MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aerococcus urinae ACS-120-V-Col10a chromosome

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015278	TACTA	2	10	1584	1593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015278	TTACT	2	10	4865	4874	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015278	TAAAG	2	10	6556	6565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015278	GAGAA	2	10	15748	15757	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015278	GGTGA	2	10	22423	22432	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015278	TAGTT	2	10	23920	23929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015278	TAAAT	2	10	24649	24658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015278	TATAA	2	10	24716	24725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015278	GATTA	2	10	25198	25207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015278	AGGGC	2	10	25416	25425	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015278	ATTTT	2	10	35039	35048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015278	AAATA	2	10	35308	35317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015278	GACTT	2	10	35452	35461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015278	GCAAG	2	10	38447	38456	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015278	AAGGA	2	10	44268	44277	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015278	TTTCG	2	10	46847	46856	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015278	TCGTG	2	10	55920	55929	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015278	GGACG	2	10	56873	56882	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015278	TTATT	2	10	59922	59931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015278	AGGAA	2	10	71183	71192	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015278	TTAAA	2	10	73107	73116	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015278	AGGAA	2	10	82025	82034	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015278	ATAAA	2	10	83312	83321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015278	GAATT	2	10	86677	86686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015278	AAATG	2	10	94509	94518	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015278	AGTCA	2	10	97770	97779	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015278	AGCCA	2	10	102306	102315	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015278	TAAAA	2	10	127483	127492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015278	CTCTT	2	10	128519	128528	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015278	GAAAA	2	10	140368	140377	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015278	TAACT	2	10	146912	146921	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015278	ATTTC	2	10	147387	147396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015278	GATAT	2	10	148137	148146	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015278	ACAAA	2	10	149871	149880	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015278	AAGAA	2	10	150283	150292	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015278	TAAGC	2	10	150338	150347	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015278	ATATT	2	10	151995	152004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015278	GATAT	3	15	154893	154907	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015278	ATAAA	2	10	154956	154965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015278	GGAAA	2	10	157862	157871	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015278	AAAGA	2	10	162708	162717	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015278	CAAAG	2	10	162950	162959	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015278	CATTT	2	10	163207	163216	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015278	ATTCA	2	10	163838	163847	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015278	TAACT	2	10	163874	163883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015278	ACCAA	2	10	165587	165596	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015278	AGGCA	2	10	165940	165949	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015278	AAAGA	2	10	168025	168034	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015278	AACCA	2	10	171571	171580	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015278	ATAAC	2	10	172468	172477	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015278	TCAAA	2	10	178708	178717	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015278	AAGAT	2	10	178924	178933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015278	AATAA	2	10	179043	179052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015278	TTTTC	2	10	184449	184458	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015278	CTTTT	2	10	187162	187171	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015278	TGAAT	2	10	188263	188272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015278	CAAGA	2	10	188834	188843	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015278	GCTAA	2	10	188918	188927	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015278	GAAAA	2	10	191090	191099	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015278	CTCAC	2	10	196947	196956	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_015278	TTCAA	2	10	196985	196994	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015278	AAAAG	2	10	210216	210225	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015278	ATTTA	2	10	215713	215722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015278	GAATG	2	10	216122	216131	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015278	GAATG	2	10	216776	216785	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015278	ATATT	2	10	217175	217184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015278	GCAAT	2	10	217305	217314	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015278	ATTTT	2	10	217774	217783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015278	AAATT	2	10	222049	222058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015278	TTTTA	2	10	231223	231232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015278	TACAA	2	10	238111	238120	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015278	GAGAA	2	10	241204	241213	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015278	TATTC	2	10	246520	246529	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015278	TTAAT	2	10	247773	247782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015278	GTATG	2	10	248053	248062	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015278	ACCAA	2	10	248104	248113	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015278	AACAA	2	10	248292	248301	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015278	CGATG	2	10	257817	257826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015278	TATTT	2	10	259853	259862	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015278	TACAA	2	10	262644	262653	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015278	GAATT	2	10	262658	262667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015278	ATGAA	2	10	274946	274955	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015278	AAAGG	2	10	285125	285134	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015278	TGTTT	2	10	287579	287588	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015278	AGTTC	2	10	291612	291621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015278	AAAGA	2	10	293386	293395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015278	TCTTT	2	10	299922	299931	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015278	CTTTC	2	10	304826	304835	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_015278	TTCTA	2	10	304886	304895	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015278	TATTT	2	10	309634	309643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015278	AAGTA	2	10	309677	309686	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015278	TTGCA	2	10	309699	309708	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015278	AAAGT	2	10	315466	315475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015278	GTGTT	2	10	316479	316488	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015278	TAGTA	2	10	320267	320276	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015278	GAGTC	2	10	332722	332731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015278	AAGAG	2	10	336881	336890	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015278	AGAAA	2	10	338966	338975	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015278	TAGTT	2	10	339100	339109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015278	CTATT	2	10	339436	339445	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015278	CGAAA	2	10	339550	339559	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015278	AGCTC	2	10	339593	339602	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_015278	AACCC	2	10	341224	341233	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_015278	TGAAG	2	10	345520	345529	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015278	TGAAG	2	10	345856	345865	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015278	TGAAG	2	10	346624	346633	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015278	ACCGA	2	10	347666	347675	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015278	ACCAC	2	10	347886	347895	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_015278	TGTGA	2	10	355487	355496	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015278	AAATG	2	10	370947	370956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015278	TAGAA	2	10	371594	371603	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015278	TGATA	2	10	375433	375442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015278	TGAAG	2	10	391407	391416	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015278	AGCAG	2	10	394402	394411	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015278	TAAAG	2	10	399319	399328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015278	AGGTT	2	10	407500	407509	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015278	CTTTT	2	10	407521	407530	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015278	TTAAC	2	10	417590	417599	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015278	TTTTA	2	10	422445	422454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015278	CTTGT	2	10	432746	432755	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015278	ATTCT	2	10	442690	442699	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015278	AAGGA	2	10	445112	445121	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015278	AAATC	2	10	448458	448467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015278	GGATT	2	10	450340	450349	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015278	CGAAG	2	10	461829	461838	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015278	ATTAA	2	10	462010	462019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015278	CTTTC	2	10	470535	470544	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_015278	TCGTG	2	10	470583	470592	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015278	GGACG	2	10	471318	471327	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015278	TTTAC	2	10	476164	476173	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015278	TTGGA	2	10	476713	476722	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015278	AAGGA	2	10	499196	499205	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015278	GAAAG	2	10	505995	506004	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015278	TAAAG	2	10	507276	507285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015278	TTTTA	2	10	528870	528879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015278	GACTT	2	10	533849	533858	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015278	GTAAA	2	10	533942	533951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015278	TTAAT	2	10	538190	538199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015278	CTTCA	2	10	540178	540187	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_015278	ACAAG	2	10	542450	542459	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015278	AAGGA	2	10	551238	551247	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015278	TATCA	2	10	553087	553096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015278	AAAAC	2	10	553266	553275	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015278	TTTAA	2	10	558574	558583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015278	TCCTT	2	10	564949	564958	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015278	ATAGA	2	10	565000	565009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015278	AGGAA	2	10	566526	566535	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015278	ATTAA	2	10	571962	571971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015278	GCCAA	2	10	574579	574588	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_015278	AAAGG	2	10	577191	577200	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_015278	AATTC	2	10	2066521	2066530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.