MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014911	GAC	2	6	19	24	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014911	GAC	2	6	32	37	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014911	GTC	2	6	73	78	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014911	GT	3	6	7331	7336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014911	GCC	2	6	12026	12031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014911	AAG	2	6	12053	12058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014911	GCCTC	2	10	12434	12443	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014911	TC	3	6	12445	12450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014911	CGG	2	6	12455	12460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014911	AGAT	2	8	12526	12533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014911	CA	3	6	12559	12564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014911	TAA	2	6	12585	12590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014911	AGC	2	6	12656	12661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014911	TAG	2	6	12762	12767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014911	CGG	2	6	14419	14424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014911	TCG	2	6	14462	14467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014911	TGC	2	6	14478	14483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014911	GAT	2	6	14486	14491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014911	CCA	2	6	14493	14498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014911	CGG	2	6	14505	14510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014911	CCTC	2	8	14512	14519	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014911	A	6	6	14542	14547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014911	CCG	2	6	14557	14562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014911	CCT	2	6	15234	15239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014911	TGG	2	6	15642	15647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014911	CAA	2	6	15667	15672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014911	A	6	6	15671	15676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014911	AACC	2	8	15759	15766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014911	CCT	2	6	16811	16816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014911	TGT	2	6	16830	16835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014911	TAC	2	6	16847	16852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014911	ACA	2	6	16858	16863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014911	T	7	7	16887	16893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014911	A	7	7	16912	16918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014911	TGGG	2	8	16941	16948	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014911	GGT	2	6	16953	16958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014911	TTG	2	6	19123	19128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014911	GCC	2	6	19146	19151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014911	TCC	2	6	20176	20181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014911	TGA	2	6	20454	20459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014911	GCC	2	6	20475	20480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014911	TCT	2	6	21145	21150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014911	CCGG	2	8	22387	22394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014911	GCC	2	6	22402	22407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014911	CGG	2	6	22958	22963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014911	ACG	3	9	22987	22995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014911	GAC	2	6	22998	23003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014911	CTT	2	6	23016	23021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014911	CCCT	2	8	23066	23073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_014911	G	6	6	23296	23301	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014911	G	7	7	23339	23345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014911	C	6	6	23348	23353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_014911	CGG	2	6	23356	23361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014911	T	6	6	23401	23406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014911	AAC	2	6	23421	23426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014911	CG	3	6	23482	23487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014911	GCC	2	6	23523	23528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014911	AGCC	2	8	23681	23688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014911	GCC	2	6	23704	23709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014911	GCCG	2	8	23734	23741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014911	GGCC	2	8	23749	23756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014911	C	6	6	23790	23795	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_014911	CTTA	2	8	23948	23955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014911	GCAATT	2	12	23992	24003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014911	CTG	2	6	24440	24445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014911	CAA	2	6	24479	24484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014911	GCTGC	2	10	24499	24508	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014911	AG	3	6	24529	24534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014911	GCG	2	6	24679	24684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014911	AAG	2	6	24689	24694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014911	GGT	2	6	24837	24842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014911	AC	3	6	25001	25006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014911	TGG	2	6	25031	25036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014911	GGC	2	6	25073	25078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014911	CCGG	2	8	25209	25216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014911	GC	3	6	25225	25230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014911	AGT	2	6	25301	25306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014911	GCA	2	6	25325	25330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014911	GAACC	2	10	25381	25390	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014911	GCTG	2	8	25649	25656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014911	CGCC	2	8	25697	25704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_014911	GT	3	6	25784	25789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014911	TGG	2	6	25826	25831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014911	TCA	2	6	25841	25846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014911	AGA	2	6	25851	25856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014911	GGC	2	6	25881	25886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014911	TGG	2	6	25979	25984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014911	GC	4	8	26004	26011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014911	ATG	2	6	26044	26049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014911	CAG	2	6	26064	26069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014911	TCG	2	6	26071	26076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014911	CCG	2	6	26130	26135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014911	GCC	2	6	26210	26215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014911	CTG	2	6	26310	26315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014911	G	6	6	26327	26332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014911	ACCCG	2	10	26412	26421	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_014911	CAG	2	6	26452	26457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014911	GCC	2	6	27112	27117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014911	CGG	2	6	27125	27130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014911	CCG	2	6	27158	27163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014911	GC	3	6	27274	27279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014911	GGCG	2	8	27284	27291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014911	GGGA	2	8	27308	27315	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014911	GC	3	6	27342	27347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014911	GAC	2	6	27525	27530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014911	CG	3	6	27551	27556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014911	GCC	2	6	27602	27607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014911	CG	3	6	27626	27631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014911	CG	4	8	27713	27720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014911	CGC	2	6	27750	27755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014911	CCGCC	2	10	27917	27926	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
112	NC_014911	GCCCC	2	10	30376	30385	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
113	NC_014911	C	6	6	30382	30387	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_014911	CG	4	8	30405	30412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014911	GCC	2	6	30433	30438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014911	CGA	2	6	30449	30454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014911	ACG	2	6	30464	30469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014911	GCC	2	6	30508	30513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014911	CCT	2	6	31145	31150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014911	TA	3	6	31171	31176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014911	GGCG	2	8	31215	31222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014911	CGG	2	6	35004	35009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014911	CG	3	6	35103	35108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014911	TCA	2	6	35164	35169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014911	CTGC	2	8	35303	35310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014911	GAA	2	6	35325	35330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014911	GC	3	6	35334	35339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014911	CG	3	6	35391	35396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014911	CCA	2	6	35495	35500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014911	CGA	2	6	35609	35614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014911	ATCA	2	8	35640	35647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014911	GGT	2	6	35677	35682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014911	GCACC	2	10	35741	35750	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_014911	GC	3	6	35753	35758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014911	CAA	2	6	35765	35770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014911	AGC	2	6	35779	35784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014911	CGG	2	6	35825	35830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014911	TGG	2	6	35888	35893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014911	GAA	2	6	35909	35914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014911	GC	3	6	35934	35939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014911	GGC	2	6	35968	35973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014911	GC	3	6	35988	35993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014911	GCG	2	6	35997	36002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014911	CTG	2	6	36129	36134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014911	GGC	2	6	36204	36209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014911	GCC	2	6	36247	36252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_014911	GC	3	6	36351	36356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014911	TCG	2	6	36361	36366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014911	GCG	2	6	36387	36392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014911	GCTC	2	8	36398	36405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014911	TTG	2	6	36438	36443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014911	TGC	2	6	36501	36506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014911	ATTG	2	8	36642	36649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014911	TG	3	6	36738	36743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014911	CCA	2	6	36778	36783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_014911	ACC	2	6	36836	36841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_014911	GAG	2	6	36890	36895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014911	TGAT	2	8	36968	36975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014911	CCG	2	6	36984	36989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_014911	CAG	2	6	37008	37013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_014911	TGT	2	6	37032	37037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014911	CT	3	6	37055	37060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_014911	TCA	2	6	37095	37100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_014911	GGA	2	6	37149	37154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014911	GCA	2	6	37178	37183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_014911	GC	4	8	37726	37733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_014911	GC	3	6	37753	37758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_014911	GAGC	2	8	37777	37784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
169	NC_014911	GCC	2	6	37810	37815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_014911	CGG	2	6	37826	37831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_014911	CA	3	6	37834	37839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_014911	GCA	2	6	39066	39071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_014911	CTTTGA	2	12	39100	39111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_014911	GT	3	6	39122	39127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014911	CGG	2	6	43707	43712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_014911	A	6	6	43751	43756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014911	GTC	2	6	43851	43856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_014911	ACA	2	6	43868	43873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_014911	CGC	2	6	43914	43919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_014911	CGC	2	6	43969	43974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_014911	TGT	2	6	44640	44645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014911	GAC	2	6	44657	44662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_014911	GCG	2	6	44695	44700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_014911	GGC	2	6	44759	44764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_014911	GCC	2	6	44769	44774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_014911	GCC	2	6	44812	44817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
187	NC_014911	TCG	2	6	44872	44877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_014911	GCG	2	6	44899	44904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_014911	TGC	2	6	44974	44979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_014911	A	7	7	45039	45045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_014911	GCC	2	6	45046	45051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
192	NC_014911	GGC	2	6	45061	45066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_014911	G	6	6	45081	45086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
194	NC_014911	CCT	2	6	46319	46324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
195	NC_014911	GTC	2	6	46724	46729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_014911	GCC	2	6	46783	46788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
197	NC_014911	GAAGG	2	10	47188	47197	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014911	GCG	2	6	47201	47206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_014911	AGCC	2	8	47224	47231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
200	NC_014911	CCG	2	6	47251	47256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
201	NC_014911	TGC	2	6	60883	60888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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210	NC_014911	CCT	2	6	70293	70298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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212	NC_014911	CAAG	2	8	73458	73465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
213	NC_014911	TTTG	2	8	74626	74633	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
214	NC_014911	GGC	2	6	75567	75572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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217	NC_014911	ATTCT	2	10	75659	75668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
218	NC_014911	ATC	2	6	75678	75683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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222	NC_014911	GCC	2	6	77157	77162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.