MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016077	CGGAGC	2	12	18036	18047	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016077	CTGAGG	2	12	18923	18934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016077	TGAAAT	2	12	19425	19436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016077	TCCTTT	2	12	25264	25275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016077	TTTCCC	2	12	70022	70033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016077	AATATT	2	12	87660	87671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016077	CGGAGC	2	12	122874	122885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016077	CTGAGG	2	12	123761	123772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016077	TGAAAT	2	12	124263	124274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016077	AACGGT	2	12	139939	139950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016077	TTTTGG	2	12	206732	206743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016077	TAAAAA	2	12	230112	230123	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016077	TAGGAA	2	12	272521	272532	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016077	GTCTTT	2	12	282387	282398	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016077	GGAGAA	2	12	301225	301236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016077	GATGCG	2	12	308707	308718	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016077	CGGAGC	2	12	393851	393862	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016077	CTGAGG	2	12	394738	394749	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016077	TGAAAT	2	12	395240	395251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016077	AAGTGA	2	12	396667	396678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016077	GAAAAA	2	12	454001	454012	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016077	ATGAAA	2	12	480125	480136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016077	AAAGGG	2	12	506036	506047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016077	TTTCTC	2	12	519040	519051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016077	GAAGAC	2	12	522923	522934	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016077	AAGCAA	2	12	579948	579959	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016077	ACGGAT	2	12	598028	598039	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016077	AAAAGA	2	12	617044	617055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016077	TCCCTT	2	12	735869	735880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016077	CTACGT	2	12	740463	740474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016077	ATGAAA	2	12	752029	752040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016077	CTACGT	2	12	756372	756383	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016077	GTGAAT	2	12	758354	758365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016077	ATACGA	2	12	769576	769587	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016077	CTTTTT	2	12	790686	790697	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016077	CTTGCT	2	12	792749	792760	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016077	ATTTTC	2	12	903019	903030	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016077	TCTTTT	2	12	906576	906587	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016077	ATATAA	2	12	943122	943133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016077	CCTTTT	2	12	993821	993832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016077	TAAAAA	2	12	1000219	1000230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016077	CATTGA	2	12	1011187	1011198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016077	ACCTTC	2	12	1012952	1012963	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016077	CTCCCT	2	12	1017168	1017179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016077	TCATAA	2	12	1018995	1019006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016077	AGGAAG	2	12	1042583	1042594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016077	AATGCG	2	12	1052284	1052295	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016077	GGAGCA	2	12	1156568	1156579	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016077	CTTTTT	2	12	1261149	1261160	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016077	GCAATT	2	12	1266468	1266479	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016077	ATTAAT	2	12	1310466	1310477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016077	AAGGCT	2	12	1313782	1313793	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016077	GACGGT	2	12	1314078	1314089	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016077	GTATCA	2	12	1333688	1333699	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016077	AATCAC	2	12	1336245	1336256	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016077	TTATTT	2	12	1345163	1345174	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016077	CAAGTG	2	12	1346213	1346224	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016077	ACAACT	2	12	1382898	1382909	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016077	CAAAAT	2	12	1394809	1394820	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016077	AAACAT	2	12	1396716	1396727	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016077	CGGTTG	2	12	1415969	1415980	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016077	TATTTT	2	12	1427786	1427797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016077	GGGAAA	2	12	1499119	1499130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016077	TTTTTG	2	12	1512172	1512183	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016077	AAGGAT	2	12	1520550	1520561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016077	CTTTTT	2	12	1532832	1532843	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016077	TAGATT	2	12	1549622	1549633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016077	AACGAA	2	12	1563452	1563463	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016077	TTTTTC	2	12	1565969	1565980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016077	CAAAAA	2	12	1567004	1567015	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016077	TTATAT	2	12	1570160	1570171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016077	CTTTTT	2	12	1571997	1572008	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016077	CAATTT	2	12	1581214	1581225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016077	ATTTTT	2	12	1583138	1583149	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016077	CTTCCT	2	12	1590938	1590949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016077	TTCAGG	2	12	1607285	1607296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016077	AGCAAA	2	12	1687845	1687856	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016077	CTTTTA	2	12	1715222	1715233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016077	GAAACT	2	12	1779326	1779337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016077	TAGGTA	2	12	1818268	1818279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016077	GTCAAT	2	12	1834635	1834646	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016077	ATTCCC	2	12	1859874	1859885	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016077	TAAAAT	2	12	1871117	1871128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016077	AGAAAA	2	12	1877068	1877079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016077	TATAAA	2	12	1899151	1899162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016077	CAGTTG	2	12	1916869	1916880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016077	CCTTCA	2	12	1917107	1917118	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016077	GCATGG	2	12	2002198	2002209	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016077	GCTTTC	2	12	2031329	2031340	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016077	GAAAAT	2	12	2044827	2044838	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016077	ATATTT	2	12	2055364	2055375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016077	TTATTC	2	12	2055432	2055443	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016077	TCCTTT	2	12	2057693	2057704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016077	GGAGAC	2	12	2059600	2059611	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016077	ACGGGG	2	12	2060419	2060430	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016077	GGAAAA	2	12	2062487	2062498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016077	TGCAGA	2	12	2073746	2073757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016077	TAGAAT	2	12	2080932	2080943	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016077	TTCGAC	2	12	2106029	2106040	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016077	AGTAAA	2	12	2117312	2117323	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016077	TTATAT	2	12	2119363	2119374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016077	AATAGG	2	12	2134244	2134255	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016077	TTTAGG	2	12	2140225	2140236	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016077	CTACGT	2	12	2159032	2159043	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016077	TCTATA	2	12	2159886	2159897	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016077	AAAGAA	2	12	2193791	2193802	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016077	TTTTTA	2	12	2226934	2226945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016077	TATCTA	2	12	2242978	2242989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016077	GCACGG	2	12	2252567	2252578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016077	AAAAAT	2	12	2263995	2264006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016077	TAATCA	2	12	2281399	2281410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016077	TAAAAA	2	12	2293475	2293486	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016077	TATTTT	2	12	2301769	2301780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016077	GACAAA	2	12	2422598	2422609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016077	ACCGAA	2	12	2424579	2424590	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016077	TTGTTC	2	12	2474821	2474832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016077	TCCTTT	2	12	2487513	2487524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.