MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015942	GCGG	2	8	2340304	2340311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_015942	GCTG	2	8	2340342	2340349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_015942	ATCC	2	8	2340561	2340568	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_015942	TCC	2	6	2340598	2340603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_015942	G	6	6	2340618	2340623	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_015942	ATG	2	6	2340625	2340630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_015942	ATC	2	6	2340651	2340656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_015942	AGC	2	6	2340703	2340708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_015942	CCG	2	6	2340789	2340794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_015942	GC	3	6	2340810	2340815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_015942	CAA	2	6	2340816	2340821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_015942	GCT	2	6	2340833	2340838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_015942	GAA	2	6	2340954	2340959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_015942	AAT	2	6	2340978	2340983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_015942	T	6	6	2341028	2341033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_015942	TTG	2	6	2341036	2341041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_015942	ATG	2	6	2341045	2341050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_015942	GCG	2	6	2341065	2341070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_015942	CAT	2	6	2341082	2341087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_015942	CAA	2	6	2341163	2341168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_015942	CTGGAA	2	12	2341190	2341201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5522	NC_015942	A	7	7	2341200	2341206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015942	GGGT	2	8	2341238	2341245	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_015942	GCG	2	6	2341298	2341303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_015942	GTGTG	2	10	2341320	2341329	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_015942	CTG	2	6	2341339	2341344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_015942	G	7	7	2341409	2341415	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_015942	ATC	2	6	2341420	2341425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_015942	CGA	2	6	2341437	2341442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_015942	GAAGC	2	10	2341471	2341480	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5531	NC_015942	TCTG	2	8	2341485	2341492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_015942	TGC	2	6	2341569	2341574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_015942	CA	3	6	2341632	2341637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_015942	CTG	2	6	2341638	2341643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_015942	GCG	2	6	2341737	2341742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_015942	GTTG	2	8	2341772	2341779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_015942	CGGA	2	8	2341849	2341856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5538	NC_015942	GC	3	6	2341899	2341904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_015942	GGC	2	6	2341916	2341921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_015942	TCC	2	6	2341950	2341955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_015942	G	6	6	2342051	2342056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_015942	ACT	2	6	2342066	2342071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_015942	AGG	2	6	2342092	2342097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_015942	CTG	2	6	2342145	2342150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_015942	GCA	2	6	2342184	2342189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_015942	TGG	2	6	2342219	2342224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_015942	CTG	2	6	2342229	2342234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_015942	ATA	2	6	2342287	2342292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_015942	AAT	2	6	2343368	2343373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_015942	T	8	8	2343381	2343388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_015942	ACAA	2	8	2343422	2343429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_015942	CAGA	2	8	2343430	2343437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5553	NC_015942	CTA	2	6	2343490	2343495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_015942	AT	3	6	2344601	2344606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_015942	TGA	2	6	2344642	2344647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_015942	TATG	2	8	2344655	2344662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_015942	AT	4	8	2344718	2344725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_015942	TTA	2	6	2345723	2345728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_015942	GAACAA	2	12	2345784	2345795	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5560	NC_015942	A	6	6	2345799	2345804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_015942	ATT	2	6	2345816	2345821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_015942	TCT	2	6	2345824	2345829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_015942	CAT	2	6	2345868	2345873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_015942	ATT	2	6	2345881	2345886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_015942	TCA	2	6	2345953	2345958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_015942	CGC	2	6	2346078	2346083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_015942	GTGG	2	8	2346100	2346107	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_015942	ACG	2	6	2346131	2346136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_015942	TTC	2	6	2346161	2346166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_015942	TAT	2	6	2346202	2346207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_015942	GCTG	2	8	2346235	2346242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_015942	TA	3	6	2346246	2346251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_015942	T	7	7	2346331	2346337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_015942	GTT	2	6	2346451	2346456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_015942	GCC	2	6	2346462	2346467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_015942	ATA	2	6	2346469	2346474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_015942	TA	3	6	2346646	2346651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_015942	AAT	2	6	2346763	2346768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_015942	AT	3	6	2346828	2346833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_015942	CAG	2	6	2346847	2346852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_015942	AAT	2	6	2346867	2346872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_015942	CGC	2	6	2347033	2347038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_015942	TCG	2	6	2347051	2347056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_015942	TCA	2	6	2347058	2347063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_015942	ACC	2	6	2347101	2347106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_015942	TCC	2	6	2347191	2347196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_015942	A	7	7	2347206	2347212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_015942	GGC	2	6	2347214	2347219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_015942	CAC	2	6	2347281	2347286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_015942	CGC	2	6	2347336	2347341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_015942	AT	3	6	2347475	2347480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_015942	AAT	2	6	2348070	2348075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015942	ACGT	2	8	2348095	2348102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5594	NC_015942	TCA	2	6	2348136	2348141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_015942	CAG	2	6	2349722	2349727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_015942	A	6	6	2349745	2349750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_015942	CAA	2	6	2349766	2349771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_015942	TCT	2	6	2349781	2349786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_015942	CG	3	6	2349787	2349792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_015942	G	6	6	2349852	2349857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_015942	GTG	2	6	2349876	2349881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015942	CAA	2	6	2349882	2349887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_015942	GCA	2	6	2349909	2349914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_015942	TCG	2	6	2349962	2349967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_015942	GGC	2	6	2350022	2350027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_015942	GGGT	2	8	2350037	2350044	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_015942	AGA	2	6	2350114	2350119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_015942	CTTG	2	8	2350178	2350185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_015942	AGG	2	6	2350237	2350242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_015942	TTG	2	6	2351294	2351299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_015942	CAA	2	6	2351305	2351310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_015942	AGA	2	6	2351404	2351409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_015942	CGG	2	6	2351422	2351427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_015942	TCA	2	6	2351431	2351436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_015942	CAG	2	6	2351441	2351446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_015942	GAG	2	6	2351661	2351666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_015942	TGC	2	6	2351727	2351732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_015942	ATT	2	6	2351738	2351743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_015942	CCA	2	6	2351750	2351755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_015942	CGA	2	6	2351871	2351876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_015942	TCG	2	6	2351883	2351888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_015942	CCGGA	2	10	2351909	2351918	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5623	NC_015942	CGA	2	6	2351944	2351949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_015942	AG	3	6	2351991	2351996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_015942	TGG	2	6	2352003	2352008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_015942	CGG	2	6	2352077	2352082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_015942	AGC	2	6	2352093	2352098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_015942	GCA	2	6	2352142	2352147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_015942	GCC	2	6	2352163	2352168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5630	NC_015942	CAG	2	6	2352188	2352193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5756	NC_015942	AT	3	6	2425462	2425467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5757	NC_015942	GTG	2	6	2425485	2425490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5758	NC_015942	GAGAG	2	10	2427060	2427069	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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5760	NC_015942	TGC	2	6	2427141	2427146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5761	NC_015942	GGA	2	6	2427191	2427196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5878	NC_015942	T	7	7	2513852	2513858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5879	NC_015942	GGCA	2	8	2513931	2513938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5882	NC_015942	CGA	2	6	2515669	2515674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5896	NC_015942	CGA	2	6	2517451	2517456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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