MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015850	GCC	2	6	2387208	2387213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_015850	CGT	2	6	2394891	2394896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_015850	CG	3	6	2395348	2395353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_015850	CCG	2	6	2395356	2395361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_015850	AGG	2	6	2396771	2396776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_015850	CTA	2	6	2397226	2397231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_015850	CAGC	2	8	2397242	2397249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_015850	GA	3	6	2397278	2397283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_015850	TC	3	6	2397294	2397299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_015850	GAG	2	6	2397307	2397312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_015850	TGT	2	6	2398684	2398689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_015850	CTT	2	6	2398697	2398702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_015850	ATC	2	6	2398788	2398793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_015850	GCG	2	6	2398826	2398831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_015850	A	6	6	2398849	2398854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_015850	TGGG	2	8	2398879	2398886	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_015850	TCC	2	6	2400033	2400038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_015850	GC	3	6	2403376	2403381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_015850	TGC	2	6	2403423	2403428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_015850	CCT	2	6	2403877	2403882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_015850	ACCG	2	8	2404785	2404792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_015850	A	8	8	2404795	2404802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015850	TC	3	6	2408344	2408349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_015850	CTC	2	6	2410431	2410436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_015850	TGAC	2	8	2411269	2411276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_015850	TTG	2	6	2411336	2411341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_015850	CAC	2	6	2411759	2411764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_015850	CAC	2	6	2412809	2412814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_015850	CTG	2	6	2412826	2412831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_015850	TCC	2	6	2412836	2412841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_015850	CTG	2	6	2412874	2412879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_015850	TGC	2	6	2414560	2414565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_015850	TTC	2	6	2414594	2414599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_015850	CTCG	2	8	2417475	2417482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_015850	CGGG	2	8	2417494	2417501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5536	NC_015850	GGGT	2	8	2417532	2417539	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_015850	TAA	2	6	2417569	2417574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_015850	GC	3	6	2418533	2418538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_015850	GCGG	2	8	2420094	2420101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5540	NC_015850	CCG	2	6	2420119	2420124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_015850	TG	3	6	2421625	2421630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_015850	GC	3	6	2423077	2423082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_015850	CCG	2	6	2423101	2423106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_015850	CTT	2	6	2423113	2423118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_015850	TAG	2	6	2423214	2423219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_015850	GCA	2	6	2423284	2423289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_015850	AGA	2	6	2424624	2424629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_015850	GAG	2	6	2424660	2424665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_015850	CGAC	2	8	2425541	2425548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_015850	GAAG	2	8	2425577	2425584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_015850	AGT	2	6	2427877	2427882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_015850	T	8	8	2427921	2427928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_015850	GAG	2	6	2434659	2434664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_015850	CA	3	6	2436563	2436568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_015850	GCT	2	6	2436570	2436575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_015850	GCG	2	6	2438482	2438487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015850	AACT	2	8	2439011	2439018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_015850	TTCCG	2	10	2443032	2443041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5559	NC_015850	GC	3	6	2443426	2443431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_015850	CGC	2	6	2443475	2443480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_015850	TGC	2	6	2447005	2447010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_015850	GCA	2	6	2447011	2447016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_015850	GCT	2	6	2447081	2447086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_015850	GCCC	2	8	2447192	2447199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5565	NC_015850	GGT	2	6	2447210	2447215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_015850	TGT	3	9	2447251	2447259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_015850	GGT	2	6	2447282	2447287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_015850	CTGGC	2	10	2447337	2447346	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5569	NC_015850	CCA	2	6	2447486	2447491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_015850	GCG	2	6	2447518	2447523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_015850	CGT	2	6	2447618	2447623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_015850	CTG	2	6	2447658	2447663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_015850	GCA	2	6	2447677	2447682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_015850	ACG	2	6	2449019	2449024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_015850	GCCCC	2	10	2450425	2450434	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5576	NC_015850	CGG	2	6	2450435	2450440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_015850	T	7	7	2450444	2450450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_015850	TGC	2	6	2451930	2451935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_015850	GC	3	6	2451934	2451939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_015850	TTC	2	6	2454020	2454025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_015850	TC	3	6	2454059	2454064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_015850	CTTG	2	8	2454775	2454782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_015850	GC	3	6	2454783	2454788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_015850	ACG	2	6	2454792	2454797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_015850	GGC	2	6	2456492	2456497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_015850	TGA	2	6	2457402	2457407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_015850	CCTC	2	8	2457408	2457415	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5588	NC_015850	CAACG	2	10	2457447	2457456	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5589	NC_015850	AGT	2	6	2457478	2457483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_015850	AG	3	6	2457579	2457584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_015850	CAG	2	6	2457605	2457610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_015850	CCATCG	2	12	2457716	2457727	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_015850	GCTC	2	8	2457787	2457794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_015850	ACC	2	6	2457877	2457882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_015850	TTG	2	6	2460353	2460358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_015850	TCG	2	6	2460409	2460414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_015850	GCA	2	6	2460524	2460529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_015850	CAA	2	6	2460556	2460561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_015850	CGT	2	6	2460583	2460588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_015850	AAC	2	6	2460652	2460657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_015850	TAC	2	6	2460716	2460721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_015850	CAC	2	6	2463585	2463590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_015850	GCC	2	6	2463661	2463666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5604	NC_015850	GAGG	2	8	2463684	2463691	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_015850	GT	3	6	2464866	2464871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_015850	GC	3	6	2464889	2464894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_015850	TCT	2	6	2464967	2464972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_015850	GAG	2	6	2465109	2465114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_015850	GTG	2	6	2466084	2466089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_015850	AAT	2	6	2466102	2466107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_015850	CGG	2	6	2473622	2473627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_015850	T	6	6	2473676	2473681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_015850	CAG	2	6	2474517	2474522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_015850	TTCC	2	8	2474625	2474632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_015850	CGG	2	6	2476129	2476134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5619	NC_015850	GCAG	2	8	2476469	2476476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5622	NC_015850	CAC	2	6	2476514	2476519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_015850	AGC	2	6	2476555	2476560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_015850	CTC	2	6	2476568	2476573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_015850	CGT	2	6	2476592	2476597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_015850	GCC	2	6	2476731	2476736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_015850	CGT	2	6	2476819	2476824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_015850	TGG	2	6	2476825	2476830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_015850	CG	3	6	2476880	2476885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_015850	CAG	2	6	2476886	2476891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_015850	CGA	2	6	2476937	2476942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5632	NC_015850	CGG	2	6	2476981	2476986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_015850	CCA	2	6	2476999	2477004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5634	NC_015850	CCG	2	6	2477106	2477111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5635	NC_015850	CG	3	6	2477165	2477170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5636	NC_015850	GC	3	6	2477193	2477198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5637	NC_015850	CG	3	6	2477280	2477285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5652	NC_015850	TTA	2	6	2479703	2479708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5664	NC_015850	GAG	2	6	2480624	2480629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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