MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015942	AGACGG	2	12	1481222	1481233	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3502	NC_015942	CCA	2	6	1481237	1481242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_015942	GAC	2	6	1481260	1481265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_015942	CACAT	2	10	1481604	1481613	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3505	NC_015942	CA	3	6	1481631	1481636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_015942	CTTT	2	8	1481679	1481686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_015942	GA	3	6	1483117	1483122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_015942	TGGG	2	8	1483133	1483140	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_015942	GTCTTG	2	12	1483273	1483284	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3510	NC_015942	GATT	2	8	1483349	1483356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_015942	GGA	2	6	1483413	1483418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_015942	AGC	2	6	1483450	1483455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_015942	TGG	2	6	1483522	1483527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_015942	GAAG	2	8	1483544	1483551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_015942	GAT	2	6	1483557	1483562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_015942	GGCTGC	2	12	1483653	1483664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_015942	CTT	2	6	1483808	1483813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_015942	AGT	2	6	1483952	1483957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_015942	CCAC	2	8	1483981	1483988	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3520	NC_015942	ACCG	2	8	1484031	1484038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_015942	GCC	2	6	1484046	1484051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_015942	AT	3	6	1484199	1484204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_015942	ACA	2	6	1484205	1484210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_015942	TCAA	2	8	1484369	1484376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_015942	GC	3	6	1484419	1484424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_015942	CCA	2	6	1484435	1484440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_015942	GCT	2	6	1484461	1484466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_015942	TGTA	2	8	1484471	1484478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015942	AGC	2	6	1484485	1484490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_015942	TAC	2	6	1484499	1484504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_015942	GCTG	2	8	1484531	1484538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_015942	GT	3	6	1484609	1484614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_015942	CAC	2	6	1484618	1484623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_015942	GGT	2	6	1484732	1484737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_015942	TTCCG	2	10	1484760	1484769	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3536	NC_015942	CCG	2	6	1484794	1484799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_015942	TAT	2	6	1484838	1484843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_015942	GCA	2	6	1484883	1484888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_015942	CTGCC	2	10	1484936	1484945	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3540	NC_015942	GCA	2	6	1484967	1484972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_015942	CATC	2	8	1485033	1485040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_015942	CGTT	2	8	1485102	1485109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_015942	AGA	2	6	1485114	1485119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_015942	CGC	2	6	1485193	1485198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_015942	ACC	2	6	1486079	1486084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_015942	TGG	2	6	1486102	1486107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_015942	CAT	2	6	1486116	1486121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_015942	AGC	2	6	1486192	1486197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_015942	GCT	2	6	1486221	1486226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_015942	TATG	2	8	1486241	1486248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015942	TGT	2	6	1486271	1486276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_015942	CACAG	2	10	1486302	1486311	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3553	NC_015942	GA	3	6	1487069	1487074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_015942	GC	3	6	1488850	1488855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_015942	GCA	2	6	1488991	1488996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_015942	CGC	2	6	1489211	1489216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_015942	AGC	2	6	1489226	1489231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_015942	TGG	2	6	1489264	1489269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_015942	ACC	2	6	1489275	1489280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_015942	GCG	2	6	1489406	1489411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_015942	GTG	2	6	1489497	1489502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015942	C	6	6	1489646	1489651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3563	NC_015942	GA	3	6	1489694	1489699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015942	TCA	2	6	1489762	1489767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_015942	CCA	2	6	1489880	1489885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_015942	TG	3	6	1490041	1490046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015942	GTC	2	6	1491157	1491162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_015942	GTT	2	6	1491211	1491216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_015942	AT	4	8	1491219	1491226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015942	CAA	2	6	1491625	1491630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_015942	CGC	2	6	1491698	1491703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_015942	ACT	2	6	1492566	1492571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_015942	GTG	2	6	1492589	1492594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_015942	CCG	2	6	1493490	1493495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_015942	CACC	2	8	1494197	1494204	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3576	NC_015942	GAG	2	6	1494714	1494719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_015942	TCA	2	6	1495979	1495984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_015942	ACA	2	6	1496009	1496014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_015942	GAG	2	6	1497209	1497214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_015942	T	8	8	1498508	1498515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_015942	TTG	2	6	1498549	1498554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_015942	GATA	2	8	1498590	1498597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_015942	CGC	2	6	1498662	1498667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_015942	ATC	2	6	1498676	1498681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_015942	AGG	2	6	1498716	1498721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_015942	CAG	2	6	1498785	1498790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_015942	CTGCG	2	10	1498823	1498832	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3588	NC_015942	CTG	2	6	1498846	1498851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_015942	GTT	2	6	1498878	1498883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_015942	CTG	2	6	1498981	1498986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_015942	AAT	2	6	1499014	1499019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_015942	TCA	2	6	1499037	1499042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_015942	GAT	2	6	1499062	1499067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_015942	CTGGCC	2	12	1499082	1499093	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_015942	ATC	2	6	1499207	1499212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_015942	TGC	2	6	1499237	1499242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_015942	TGC	2	6	1499250	1499255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_015942	CCG	2	6	1501964	1501969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_015942	TGAT	2	8	1502002	1502009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_015942	CCA	2	6	1502099	1502104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_015942	GATTT	2	10	1502108	1502117	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_015942	TC	3	6	1502124	1502129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_015942	AACA	2	8	1502131	1502138	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_015942	TA	3	6	1502599	1502604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_015942	CTG	2	6	1502654	1502659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_015942	CTC	2	6	1503176	1503181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_015942	GAAGC	2	10	1503198	1503207	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3608	NC_015942	TCG	2	6	1503215	1503220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_015942	CCCA	2	8	1503242	1503249	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3610	NC_015942	T	6	6	1503361	1503366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_015942	TGGC	2	8	1503450	1503457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_015942	TTG	2	6	1503526	1503531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_015942	GCA	2	6	1503568	1503573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_015942	CAAGT	2	10	1503579	1503588	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3615	NC_015942	AGC	2	6	1503747	1503752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_015942	GATA	2	8	1504153	1504160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_015942	AT	3	6	1504166	1504171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_015942	GCT	2	6	1504176	1504181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_015942	AT	3	6	1504185	1504190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_015942	GTCT	2	8	1504574	1504581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_015942	TAA	2	6	1504591	1504596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_015942	GC	3	6	1504608	1504613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_015942	ACC	2	6	1504623	1504628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_015942	GAT	2	6	1504678	1504683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_015942	AAC	2	6	1504699	1504704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_015942	GCC	2	6	1504718	1504723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_015942	GGCTT	2	10	1504839	1504848	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3628	NC_015942	CTT	2	6	1504876	1504881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_015942	AATAA	2	10	1506506	1506515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_015942	TA	3	6	1506517	1506522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_015942	AGA	2	6	1506529	1506534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_015942	ACC	2	6	1506617	1506622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3633	NC_015942	ATG	2	6	1506635	1506640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3759	NC_015942	CT	3	6	1561940	1561945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3760	NC_015942	GA	3	6	1561967	1561972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3762	NC_015942	G	6	6	1563903	1563908	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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