MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 chromosome

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015145	GGCCCA	2	12	42069	42080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015145	CCTGGA	2	12	65471	65482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015145	CGGCTC	2	12	90196	90207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015145	GCCCGC	2	12	115746	115757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015145	GCCCCT	2	12	147054	147065	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015145	CTTTCG	2	12	205942	205953	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015145	GTTTCG	2	12	228071	228082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015145	ACCGGC	2	12	297675	297686	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015145	TGAGGG	2	12	337432	337443	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015145	GTGAGG	2	12	337656	337667	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015145	CAAGGA	2	12	339542	339553	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015145	GAAGGC	2	12	339729	339740	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015145	CAGCTC	2	12	405075	405086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015145	CATTGG	2	12	405114	405125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015145	GCGTCA	2	12	414654	414665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015145	CGGACC	2	12	540361	540372	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015145	GGCGGA	2	12	549252	549263	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015145	GGTGTC	2	12	599824	599835	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015145	ACGCCA	3	18	600641	600658	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015145	CCGACC	2	12	600719	600730	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015145	ACGCCG	2	12	600785	600796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015145	GGGCAG	2	12	638410	638421	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015145	GCCGGG	2	12	857798	857809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015145	ATCCGA	2	12	870095	870106	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015145	CACATC	2	12	891509	891520	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015145	TCGCAG	2	12	919818	919829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015145	GCCAGC	2	12	920296	920307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015145	CTCGGC	2	12	920427	920438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015145	GGGCTG	2	12	920559	920570	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015145	GCCGTG	2	12	924283	924294	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015145	GCCGGT	2	12	945338	945349	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015145	CCTCAG	2	12	961224	961235	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015145	TGCAGG	2	12	982329	982340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015145	CACGGG	2	12	1005198	1005209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015145	GCTGGT	2	12	1034813	1034824	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015145	GAACGC	2	12	1039733	1039744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015145	AGGCTT	2	12	1043758	1043769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015145	ACGTTG	2	12	1057454	1057465	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015145	GCGGTT	2	12	1059570	1059581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015145	TCCCTT	2	12	1099706	1099717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015145	CGACGG	2	12	1147980	1147991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015145	AGGGGC	2	12	1209722	1209733	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015145	GCCCGG	2	12	1236855	1236866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015145	CTGTGG	8	48	1265468	1265515	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015145	CGGCTG	2	12	1284455	1284466	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015145	TCCTGG	2	12	1284561	1284572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015145	GCTGCC	2	12	1326916	1326927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015145	GAACCG	2	12	1327772	1327783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015145	GAACGC	2	12	1385791	1385802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015145	AGCGCC	2	12	1420540	1420551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015145	CTCCGC	2	12	1430273	1430284	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015145	GGGCCG	2	12	1435879	1435890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015145	GAACGG	2	12	1538945	1538956	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015145	ACACCC	2	12	1590663	1590674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015145	CACACC	2	12	1590688	1590699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015145	AGCCGC	2	12	1676226	1676237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015145	TCCGCT	2	12	1713262	1713273	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015145	AGGTGC	2	12	1764386	1764397	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015145	CGGCGT	2	12	1802988	1802999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015145	CCTGCG	2	12	1804898	1804909	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015145	CCTGAA	2	12	1831522	1831533	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015145	CTTCCG	2	12	1841681	1841692	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015145	TCGGCT	2	12	1850083	1850094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015145	TGGATC	2	12	1867234	1867245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015145	CCGCCT	2	12	1936539	1936550	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015145	CGGGCC	2	12	1970385	1970396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015145	CGACGG	2	12	2021133	2021144	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015145	ACCCCC	2	12	2028394	2028405	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
69	NC_015145	ACGGGC	2	12	2046853	2046864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015145	GCCCGC	2	12	2067374	2067385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015145	TCCGGT	2	12	2181351	2181362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015145	TTTCCG	2	12	2200105	2200116	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015145	CACGCA	2	12	2218693	2218704	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015145	AACCCG	2	12	2219063	2219074	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015145	CCTACT	2	12	2229295	2229306	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015145	GCCCCT	2	12	2236520	2236531	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015145	CGGTGG	2	12	2272239	2272250	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015145	GTCCTG	2	12	2280637	2280648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015145	GCGGCC	2	12	2290628	2290639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015145	TTCGGG	2	12	2322324	2322335	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015145	GCTTCG	2	12	2333645	2333656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015145	GTCGAC	2	12	2337976	2337987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015145	GCTGGC	2	12	2360860	2360871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015145	CGGCAT	2	12	2381680	2381691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015145	CAACGC	2	12	2398270	2398281	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015145	GGTGAC	2	12	2427404	2427415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015145	GCAAAC	2	12	2427531	2427542	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015145	CCGGTG	2	12	2454382	2454393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015145	GCGGCA	2	12	2465790	2465801	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015145	GCTGGT	2	12	2489253	2489264	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015145	ACGGGC	2	12	2505415	2505426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015145	TCCGTC	2	12	2544680	2544691	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015145	GCCGGG	2	12	2562559	2562570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015145	AGGCTG	2	12	2613188	2613199	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015145	GGGGCG	2	12	2634280	2634291	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015145	ACTGGA	2	12	2663801	2663812	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015145	GGCCCC	2	12	2690819	2690830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015145	CAGGTG	2	12	2702847	2702858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015145	GGCGAC	2	12	2761897	2761908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015145	CGTCGG	2	12	2762028	2762039	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015145	AGTCAC	2	12	2802064	2802075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015145	GTACGC	2	12	2809534	2809545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015145	GCCTGC	2	12	2816110	2816121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015145	CCCCAG	2	12	2889448	2889459	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015145	GGGCGC	2	12	2932846	2932857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015145	TCGCCC	2	12	2943892	2943903	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015145	GGTGCG	2	12	2944211	2944222	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015145	GGATGG	2	12	2948369	2948380	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015145	TCCCCC	2	12	2979224	2979235	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
110	NC_015145	ACGTTG	2	12	2989002	2989013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015145	CTAAAA	2	12	3018097	3018108	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015145	CTGCCG	2	12	3033151	3033162	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015145	ACGGTC	2	12	3060376	3060387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015145	CTTCCG	2	12	3110554	3110565	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015145	GCCTGC	2	12	3133193	3133204	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015145	CCTGCC	2	12	3174581	3174592	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015145	GCGGGA	2	12	3175228	3175239	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015145	CTTGCG	2	12	3189107	3189118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015145	CAGCCG	2	12	3201190	3201201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015145	CGGCGC	2	12	3216759	3216770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015145	AAAAGC	2	12	3224914	3224925	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015145	CTGGCG	2	12	3235265	3235276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015145	ACGTGC	2	12	3244713	3244724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015145	CTTCCT	2	12	3298098	3298109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015145	ACGCCG	2	12	3301894	3301905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015145	TCCGGG	2	12	3302135	3302146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015145	AGGGGC	2	12	3308368	3308379	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015145	CCCCCA	2	12	3336103	3336114	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
129	NC_015145	CCCCTC	2	12	3340133	3340144	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
130	NC_015145	GCTGCC	2	12	3347485	3347496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015145	GGCTCG	2	12	3352194	3352205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015145	CGGCGC	2	12	3396066	3396077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015145	CGTCCC	2	12	3496497	3496508	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015145	ACCCGC	2	12	3545222	3545233	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015145	CGGCAA	2	12	3545499	3545510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015145	CGGCTT	2	12	3547195	3547206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015145	CGTCAA	2	12	3571563	3571574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015145	CGGGCA	2	12	3579845	3579856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015145	TGCCCG	2	12	3579870	3579881	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015145	TCCGGT	2	12	3642648	3642659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015145	ATCCCC	2	12	3653045	3653056	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015145	GGCTGC	2	12	3653675	3653686	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015145	GCTGGC	2	12	3654063	3654074	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015145	ACCGCG	2	12	3677355	3677366	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015145	TGTCCA	2	12	3677369	3677380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015145	CAACGT	2	12	3689537	3689548	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015145	GAGCGG	2	12	3706297	3706308	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_015145	GGATGC	2	12	3729169	3729180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_015145	CAGGGC	2	12	3793156	3793167	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015145	CCATCC	2	12	3822143	3822154	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_015145	AACCGG	2	12	3866677	3866688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015145	AGCAGG	2	12	3880909	3880920	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_015145	CGCCAC	2	12	3899481	3899492	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_015145	TGCAGC	2	12	3916983	3916994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015145	CCCGGA	2	12	3919325	3919336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
156	NC_015145	GGTCCG	2	12	3995164	3995175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_015145	GCGGGG	2	12	4035684	4035695	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_015145	GACAGG	2	12	4119112	4119123	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_015145	TGCTTC	2	12	4126359	4126370	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015145	CCCAGC	2	12	4160744	4160755	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_015145	TCCACC	2	12	4164334	4164345	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_015145	GGGAAC	2	12	4165817	4165828	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_015145	GCCGGT	2	12	4241903	4241914	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.