MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aerococcus urinae ACS-120-V-Col10a chromosome

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015278	AAATAG	2	12	4725	4736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015278	AAAATA	2	12	22369	22380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015278	GTCTCA	2	12	86919	86930	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015278	TGTAAG	2	12	95999	96010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015278	TACCAA	2	12	146866	146877	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015278	ATGGAG	2	12	148770	148781	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015278	GAGATA	2	12	149393	149404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015278	AGCAAA	2	12	150262	150273	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015278	AAAAAG	2	12	150837	150848	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015278	AGAACA	2	12	151497	151508	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015278	AAAGAA	2	12	151598	151609	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015278	TTTACA	2	12	154044	154055	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015278	AGATGA	2	12	154831	154842	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015278	CAAGAA	2	12	156667	156678	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015278	ATATGA	2	12	157780	157791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015278	TATGGA	2	12	159840	159851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015278	ATCCGA	2	12	160196	160207	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015278	TGGTGA	2	12	160802	160813	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015278	TGAAAA	2	12	161600	161611	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015278	TTCAAA	2	12	162548	162559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015278	CAAAGG	2	12	162988	162999	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015278	TGCCAG	2	12	164881	164892	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015278	AGGAGA	2	12	168201	168212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015278	GGTATG	2	12	171525	171536	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015278	GAATAG	2	12	173886	173897	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015278	TACAGG	2	12	174353	174364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015278	AAGTGA	2	12	178955	178966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015278	TGTCAA	2	12	189092	189103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015278	TAAAAA	2	12	216515	216526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015278	TGTGAA	2	12	222202	222213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015278	CGGATT	2	12	228846	228857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015278	TTGAAG	2	12	241075	241086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015278	TGCTAA	2	12	248128	248139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015278	GAAAAG	2	12	248592	248603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015278	TTATAA	2	12	252634	252645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015278	AGAAAA	2	12	315815	315826	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015278	GCTGTT	2	12	339476	339487	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015278	CACCAT	2	12	344296	344307	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015278	TACTAT	2	12	345478	345489	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015278	AAAGAC	2	12	345644	345655	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015278	CACCAT	2	12	345814	345825	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015278	CACCAT	2	12	346117	346128	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015278	CACCAT	2	12	346582	346593	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015278	TTACCA	2	12	347040	347051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015278	TTGACT	2	12	391255	391266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015278	TAAAAA	2	12	400283	400294	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015278	GGAGAA	2	12	404886	404897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015278	TTTTAC	2	12	450359	450370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015278	TATTGT	2	12	454540	454551	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015278	AAAATA	2	12	476671	476682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015278	CCTTTA	2	12	500097	500108	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015278	GCTGAT	2	12	547874	547885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015278	CAAGGA	2	12	547951	547962	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015278	AAAAGA	2	12	553112	553123	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015278	GAATAA	2	12	586425	586436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015278	TTAACA	2	12	593103	593114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015278	CTTTTT	2	12	606532	606543	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015278	GCAGTG	2	12	625767	625778	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015278	AAAAGA	2	12	642664	642675	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015278	TTTTAT	2	12	668000	668011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015278	ATTTAA	2	12	687987	687998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015278	TTAATT	2	12	693863	693874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015278	GAAAAT	2	12	703639	703650	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015278	AAGTTA	2	12	717680	717691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015278	CTTGGA	2	12	721928	721939	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015278	CTCTTT	2	12	728695	728706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015278	ATTTTC	2	12	729013	729024	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015278	ATTCCC	2	12	762847	762858	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015278	TAAAAA	2	12	802751	802762	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015278	CTATTA	2	12	804500	804511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015278	TCAAGC	2	12	813526	813537	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015278	ATTTTT	2	12	813586	813597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015278	AAGTAA	2	12	822381	822392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015278	TTGTTT	2	12	829254	829265	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015278	TTATAA	2	12	835073	835084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015278	CTATTT	2	12	839958	839969	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015278	TAAAAA	2	12	850629	850640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015278	CTAGCC	2	12	868034	868045	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015278	AAGCAT	2	12	885985	885996	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015278	AAAATA	2	12	891736	891747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015278	ATTATA	2	12	895506	895517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015278	ACCATA	2	12	934646	934657	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015278	GTATAA	2	12	941990	942001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015278	ACAAAA	2	12	976339	976350	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015278	TATACT	2	12	1007974	1007985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015278	TTTCTT	2	12	1023858	1023869	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015278	AGAAGG	2	12	1028056	1028067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015278	CTATTT	2	12	1041014	1041025	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015278	ATAAGA	2	12	1111220	1111231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015278	TTAAAA	2	12	1149324	1149335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015278	CTCTTG	2	12	1150244	1150255	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015278	AAAAGA	2	12	1168963	1168974	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015278	TTGGTT	2	12	1171130	1171141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015278	AGCGCT	2	12	1174299	1174310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015278	AAATAA	2	12	1176914	1176925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015278	ATTATA	2	12	1209266	1209277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015278	TAATGA	2	12	1222904	1222915	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015278	TGAAGG	2	12	1227909	1227920	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015278	AGATAA	2	12	1240193	1240204	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015278	CTTTTA	2	12	1242721	1242732	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015278	GATAAG	2	12	1245069	1245080	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015278	AGCTTG	2	12	1250177	1250188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015278	TTCCTT	2	12	1256111	1256122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015278	GCCTAG	2	12	1301694	1301705	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015278	TTTTTC	2	12	1320897	1320908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015278	TAAAAA	2	12	1321533	1321544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015278	ATTGAA	2	12	1328724	1328735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015278	TTTATT	2	12	1329221	1329232	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015278	TACCTA	2	12	1329658	1329669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015278	CTCATT	2	12	1364909	1364920	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015278	AGTCTC	2	12	1365167	1365178	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015278	TAAGAC	2	12	1380810	1380821	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015278	ATTCTC	2	12	1396594	1396605	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015278	TTAAAA	2	12	1398639	1398650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015278	CATTGA	2	12	1438373	1438384	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015278	CTATTT	2	12	1448504	1448515	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015278	CCTGAC	2	12	1486971	1486982	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015278	GCCTTA	2	12	1497160	1497171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015278	TGAAAA	2	12	1514302	1514313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015278	ACTAGG	2	12	1523207	1523218	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015278	CAAGAT	2	12	1554226	1554237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015278	TTTATT	2	12	1572809	1572820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015278	AAAGAG	2	12	1585638	1585649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015278	TAGTCG	2	12	1585766	1585777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015278	TATTTC	2	12	1591373	1591384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015278	ATTTTT	2	12	1592878	1592889	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015278	GCAAAA	2	12	1680407	1680418	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015278	CACCAG	2	12	1747161	1747172	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015278	CAATTT	2	12	1778129	1778140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_015278	CTTTTT	2	12	1780067	1780078	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015278	TTTATT	2	12	1837120	1837131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015278	TATAAA	2	12	1838722	1838733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_015278	TTCACT	2	12	1881418	1881429	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.