MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 2173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015138	GTTC	2	8	5026074	5026081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2002	NC_015138	TGCG	2	8	5026096	5026103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2003	NC_015138	CGGC	2	8	5026166	5026173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2004	NC_015138	CCGG	2	8	5026732	5026739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2005	NC_015138	CGGC	2	8	5032434	5032441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2006	NC_015138	GGGC	3	12	5032469	5032480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2007	NC_015138	CTGC	2	8	5036818	5036825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_015138	GTGG	2	8	5040578	5040585	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_015138	TCGG	2	8	5046912	5046919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2010	NC_015138	TGCA	2	8	5051383	5051390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2011	NC_015138	GGCG	2	8	5053561	5053568	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2012	NC_015138	GCGG	2	8	5065666	5065673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2013	NC_015138	GAAC	2	8	5065955	5065962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2014	NC_015138	GATG	2	8	5067578	5067585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_015138	TTGC	2	8	5067626	5067633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2016	NC_015138	CCTC	2	8	5067902	5067909	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2017	NC_015138	CCCA	2	8	5068124	5068131	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2018	NC_015138	GCCG	2	8	5071010	5071017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2019	NC_015138	GCAG	2	8	5071072	5071079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2020	NC_015138	CGCA	2	8	5071149	5071156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2021	NC_015138	TGCC	2	8	5071349	5071356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2024	NC_015138	GCAG	2	8	5084164	5084171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2034	NC_015138	TTGG	2	8	5101591	5101598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2037	NC_015138	GTGC	2	8	5115247	5115254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2041	NC_015138	CATG	2	8	5128381	5128388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2042	NC_015138	CGCA	2	8	5137194	5137201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2043	NC_015138	CCCG	2	8	5138932	5138939	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2044	NC_015138	GCTT	2	8	5141086	5141093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2045	NC_015138	CGGG	2	8	5145677	5145684	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2046	NC_015138	CCGG	2	8	5145704	5145711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2047	NC_015138	CGGG	2	8	5146879	5146886	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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2053	NC_015138	ACCG	2	8	5166685	5166692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_015138	CATG	2	8	5166840	5166847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2055	NC_015138	GCCA	2	8	5168836	5168843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2056	NC_015138	CCTT	2	8	5171384	5171391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2057	NC_015138	CAGC	2	8	5175839	5175846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2065	NC_015138	CATC	2	8	5195881	5195888	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2124	NC_015138	CGGG	2	8	5388885	5388892	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2125	NC_015138	CAGG	2	8	5390400	5390407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2138	NC_015138	AACG	2	8	5407178	5407185	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2140	NC_015138	TTCA	2	8	5411356	5411363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2141	NC_015138	GAAG	2	8	5414127	5414134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_015138	CCGT	2	8	5414152	5414159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2143	NC_015138	GAAA	2	8	5414278	5414285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2144	NC_015138	ATCC	2	8	5418240	5418247	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2145	NC_015138	GCCT	2	8	5418306	5418313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2146	NC_015138	GACC	2	8	5418344	5418351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2147	NC_015138	CTCC	2	8	5422491	5422498	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2148	NC_015138	GCCC	2	8	5422570	5422577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2149	NC_015138	CGCA	2	8	5422748	5422755	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2150	NC_015138	CTGG	2	8	5422763	5422770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2151	NC_015138	GGCA	2	8	5424769	5424776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2157	NC_015138	GCTT	2	8	5436176	5436183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2158	NC_015138	AAAG	2	8	5436785	5436792	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2160	NC_015138	GCCG	2	8	5455166	5455173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2161	NC_015138	GGCC	2	8	5455452	5455459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2164	NC_015138	CGGC	2	8	5456024	5456031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2165	NC_015138	CCGG	2	8	5463753	5463760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2166	NC_015138	GACA	2	8	5463768	5463775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2167	NC_015138	CGGG	2	8	5463911	5463918	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2168	NC_015138	GACC	2	8	5464780	5464787	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2169	NC_015138	GCCA	2	8	5465401	5465408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2170	NC_015138	TTTC	2	8	5465445	5465452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2171	NC_015138	GCCC	2	8	5477374	5477381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2172	NC_015138	TGCC	2	8	5477393	5477400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2173	NC_015138	CGGG	2	8	5481754	5481761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.