MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 4208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015508	CG	3	6	283204	283209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_015508	TAAG	2	8	283237	283244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015508	TTAT	2	8	283354	283361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015508	GGC	2	6	285164	285169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015508	GCC	2	6	285173	285178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_015508	GGGA	2	8	286039	286046	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015508	GCG	2	6	286076	286081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015508	CGC	2	6	286109	286114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_015508	CTC	2	6	286932	286937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_015508	CCTG	2	8	286961	286968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
511	NC_015508	GGA	2	6	287050	287055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015508	TTAA	2	8	287872	287879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015508	GGA	2	6	287884	287889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015508	CGG	2	6	288902	288907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015508	GCC	2	6	288910	288915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_015508	GAT	2	6	291261	291266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015508	TCG	2	6	292053	292058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015508	GCT	2	6	292157	292162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015508	CAA	2	6	293283	293288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015508	CCA	2	6	293333	293338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_015508	GC	3	6	293468	293473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_015508	CAC	2	6	293603	293608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_015508	CAG	2	6	293658	293663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015508	TCA	2	6	293796	293801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015508	CCA	2	6	294840	294845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_015508	ACG	2	6	295066	295071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015508	GGC	2	6	295172	295177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015508	GCC	2	6	295203	295208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_015508	GATG	2	8	295231	295238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015508	GGCAA	2	10	295245	295254	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
531	NC_015508	CT	3	6	295375	295380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_015508	CCG	2	6	295402	295407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_015508	ACC	3	9	295408	295416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_015508	ATC	2	6	296516	296521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_015508	TGA	2	6	296536	296541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015508	GTTC	2	8	296569	296576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_015508	CGTT	2	8	296750	296757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_015508	GCG	2	6	296806	296811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015508	CGA	2	6	300655	300660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015508	C	8	8	300683	300690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
541	NC_015508	CACG	2	8	300804	300811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
542	NC_015508	CTG	2	6	301388	301393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015508	TCA	2	6	301439	301444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015508	GAC	2	6	301468	301473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015508	GGC	2	6	301486	301491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015508	ATC	2	6	301611	301616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015508	TTGA	2	8	301640	301647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015508	CAT	2	6	301648	301653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015508	CGAAAA	2	12	301716	301727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
550	NC_015508	ATC	2	6	302308	302313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015508	GCT	2	6	302325	302330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015508	GC	4	8	302402	302409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_015508	GCAG	2	8	302422	302429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
554	NC_015508	GAC	2	6	302453	302458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015508	CAC	3	9	302463	302471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_015508	GAT	2	6	302478	302483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015508	CAT	2	6	302573	302578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015508	ACA	2	6	302585	302590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015508	CAA	2	6	302643	302648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015508	TGC	2	6	302659	302664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015508	T	6	6	302689	302694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015508	GGC	2	6	302703	302708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015508	TGC	2	6	302718	302723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_015508	CAT	2	6	302751	302756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015508	AT	3	6	304034	304039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015508	ATT	2	6	304050	304055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015508	TTG	2	6	304113	304118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015508	ATC	2	6	304142	304147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_015508	A	6	6	305997	306002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015508	A	7	7	306013	306019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015508	TCC	2	6	306080	306085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_015508	GTC	2	6	306087	306092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015508	TA	3	6	306109	306114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015508	TCC	2	6	306233	306238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_015508	GCC	2	6	306250	306255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_015508	CGT	2	6	308143	308148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015508	CGG	2	6	308184	308189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015508	TATC	2	8	308210	308217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_015508	AGGGT	2	10	308226	308235	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015508	TGG	2	6	309419	309424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015508	CCTTTT	2	12	309604	309615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_015508	TCT	2	6	309624	309629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015508	CGGT	2	8	309732	309739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_015508	CGA	2	6	316721	316726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015508	GGC	2	6	316746	316751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015508	GAA	2	6	316754	316759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015508	GC	3	6	316780	316785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_015508	GC	4	8	316791	316798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_015508	ATA	2	6	316933	316938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015508	CTGG	2	8	316943	316950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_015508	GGCT	2	8	317012	317019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
592	NC_015508	GATG	2	8	320771	320778	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015508	AGT	2	6	320818	320823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015508	GCT	2	6	326986	326991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015508	GTAGC	2	10	327006	327015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
596	NC_015508	T	7	7	327062	327068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015508	TCA	2	6	327607	327612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015508	GAG	2	6	327623	327628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015508	TTC	2	6	327739	327744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015508	CCG	2	6	327771	327776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_015508	GATGC	2	10	327812	327821	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
602	NC_015508	GCTC	2	8	327829	327836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
603	NC_015508	GGC	2	6	328271	328276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015508	CAG	2	6	328281	328286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015508	ATCG	2	8	328725	328732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_015508	T	6	6	328778	328783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015508	TGC	2	6	328794	328799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015508	TCT	2	6	328827	328832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015508	GAA	2	6	328869	328874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015508	AGA	2	6	328899	328904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015508	A	7	7	328975	328981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015508	GCCT	2	8	329069	329076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_015508	G	6	6	329102	329107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015508	TGA	2	6	329142	329147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015508	ATCC	2	8	329367	329374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_015508	AAG	2	6	329424	329429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015508	AAGA	2	8	329472	329479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015508	GGA	2	6	329500	329505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015508	ATC	2	6	329537	329542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015508	A	6	6	329545	329550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015508	GA	3	6	329577	329582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015508	CCCG	2	8	330831	330838	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
623	NC_015508	TCC	2	6	332065	332070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_015508	TCC	2	6	332085	332090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_015508	GCG	2	6	332096	332101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015508	CGC	2	6	332148	332153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_015508	CCG	2	6	332206	332211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_015508	GAAA	2	8	332222	332229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015508	AG	3	6	332248	332253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015508	AGC	2	6	332271	332276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015508	CCAG	2	8	332281	332288	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
632	NC_015508	CCT	2	6	332780	332785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_015508	CAGG	2	8	332884	332891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_015508	CGG	2	6	333456	333461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015508	CGC	2	6	333550	333555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_015508	GCC	2	6	336171	336176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_015508	GGC	2	6	336188	336193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_015508	GA	3	6	336335	336340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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910	NC_015508	GCG	2	6	488258	488263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
911	NC_015508	GCAA	2	8	488328	488335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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