MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aerococcus urinae ACS-120-V-Col10a chromosome

Total Repeats: 9616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015278	AGGC	2	8	1418	1425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015278	AGA	2	6	1453	1458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015278	CTT	2	6	1538	1543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015278	CTA	3	9	1574	1582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015278	TACTA	2	10	1584	1593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015278	AT	5	10	1597	1606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015278	TAA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015278	AT	4	8	3196	3203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015278	T	6	6	4657	4662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015278	AAATAG	2	12	4725	4736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015278	T	7	7	4783	4789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015278	T	6	6	4797	4802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015278	TTACT	2	10	4865	4874	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015278	AGG	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015278	GAC	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015278	T	6	6	6280	6285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015278	AG	3	6	6304	6309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015278	T	6	6	6335	6340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015278	TAG	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015278	T	7	7	6458	6464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015278	TA	3	6	6468	6473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015278	T	6	6	6546	6551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015278	TAAAG	2	10	6556	6565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015278	GT	3	6	6573	6578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015278	CAAG	2	8	7954	7961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015278	AAGG	2	8	9946	9953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015278	T	8	8	12686	12693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015278	TTG	2	6	12746	12751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015278	ATA	2	6	12762	12767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015278	AT	5	10	12819	12828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015278	TTA	2	6	12869	12874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015278	AAT	2	6	12916	12921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015278	TAAG	2	8	12936	12943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015278	TTA	2	6	12949	12954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015278	AGG	2	6	12964	12969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015278	TAAT	2	8	15197	15204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015278	CATT	2	8	15214	15221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015278	TCG	2	6	15236	15241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015278	TGCT	2	8	15457	15464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015278	ACT	2	6	15497	15502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015278	TTAA	2	8	15511	15518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015278	ATT	2	6	15529	15534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015278	TAT	2	6	15535	15540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015278	A	6	6	15552	15557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015278	A	6	6	15623	15628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015278	A	6	6	15639	15644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015278	AGG	2	6	15666	15671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015278	ATG	2	6	15728	15733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015278	GAGAA	2	10	15748	15757	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015278	TTA	2	6	15787	15792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015278	GAA	2	6	15818	15823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015278	GCC	2	6	15826	15831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015278	ATTC	2	8	15857	15864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015278	CTA	2	6	15883	15888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015278	TCTA	2	8	15980	15987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015278	CCA	2	6	16120	16125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015278	A	6	6	16125	16130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015278	A	6	6	16224	16229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015278	TAT	2	6	16262	16267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015278	T	6	6	16286	16291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015278	TA	3	6	16299	16304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015278	TTTC	2	8	16341	16348	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015278	T	6	6	16375	16380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015278	T	6	6	16431	16436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015278	T	6	6	16603	16608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015278	TTC	2	6	16694	16699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015278	T	6	6	16711	16716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015278	TAT	2	6	16733	16738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015278	GCC	2	6	16777	16782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015278	CTA	2	6	16824	16829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015278	A	6	6	16861	16866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015278	TTA	2	6	16874	16879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015278	A	6	6	16912	16917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015278	GAG	2	6	17848	17853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015278	ATTA	2	8	17926	17933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015278	T	6	6	17944	17949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015278	CCT	2	6	17961	17966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015278	TGAT	2	8	17972	17979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015278	TCC	2	6	20704	20709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015278	TCTT	2	8	20714	20721	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015278	T	7	7	20720	20726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015278	TATT	2	8	20730	20737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015278	A	6	6	20836	20841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015278	AGG	2	6	21016	21021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015278	AAG	2	6	21338	21343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015278	AG	3	6	21353	21358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015278	AGG	2	6	21954	21959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015278	AGG	2	6	22221	22226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015278	T	6	6	22247	22252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015278	CTG	2	6	22266	22271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015278	AAAATA	2	12	22369	22380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015278	GGTGA	2	10	22423	22432	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015278	ATAA	2	8	23166	23173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015278	AGA	2	6	23187	23192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015278	T	7	7	23214	23220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015278	TAA	2	6	23284	23289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015278	CTA	2	6	23316	23321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015278	ATT	2	6	23447	23452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015278	TA	3	6	23554	23559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015278	CTT	2	6	23581	23586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015278	TTA	2	6	23644	23649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015278	GAT	2	6	23664	23669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015278	TGTT	2	8	23690	23697	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015278	TTA	2	6	23698	23703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015278	ATA	2	6	23704	23709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015278	TTA	2	6	23726	23731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015278	TA	3	6	23736	23741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015278	TACT	2	8	23743	23750	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015278	T	7	7	23752	23758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015278	ACT	2	6	23779	23784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015278	TAAA	2	8	23789	23796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015278	CTT	3	9	23819	23827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015278	T	6	6	23826	23831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015278	TAT	3	9	23845	23853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015278	TAG	2	6	23865	23870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015278	TAGTT	2	10	23920	23929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015278	TAA	2	6	23930	23935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015278	TCCT	2	8	24022	24029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015278	TA	3	6	24053	24058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015278	TTCT	2	8	24061	24068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015278	TTA	2	6	24078	24083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015278	TTTA	2	8	24102	24109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015278	TTGT	2	8	24139	24146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015278	T	6	6	24149	24154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015278	GGT	2	6	24164	24169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015278	CAA	2	6	24245	24250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015278	AT	3	6	24401	24406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015278	TA	3	6	24452	24457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015278	TAA	2	6	24479	24484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015278	AGG	2	6	24495	24500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015278	A	6	6	24615	24620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015278	TAAAT	2	10	24649	24658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015278	AT	3	6	24699	24704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015278	TATAA	2	10	24716	24725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015278	T	6	6	24742	24747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015278	AGT	2	6	24754	24759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015278	TA	3	6	24778	24783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015278	TCGA	2	8	24791	24798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015278	GTTA	2	8	24806	24813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015278	CTAA	2	8	24901	24908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015278	CTA	2	6	24955	24960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015278	TA	3	6	24968	24973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015278	AGAA	2	8	24980	24987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015278	A	6	6	24986	24991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015278	ATTA	2	8	25049	25056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015278	AGC	2	6	25064	25069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015278	T	6	6	25076	25081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015278	CTA	2	6	25162	25167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015278	GATTA	2	10	25198	25207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015278	CTT	2	6	25247	25252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015278	TA	3	6	25288	25293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015278	ATTT	2	8	25336	25343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015278	AGGGC	2	10	25416	25425	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
154	NC_015278	TCT	2	6	25437	25442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015278	TA	3	6	25443	25448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015278	TAA	2	6	25478	25483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015278	TTA	2	6	25621	25626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015278	ATGT	2	8	25647	25654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015278	A	6	6	27733	27738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015278	TAT	2	6	27755	27760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_015278	TTG	2	6	27799	27804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015278	TTA	2	6	30154	30159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015278	AGG	2	6	30235	30240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_015278	AT	3	6	32581	32586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015278	GAAT	2	8	32623	32630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015278	TTA	2	6	32637	32642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_015278	ATA	2	6	32938	32943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_015278	TCTA	2	8	34250	34257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_015278	A	6	6	34257	34262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_015278	TATT	2	8	34336	34343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_015278	ACA	2	6	34351	34356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_015278	ATT	2	6	34456	34461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_015278	TCC	2	6	34978	34983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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287	NC_015278	CAA	2	6	51207	51212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_015278	TA	4	8	51240	51247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015278	TAT	2	6	51290	51295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015278	GATT	2	8	51297	51304	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015278	T	6	6	52522	52527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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