MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015850	TTC	2	6	185407	185412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015850	AT	3	6	185480	185485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015850	CAAT	2	8	185519	185526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_015850	TAA	2	6	185568	185573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015850	TA	3	6	185575	185580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015850	AATA	2	8	185585	185592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015850	AAT	2	6	185614	185619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015850	CTC	2	6	185792	185797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_015850	TGG	2	6	185993	185998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015850	GA	3	6	186018	186023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015850	GCT	2	6	186025	186030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015850	ACCGG	2	10	186035	186044	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
513	NC_015850	CAG	2	6	186053	186058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015850	CAA	2	6	186074	186079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015850	GCA	2	6	186084	186089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015850	ATCCG	2	10	186206	186215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
517	NC_015850	TCC	2	6	186247	186252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_015850	CAG	2	6	186258	186263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015850	AC	4	8	186281	186288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_015850	GAG	2	6	186315	186320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015850	AC	3	6	186348	186353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_015850	TGA	2	6	190287	190292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015850	CGT	2	6	190353	190358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015850	GCA	2	6	190581	190586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015850	CTG	2	6	190608	190613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015850	CTC	2	6	190617	190622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_015850	GA	3	6	190641	190646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015850	GGC	2	6	190696	190701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015850	AGGG	2	8	190740	190747	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015850	GCG	2	6	192492	192497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015850	TCATGC	2	12	192586	192597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015850	G	6	6	192628	192633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015850	GT	3	6	192663	192668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015850	CCG	2	6	192730	192735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_015850	TGT	2	6	192762	192767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015850	ACC	2	6	192810	192815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_015850	TGA	2	6	192843	192848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015850	TGCC	2	8	192866	192873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
539	NC_015850	ATG	2	6	192926	192931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015850	CG	3	6	192954	192959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_015850	A	7	7	193014	193020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015850	AC	3	6	193058	193063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_015850	AT	3	6	194431	194436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015850	CTT	2	6	194447	194452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015850	AGCC	2	8	194501	194508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_015850	TAGT	2	8	194514	194521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015850	CGG	2	6	194531	194536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015850	CCGG	2	8	195321	195328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_015850	CCA	2	6	195339	195344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_015850	A	7	7	195346	195352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015850	GA	3	6	197429	197434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015850	CTG	2	6	197554	197559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015850	GTC	3	9	197584	197592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_015850	CT	3	6	197745	197750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_015850	TTG	2	6	197778	197783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015850	GC	3	6	197849	197854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_015850	GCA	2	6	197862	197867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015850	CAAC	2	8	197878	197885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_015850	GCC	2	6	197941	197946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_015850	TA	3	6	197959	197964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015850	CGG	2	6	198022	198027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015850	CGC	2	6	198036	198041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_015850	CCT	2	6	198046	198051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_015850	CGA	2	6	198083	198088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015850	GGT	2	6	198094	198099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015850	GCA	2	6	198117	198122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015850	CT	3	6	198137	198142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_015850	GCG	2	6	202418	202423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_015850	TA	3	6	202442	202447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015850	CGTT	2	8	203556	203563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
571	NC_015850	GCA	2	6	205858	205863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_015850	CA	3	6	205870	205875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_015850	AAG	2	6	208004	208009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015850	A	6	6	208063	208068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015850	TCT	2	6	208076	208081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015850	TCA	2	6	208183	208188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015850	AG	3	6	208190	208195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015850	ACC	2	6	208273	208278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_015850	GTT	2	6	208347	208352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015850	CAC	2	6	208448	208453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_015850	GGA	2	6	209667	209672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015850	CCA	2	6	209748	209753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_015850	GGC	2	6	209758	209763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015850	AG	3	6	212305	212310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015850	CGG	2	6	212416	212421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015850	GACA	2	8	212431	212438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_015850	CGC	2	6	212463	212468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_015850	TGT	2	6	212473	212478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015850	TG	3	6	212484	212489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015850	TTC	2	6	212493	212498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015850	CCA	2	6	212540	212545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_015850	TCT	2	6	212595	212600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015850	TGT	2	6	212632	212637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015850	TC	3	6	212669	212674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_015850	GAC	2	6	212700	212705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015850	GC	3	6	212756	212761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_015850	CAG	2	6	212770	212775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015850	CCTG	2	8	212791	212798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_015850	GCAC	2	8	212814	212821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
600	NC_015850	AG	3	6	214953	214958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015850	GAC	2	6	220145	220150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015850	A	7	7	220175	220181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015850	TCC	2	6	220191	220196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_015850	CCTA	2	8	221996	222003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_015850	TGAG	2	8	222078	222085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015850	GTT	2	6	223147	223152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015850	ACC	2	6	223240	223245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_015850	T	6	6	223248	223253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015850	TTG	2	6	223338	223343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015850	TGC	2	6	223431	223436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015850	GA	3	6	223504	223509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015850	TAT	2	6	223521	223526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015850	CAA	2	6	223599	223604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015850	GC	3	6	223914	223919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_015850	TACA	2	8	223939	223946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_015850	TCC	2	6	226663	226668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_015850	TA	3	6	226683	226688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015850	CAG	2	6	226715	226720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015850	TCT	2	6	226727	226732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015850	CAA	2	6	226757	226762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015850	TGA	2	6	226804	226809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015850	CCG	2	6	226819	226824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_015850	AAT	2	6	226879	226884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015850	CAA	2	6	226913	226918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015850	ATT	2	6	226956	226961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015850	TAA	2	6	226970	226975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015850	ACC	2	6	226992	226997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_015850	ATT	2	6	227011	227016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015850	ATT	2	6	229810	229815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015850	GGC	2	6	229864	229869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015850	TCC	2	6	229871	229876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_015850	TG	3	6	230283	230288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015850	ATG	2	6	230294	230299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015850	CTA	2	6	231397	231402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015850	TG	4	8	231414	231421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015850	CAT	2	6	231486	231491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015850	GC	3	6	231511	231516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_015850	CGC	2	6	231575	231580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_015850	CAG	2	6	231678	231683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015850	TGC	2	6	231714	231719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_015850	ACG	2	6	231759	231764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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643	NC_015850	AAC	2	6	231849	231854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_015850	GTG	2	6	231861	231866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_015850	GC	4	8	232083	232090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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652	NC_015850	GAC	2	6	232202	232207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_015850	AAC	2	6	232227	232232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_015850	CGA	2	6	232272	232277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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656	NC_015850	CTGA	2	8	232341	232348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
657	NC_015850	CTGC	2	8	232383	232390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
658	NC_015850	TGG	2	6	232404	232409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
659	NC_015850	CAC	2	6	232434	232439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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662	NC_015850	CCG	2	6	232815	232820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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664	NC_015850	GTC	2	6	232945	232950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_015850	CGA	2	6	236359	236364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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675	NC_015850	GTA	2	6	236618	236623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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