MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC chromosome

Total Repeats: 9366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014910	GCCA	2	8	1538706	1538713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_014910	GCTG	2	8	1539498	1539505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_014910	GGA	2	6	1539512	1539517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014910	CCA	2	6	1540849	1540854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_014910	AGC	2	6	1542969	1542974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_014910	GAG	2	6	1542985	1542990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014910	CGC	3	9	1544367	1544375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_014910	CA	3	6	1547237	1547242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_014910	GT	3	6	1548697	1548702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014910	GGC	2	6	1548708	1548713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_014910	GC	3	6	1552045	1552050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_014910	A	6	6	1552074	1552079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014910	GAA	2	6	1553756	1553761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014910	AGT	2	6	1553848	1553853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_014910	AGCTA	2	10	1553875	1553884	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3016	NC_014910	GAG	2	6	1554023	1554028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_014910	CCT	2	6	1555299	1555304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_014910	CGC	3	9	1555361	1555369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_014910	CGC	2	6	1555426	1555431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_014910	TCGC	2	8	1555440	1555447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_014910	CCG	2	6	1555523	1555528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_014910	GAG	2	6	1555577	1555582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_014910	GA	3	6	1555674	1555679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014910	GCT	2	6	1555714	1555719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_014910	TCCTT	2	10	1556768	1556777	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3026	NC_014910	GTC	2	6	1560613	1560618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_014910	TTGC	2	8	1561682	1561689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_014910	TGA	2	6	1561753	1561758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_014910	GGT	2	6	1561762	1561767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014910	CGGGC	2	10	1561779	1561788	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3031	NC_014910	ATT	2	6	1562740	1562745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014910	GCA	2	6	1562755	1562760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_014910	GCCGC	2	10	1562794	1562803	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3034	NC_014910	ACC	2	6	1564196	1564201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_014910	CGCC	2	8	1564205	1564212	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3036	NC_014910	GGC	2	6	1564219	1564224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_014910	GCG	2	6	1567102	1567107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_014910	GAA	2	6	1567118	1567123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_014910	A	6	6	1568205	1568210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014910	GCCC	2	8	1568220	1568227	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3041	NC_014910	GCAG	2	8	1568235	1568242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_014910	TAT	2	6	1568244	1568249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014910	TCCC	2	8	1568763	1568770	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3044	NC_014910	GGC	2	6	1571598	1571603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_014910	CCG	2	6	1571631	1571636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_014910	GGGGT	2	10	1571637	1571646	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_014910	A	6	6	1572817	1572822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_014910	T	6	6	1572837	1572842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_014910	GCG	2	6	1572852	1572857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_014910	CCT	2	6	1573241	1573246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_014910	G	6	6	1573289	1573294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_014910	CG	3	6	1573312	1573317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_014910	TTC	2	6	1574841	1574846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_014910	GCCAT	2	10	1574872	1574881	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3055	NC_014910	CGT	2	6	1574898	1574903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_014910	TGCC	2	8	1574926	1574933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_014910	ACCG	2	8	1574948	1574955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_014910	GCT	2	6	1574963	1574968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_014910	CGGG	2	8	1575077	1575084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_014910	GCA	2	6	1575120	1575125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014910	AC	3	6	1577312	1577317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_014910	ATCA	2	8	1579648	1579655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_014910	TGGC	2	8	1580199	1580206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_014910	GT	3	6	1580257	1580262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014910	GCTGT	2	10	1580286	1580295	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3066	NC_014910	AAT	2	6	1580304	1580309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014910	C	6	6	1580319	1580324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3068	NC_014910	CGG	2	6	1582367	1582372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_014910	CGT	2	6	1583793	1583798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_014910	GT	3	6	1583797	1583802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014910	CGC	2	6	1584183	1584188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_014910	CGGCG	2	10	1584920	1584929	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3073	NC_014910	AGGC	2	8	1584978	1584985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_014910	ATC	2	6	1585381	1585386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_014910	TTG	2	6	1588108	1588113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014910	CGG	2	6	1588115	1588120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_014910	TCA	2	6	1589676	1589681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_014910	A	7	7	1589681	1589687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_014910	AGC	2	6	1589759	1589764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_014910	TGA	2	6	1592434	1592439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_014910	GCATG	2	10	1592502	1592511	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3082	NC_014910	CCA	2	6	1592543	1592548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_014910	GCATG	2	10	1592804	1592813	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3084	NC_014910	CCA	2	6	1592845	1592850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_014910	CGTTT	2	10	1593110	1593119	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3086	NC_014910	CCG	2	6	1593149	1593154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_014910	CG	3	6	1593153	1593158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_014910	GGC	2	6	1593161	1593166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_014910	TGACGT	2	12	1593973	1593984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3091	NC_014910	TCC	2	6	1594164	1594169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_014910	TCC	2	6	1594183	1594188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_014910	GCC	2	6	1594194	1594199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_014910	CGC	2	6	1594216	1594221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_014910	CGAG	2	8	1594244	1594251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3096	NC_014910	CCG	2	6	1595496	1595501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_014910	GGC	2	6	1595504	1595509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_014910	TGA	2	6	1595516	1595521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_014910	GCCACG	2	12	1597091	1597102	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_014910	CGA	2	6	1597112	1597117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3102	NC_014910	GGC	2	6	1598014	1598019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_014910	CGAC	2	8	1598094	1598101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_014910	ACG	3	9	1598109	1598117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_014910	AAG	2	6	1598126	1598131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_014910	GCG	3	9	1598139	1598147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_014910	ACCAG	2	10	1598203	1598212	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3108	NC_014910	GGT	2	6	1600141	1600146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_014910	AG	3	6	1600172	1600177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_014910	AG	3	6	1600189	1600194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014910	CAC	2	6	1600264	1600269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_014910	GCG	3	9	1600283	1600291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_014910	CGC	2	6	1600332	1600337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_014910	GTC	2	6	1600370	1600375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_014910	GTT	3	9	1600449	1600457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_014910	ACC	2	6	1600523	1600528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_014910	AAC	2	6	1600540	1600545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_014910	CCG	2	6	1602921	1602926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_014910	GGC	2	6	1602966	1602971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3121	NC_014910	TGTTTT	2	12	1603677	1603688	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_014910	ATTC	2	8	1603725	1603732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_014910	CCG	2	6	1603792	1603797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_014910	GCA	2	6	1603815	1603820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_014910	GAG	2	6	1603853	1603858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014910	CCT	2	6	1605129	1605134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_014910	GTT	3	9	1605240	1605248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014910	CGG	2	6	1605301	1605306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_014910	TCG	2	6	1605315	1605320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_014910	GGT	2	6	1605323	1605328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_014910	A	8	8	1606498	1606505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_014910	CTAT	2	8	1606587	1606594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_014910	GCGGG	2	10	1607252	1607261	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3134	NC_014910	CTGA	2	8	1607276	1607283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_014910	TGCAG	2	10	1607298	1607307	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3136	NC_014910	TTG	2	6	1607352	1607357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3254	NC_014910	CGG	2	6	1629895	1629900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3259	NC_014910	CTG	2	6	1630154	1630159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3262	NC_014910	ACCG	2	8	1630289	1630296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_014910	CGG	2	6	1630318	1630323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_014910	CATCGA	2	12	1630339	1630350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3265	NC_014910	CCG	2	6	1630371	1630376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3266	NC_014910	GCC	2	6	1630385	1630390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3267	NC_014910	GTG	3	9	1630433	1630441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_014910	CG	3	6	1630467	1630472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3269	NC_014910	GCT	2	6	1630477	1630482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3270	NC_014910	GAC	2	6	1630523	1630528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3271	NC_014910	GTG	2	6	1630529	1630534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_014910	AGC	2	6	1630593	1630598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3274	NC_014910	GC	3	6	1630663	1630668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3275	NC_014910	GAA	2	6	1630705	1630710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3276	NC_014910	TCG	2	6	1630715	1630720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3277	NC_014910	GCC	2	6	1630735	1630740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3280	NC_014910	GCCCGG	2	12	1635921	1635932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3281	NC_014910	A	6	6	1635952	1635957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3282	NC_014910	A	7	7	1635985	1635991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3283	NC_014910	TTTC	2	8	1636006	1636013	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3284	NC_014910	GAC	2	6	1639353	1639358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3286	NC_014910	GCT	2	6	1639425	1639430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3287	NC_014910	TGGG	2	8	1639440	1639447	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3288	NC_014910	ATT	2	6	1639466	1639471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3289	NC_014910	GGT	2	6	1639493	1639498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3290	NC_014910	CGGAC	2	10	1639499	1639508	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3293	NC_014910	AT	3	6	1639536	1639541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3294	NC_014910	GCT	2	6	1641951	1641956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3295	NC_014910	GTGCT	2	10	1641960	1641969	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3296	NC_014910	TGCAA	2	10	1641977	1641986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3297	NC_014910	TCT	2	6	1642078	1642083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3298	NC_014910	GGACG	2	10	1642211	1642220	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3303	NC_014910	GCCCG	2	10	1644862	1644871	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3304	NC_014910	CCG	3	9	1644869	1644877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3332	NC_014910	GTT	2	6	1652994	1652999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3333	NC_014910	TCAA	2	8	1653023	1653030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3334	NC_014910	TGT	2	6	1653067	1653072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3336	NC_014910	GTG	2	6	1653303	1653308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3338	NC_014910	TTCC	2	8	1656601	1656608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3341	NC_014910	CG	3	6	1657630	1657635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3342	NC_014910	CG	4	8	1657721	1657728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3343	NC_014910	TGCG	2	8	1657734	1657741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3344	NC_014910	CG	4	8	1657740	1657747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3345	NC_014910	ATCC	2	8	1657764	1657771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3348	NC_014910	CG	3	6	1659925	1659930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3349	NC_014910	GGGC	2	8	1659938	1659945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3350	NC_014910	GCC	2	6	1660000	1660005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3353	NC_014910	GCCC	2	8	1660046	1660053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3354	NC_014910	GTCCC	2	10	1660057	1660066	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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3361	NC_014910	CTGCG	2	10	1660222	1660231	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3381	NC_014910	TG	3	6	1684396	1684401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3382	NC_014910	GCCG	2	8	1684406	1684413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3388	NC_014910	TTC	2	6	1697265	1697270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3390	NC_014910	AGG	2	6	1697401	1697406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3391	NC_014910	GC	3	6	1697667	1697672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3392	NC_014910	AGG	2	6	1697679	1697684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3394	NC_014910	CG	5	10	1699645	1699654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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