MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015178	ACGT	2	8	2815	2822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015178	TCGG	2	8	4160	4167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015178	GCCC	2	8	7090	7097	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_015178	AGGC	2	8	7144	7151	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015178	AGAC	2	8	9243	9250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015178	CAGC	2	8	14303	14310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015178	TGCC	2	8	14350	14357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015178	GGGC	2	8	14398	14405	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015178	CTCA	2	8	14754	14761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015178	ATAA	2	8	16059	16066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015178	ATCC	2	8	18136	18143	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015178	CCCA	2	8	20332	20339	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_015178	TTTG	2	8	21895	21902	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015178	GGGC	2	8	22503	22510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015178	GCGA	2	8	22570	22577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015178	CGCC	2	8	22716	22723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_015178	TGGC	2	8	28602	28609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015178	GGGC	2	8	32482	32489	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015178	CGGC	2	8	42943	42950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015178	TCAA	2	8	45435	45442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015178	GTCG	2	8	62905	62912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015178	CGCC	2	8	62993	63000	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_015178	GGTT	2	8	71920	71927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015178	CTGG	2	8	73093	73100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015178	TCGC	2	8	76280	76287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015178	GCTC	2	8	77136	77143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015178	GACG	2	8	78757	78764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015178	ACGC	2	8	78799	78806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015178	GCAC	2	8	80909	80916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015178	CCAA	2	8	81382	81389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015178	CGGC	2	8	81575	81582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015178	TTCG	2	8	81663	81670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015178	ACAT	2	8	95842	95849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015178	ATTG	2	8	103460	103467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015178	GAGG	2	8	103567	103574	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015178	GCCG	2	8	104593	104600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015178	CCGC	2	8	117291	117298	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_015178	GGAT	2	8	117375	117382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015178	CGGC	2	8	117506	117513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015178	GCTC	2	8	118427	118434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015178	CGGC	2	8	118458	118465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015178	ACCG	2	8	123387	123394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015178	GGCA	2	8	133501	133508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015178	CCAG	2	8	134999	135006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015178	GAAT	2	8	136224	136231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015178	AGTT	2	8	136272	136279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015178	GGCA	2	8	136652	136659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015178	CCAG	2	8	138150	138157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015178	GCCC	2	8	149763	149770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_015178	GGGC	2	8	151112	151119	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015178	GGGC	2	8	154190	154197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015178	CCCA	2	8	158453	158460	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_015178	TGAC	2	8	162841	162848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015178	CGGT	2	8	162850	162857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015178	TGGC	2	8	164236	164243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015178	AGTC	2	8	167624	167631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015178	TGCC	2	8	179216	179223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015178	GGGC	2	8	179272	179279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015178	GATC	2	8	179824	179831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015178	GAAC	2	8	181114	181121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015178	TCAA	2	8	190099	190106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015178	TTTG	2	8	192707	192714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015178	TGCG	2	8	197316	197323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015178	GCCG	2	8	198344	198351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015178	GGAC	2	8	198376	198383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015178	AATA	2	8	202039	202046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015178	CCCG	2	8	202173	202180	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_015178	AACT	2	8	202196	202203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015178	CGCA	2	8	204501	204508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015178	TAGG	2	8	204966	204973	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015178	GTAT	2	8	205235	205242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015178	ATAG	2	8	207117	207124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015178	ATAC	2	8	207132	207139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015178	TCAT	2	8	208408	208415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015178	CTTG	2	8	209226	209233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015178	ATTT	2	8	209296	209303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015178	TCGA	2	8	216316	216323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015178	TGAC	2	8	217352	217359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015178	CGTC	2	8	218234	218241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015178	GATG	2	8	222476	222483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015178	GCAA	2	8	231004	231011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015178	TCAT	2	8	231314	231321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015178	CCAA	2	8	234787	234794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015178	GATC	2	8	235615	235622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015178	CTAG	2	8	247609	247616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015178	CGCC	2	8	248436	248443	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_015178	GGCC	2	8	248503	248510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015178	CATC	2	8	249016	249023	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015178	TCCC	2	8	249028	249035	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_015178	TTCA	2	8	251433	251440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015178	GAGC	2	8	251859	251866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015178	GTTG	2	8	252657	252664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015178	GGAT	2	8	261571	261578	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015178	TGCC	2	8	263955	263962	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015178	ATCA	2	8	264117	264124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015178	CGAT	2	8	264656	264663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015178	GCCC	2	8	266268	266275	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_015178	AGTC	2	8	266543	266550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015178	CGCT	2	8	266813	266820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015178	CACT	2	8	266923	266930	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015178	CGAT	2	8	268454	268461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.