MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 3932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015518	TTA	2	6	504638	504643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015518	TTA	2	6	505232	505237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015518	TTC	2	6	505251	505256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015518	AAT	2	6	511366	511371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015518	CAA	2	6	512502	512507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_015518	TAT	2	6	512576	512581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015518	AAT	2	6	512588	512593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015518	CTT	2	6	517545	517550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_015518	CAA	2	6	517553	517558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015518	GAA	2	6	518016	518021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015518	TAT	2	6	518518	518523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015518	TGA	2	6	521567	521572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015518	ATG	2	6	521595	521600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015518	ATA	2	6	523351	523356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015518	ACT	2	6	523360	523365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_015518	GAA	2	6	529333	529338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015518	CTA	2	6	529341	529346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015518	TCA	2	6	529355	529360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015518	TAA	2	6	533334	533339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015518	TAA	2	6	534632	534637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015518	TAT	2	6	536432	536437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015518	TAA	2	6	536852	536857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015518	CTT	2	6	536916	536921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015518	CTC	2	6	536953	536958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_015518	AGC	2	6	536979	536984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015518	TGG	2	6	537090	537095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015518	GAG	2	6	537127	537132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015518	ATA	3	9	537194	537202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015518	GCC	3	9	537318	537326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_015518	TAA	2	6	537438	537443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015518	TAA	2	6	538439	538444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015518	ATA	2	6	542178	542183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015518	TAT	2	6	542193	542198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015518	CAT	2	6	545602	545607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015518	CAT	2	6	545634	545639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015518	TAT	2	6	545646	545651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015518	ATA	2	6	559711	559716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015518	TAA	2	6	559718	559723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015518	AAG	2	6	560687	560692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015518	ATT	2	6	566028	566033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015518	CAA	2	6	566037	566042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_015518	TAA	2	6	566311	566316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015518	TAT	2	6	566363	566368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015518	TGG	2	6	566392	566397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015518	ACT	2	6	566620	566625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015518	ATC	2	6	566628	566633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_015518	TCC	3	9	567118	567126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_015518	ATT	2	6	567271	567276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015518	TCA	2	6	567379	567384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015518	TCA	2	6	567421	567426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015518	ATC	2	6	567549	567554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015518	GCG	2	6	567696	567701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015518	TGA	2	6	567783	567788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015518	TTA	2	6	569616	569621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015518	TTA	2	6	570081	570086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015518	TAA	2	6	571341	571346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015518	TAC	2	6	580796	580801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_015518	TAA	2	6	580802	580807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015518	ACA	2	6	580874	580879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015518	CTA	2	6	582866	582871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015518	TCA	3	9	582955	582963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015518	ATT	2	6	595772	595777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015518	TAA	2	6	595804	595809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015518	AGA	2	6	600470	600475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015518	TCT	2	6	600536	600541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015518	TGA	2	6	600788	600793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015518	AGT	2	6	600794	600799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015518	TTA	2	6	600896	600901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015518	AAG	2	6	600909	600914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015518	GAA	2	6	601067	601072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015518	CGA	2	6	601241	601246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015518	ATG	2	6	601264	601269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015518	AAG	2	6	601270	601275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015518	TGA	2	6	601370	601375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015518	TCT	2	6	604088	604093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015518	ATT	2	6	604177	604182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015518	GAA	2	6	604203	604208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015518	ATA	2	6	605864	605869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015518	ATA	2	6	605905	605910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015518	TAT	2	6	606300	606305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015518	TAT	2	6	606313	606318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015518	TTA	2	6	606319	606324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015518	TTA	2	6	606450	606455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015518	CTA	2	6	606477	606482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015518	ATC	2	6	606499	606504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_015518	TAA	3	9	606600	606608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015518	ATA	2	6	606745	606750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015518	GAC	2	6	606825	606830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_015518	AAG	2	6	608823	608828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015518	AAC	2	6	608835	608840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015518	TTA	2	6	611989	611994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015518	ATA	2	6	612212	612217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015518	CTT	2	6	612218	612223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_015518	TAA	2	6	612943	612948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015518	TCA	2	6	613015	613020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_015518	ATT	2	6	613052	613057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015518	AAG	2	6	616642	616647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015518	TGT	2	6	617906	617911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015518	TTC	2	6	618001	618006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_015518	TTA	2	6	618090	618095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015518	ATT	2	6	618102	618107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015518	TCC	2	6	618368	618373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_015518	ACC	2	6	618410	618415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_015518	ATT	2	6	618474	618479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015518	ATT	2	6	622744	622749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015518	ATA	2	6	627976	627981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015518	CTT	2	6	630079	630084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015518	GAT	2	6	630101	630106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015518	TAA	2	6	630129	630134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015518	TAA	2	6	634737	634742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015518	ATA	2	6	641014	641019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015518	GAC	2	6	642738	642743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_015518	CTT	2	6	644206	644211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015518	AAT	2	6	645285	645290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015518	AAT	2	6	648950	648955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015518	TAC	2	6	649993	649998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_015518	AAC	2	6	650033	650038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015518	TTA	2	6	650053	650058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015518	TCT	2	6	650059	650064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_015518	GAA	2	6	650133	650138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015518	TTA	2	6	650189	650194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015518	ACT	2	6	654689	654694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015518	AAT	2	6	654695	654700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015518	TCT	2	6	657161	657166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015518	AGT	2	6	657171	657176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015518	TCA	2	6	657271	657276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015518	ATT	2	6	657433	657438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015518	ATT	2	6	657466	657471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015518	ATT	2	6	658220	658225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015518	GAA	2	6	666721	666726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1132	NC_015518	TAC	2	6	671637	671642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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