794	155803	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016513	GAAAT	2	10	169047	169056	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016513	TTAAA	2	10	175253	175262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016513	CCAAT	2	10	197842	197851	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016513	GTAGA	2	10	212877	212886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016513	CTAAA	2	10	221129	221138	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016513	AATCA	2	10	223462	223471	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016513	TGTAC	2	10	233525	233534	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016513	ATTAA	2	10	241067	241076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016513	TTAAT	2	10	247151	247160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016513	TCAAT	2	10	259985	259994	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016513	TGCCA	2	10	260444	260453	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_016513	ACGCA	2	10	261094	261103	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016513	GTTTG	2	10	261189	261198	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016513	CAAAT	2	10	261430	261439	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016513	TGCAG	2	10	266081	266090	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016513	TTTTC	2	10	266156	266165	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016513	ATTTT	2	10	268170	268179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016513	CTTTT	2	10	283514	283523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016513	AAGCA	2	10	300064	300073	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016513	TAAGT	2	10	300444	300453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016513	CCTTG	2	10	311744	311753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016513	ATAAA	2	10	331394	331403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016513	AAAAT	2	10	337690	337699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016513	AAGGA	2	10	362562	362571	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016513	ACAAA	2	10	378620	378629	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016513	TTTAT	2	10	378669	378678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016513	TTTTA	2	10	382450	382459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016513	GATAA	2	10	384408	384417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016513	ACTTA	2	10	384442	384451	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016513	AAAAT	2	10	387168	387177	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016513	TTCCT	2	10	391856	391865	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016513	TTTAA	2	10	391974	391983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016513	CTAAC	2	10	393510	393519	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016513	CGACT	2	10	393964	393973	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016513	TCGGT	2	10	394339	394348	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016513	CTCAT	2	10	396765	396774	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016513	TTCAA	2	10	396989	396998	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016513	TCACA	2	10	406487	406496	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016513	GAATG	2	10	433658	433667	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016513	ACAAA	2	10	440519	440528	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016513	CAGGG	2	10	444369	444378	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016513	CTAAA	2	10	445298	445307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016513	AATAG	2	10	453034	453043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016513	GTAAT	2	10	454425	454434	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016513	ACAAA	2	10	462827	462836	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016513	TAGGC	2	10	471270	471279	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016513	CTTTT	2	10	472043	472052	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016513	TATTG	2	10	472101	472110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016513	TTTTC	2	10	472118	472127	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016513	ATTAT	2	10	486457	486466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016513	TAAAA	2	10	502744	502753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016513	AGCGA	2	10	508172	508181	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016513	AACAG	2	10	540264	540273	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016513	TTCCT	2	10	541848	541857	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016513	TTTAA	2	10	541965	541974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016513	CTAAC	2	10	543501	543510	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016513	CGACT	2	10	543955	543964	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016513	TCGGT	2	10	544330	544339	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016513	TTAAA	2	10	545153	545162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016513	CTCAT	2	10	546756	546765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016513	TTCAA	2	10	546980	546989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016513	GATAT	2	10	558691	558700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016513	ATTAA	2	10	559004	559013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016513	GGTAG	2	10	560720	560729	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016513	ACAGC	2	10	561565	561574	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016513	AGTTA	2	10	565134	565143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016513	TAGTA	2	10	568240	568249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016513	TAAAA	2	10	589464	589473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016513	AAAAT	2	10	590378	590387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016513	ATTAC	2	10	593882	593891	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016513	TTTTA	2	10	595506	595515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016513	AACTT	2	10	596346	596355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016513	ATTTT	2	10	626033	626042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016513	AAATA	2	10	636790	636799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016513	AAAAG	2	10	658879	658888	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016513	ATTCA	2	10	668975	668984	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016513	CAAGC	2	10	674088	674097	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016513	TTGAA	2	10	685465	685474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016513	TAGGC	2	10	697774	697783	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016513	AATGA	2	10	697805	697814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016513	ACCCG	2	10	702466	702475	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_016513	GTTAA	2	10	711802	711811	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016513	TTGAT	2	10	724454	724463	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016513	AATTT	2	10	727273	727282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016513	AACGC	2	10	730254	730263	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016513	TAAAA	2	10	730717	730726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016513	CATTC	2	10	731366	731375	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016513	AAGGA	2	10	733912	733921	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016513	TTCCT	2	10	734309	734318	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_016513	TTTAA	2	10	734426	734435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016513	CTAAC	2	10	735962	735971	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_016513	CGACT	2	10	736416	736425	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016513	TCGGT	2	10	736791	736800	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016513	TTAAA	2	10	737614	737623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016513	CTCAT	2	10	739217	739226	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016513	TTCAA	2	10	739441	739450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016513	TTAAA	2	10	755838	755847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016513	CTTTT	2	10	761182	761191	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016513	ATGTG	2	10	783633	783642	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016513	ATTTA	2	10	788226	788235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016513	AAAGG	2	10	811229	811238	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016513	CATTA	2	10	816802	816811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016513	CTAAT	2	10	817677	817686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016513	TGCAA	2	10	820551	820560	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016513	GTTTT	2	10	826510	826519	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016513	ATTGA	2	10	832628	832637	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016513	CAACA	2	10	833254	833263	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016513	AGAAA	2	10	863818	863827	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016513	ATTCG	2	10	886551	886560	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016513	TCGCT	2	10	905770	905779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_016513	TTATC	2	10	911966	911975	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016513	CAGTG	2	10	916428	916437	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016513	AAAGC	2	10	916462	916471	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016513	TAAAA	2	10	938238	938247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016513	AACAG	2	10	939743	939752	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016513	TTATC	2	10	940237	940246	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016513	ATTTC	2	10	942475	942484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016513	TATGC	2	10	943602	943611	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016513	TCAAG	2	10	950115	950124	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_016513	TAAAA	2	10	966253	966262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016513	GAAAA	2	10	967734	967743	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016513	ATCAT	2	10	980199	980208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_016513	ATTAT	2	10	984351	984360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_016513	TTTGA	2	10	987330	987339	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_016513	AAAAT	2	10	993676	993685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016513	CATAT	2	10	994948	994957	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_016513	TTATT	2	10	1026105	1026114	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_016513	TTTTG	2	10	1094450	1094459	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016513	TTGAA	2	10	1171389	1171398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_016513	ATGAG	2	10	1171613	1171622	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_016513	AGGAA	2	10	1176704	1176713	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_016513	TAATC	2	10	1227608	1227617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_016513	TCGGC	2	10	1240859	1240868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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320	NC_016513	ACCTG	2	10	1954078	1954087	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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331	NC_016513	CTAAA	2	10	2068641	2068650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
332	NC_016513	TCAAA	2	10	2069771	2069780	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
333	NC_016513	ATAAA	2	10	2074826	2074835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_016513	CTAAT	2	10	2079919	2079928	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
335	NC_016513	CTTTT	2	10	2085613	2085622	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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338	NC_016513	ATTTT	2	10	2093346	2093355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
339	NC_016513	ATACA	2	10	2095745	2095754	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
340	NC_016513	TTTTC	2	10	2099755	2099764	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
341	NC_016513	ATTTA	2	10	2101896	2101905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_016513	AACCA	2	10	2115426	2115435	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
343	NC_016513	GTATT	2	10	2116352	2116361	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
344	NC_016513	ATTGA	2	10	2120102	2120111	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.