MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 chromosome 2

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014817	TGAT	2	8	7492	7499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014817	TATT	2	8	7594	7601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014817	ATGG	2	8	7628	7635	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014817	GCAG	2	8	10395	10402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014817	GTGC	2	8	12217	12224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014817	TTTA	2	8	28316	28323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014817	GGGC	2	8	37622	37629	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014817	ACTT	2	8	41416	41423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014817	ATGA	2	8	41937	41944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014817	GCAG	2	8	46137	46144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014817	TTGG	2	8	50578	50585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014817	GTCG	2	8	50643	50650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014817	GGCA	2	8	52980	52987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014817	GATA	2	8	53056	53063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014817	AGGT	2	8	53381	53388	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014817	AGCG	2	8	54401	54408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014817	TTGA	2	8	58420	58427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014817	TGTA	2	8	59667	59674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014817	TTCA	2	8	65144	65151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014817	TTCG	2	8	71683	71690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014817	TCGC	2	8	80692	80699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014817	GATC	2	8	80708	80715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014817	CTTC	2	8	81306	81313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014817	GGAG	3	12	84220	84231	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014817	CCTT	2	8	84435	84442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014817	GACG	2	8	88786	88793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014817	GGGC	2	8	91457	91464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014817	GTCT	2	8	92360	92367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014817	AGGA	2	8	94681	94688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014817	TGAC	2	8	115441	115448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014817	CCCT	2	8	122380	122387	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_014817	AATC	2	8	123145	123152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014817	CGTC	2	8	127752	127759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014817	ATTT	2	8	127844	127851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014817	GAAA	2	8	127866	127873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014817	CCTC	2	8	132018	132025	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_014817	GTTT	2	8	132044	132051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014817	AAAT	2	8	136838	136845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014817	GCAT	2	8	138493	138500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014817	CCGT	2	8	141332	141339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014817	ACGG	2	8	146909	146916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014817	TTCT	2	8	149291	149298	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014817	AAGC	2	8	149740	149747	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014817	CGAA	2	8	149960	149967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014817	TGAC	2	8	150587	150594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014817	ATTC	2	8	151391	151398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014817	GGTT	2	8	151501	151508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014817	TGAT	2	8	151677	151684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014817	TGAA	2	8	151890	151897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014817	GTGA	2	8	152030	152037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014817	GAAC	2	8	152052	152059	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014817	GCGA	2	8	152392	152399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014817	TGGA	2	8	153000	153007	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014817	GCGG	2	8	153009	153016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014817	CGTC	2	8	153091	153098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014817	AAAG	2	8	153214	153221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014817	AGCC	2	8	153467	153474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014817	CATA	2	8	153609	153616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014817	GCCG	2	8	154963	154970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014817	GCCT	2	8	155007	155014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014817	AAAC	2	8	155352	155359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014817	TGTT	2	8	155381	155388	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014817	GAGT	2	8	155565	155572	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014817	CGGG	2	8	159778	159785	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014817	TGGA	2	8	165068	165075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014817	GTCG	2	8	165149	165156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014817	GAGC	2	8	166821	166828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014817	CCTC	2	8	167101	167108	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_014817	GAGG	2	8	183151	183158	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014817	GGTG	2	8	183169	183176	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014817	GAAA	2	8	183245	183252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014817	GCGA	2	8	184647	184654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014817	CACG	2	8	185018	185025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014817	TGGC	2	8	187151	187158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014817	CGAG	2	8	203882	203889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014817	CTGA	2	8	211074	211081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014817	GTTT	2	8	212041	212048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014817	TCAC	2	8	216795	216802	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014817	CGGG	2	8	217788	217795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014817	CTGC	2	8	218252	218259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014817	CTGG	2	8	218663	218670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014817	TGCC	2	8	219144	219151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014817	GACC	2	8	219202	219209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014817	TAGG	2	8	222550	222557	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014817	TTTC	2	8	222987	222994	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014817	ATTT	2	8	227513	227520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014817	ACCC	2	8	235126	235133	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_014817	TTCT	2	8	236728	236735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014817	TCAG	3	12	242977	242988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014817	GTTC	2	8	249012	249019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014817	AGGC	2	8	275612	275619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014817	CAAA	2	8	286339	286346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014817	TTTG	2	8	288866	288873	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014817	GGAA	2	8	292587	292594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014817	CAGG	2	8	292604	292611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014817	TATT	2	8	292641	292648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014817	ATTG	2	8	292994	293001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014817	AGGG	2	8	299828	299835	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014817	TGCT	2	8	302770	302777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014817	CCGG	2	8	304401	304408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014817	GCCC	2	8	306190	306197	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_014817	CAGA	2	8	308360	308367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014817	GGGC	2	8	308371	308378	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014817	AACA	2	8	308431	308438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014817	AAAG	2	8	311847	311854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014817	TAGA	2	8	318510	318517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014817	GGGA	2	8	319266	319273	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014817	TGAA	2	8	319318	319325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014817	CGTG	2	8	319417	319424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014817	GAGG	2	8	319723	319730	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014817	GGGC	2	8	329727	329734	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014817	AAAT	2	8	329851	329858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014817	TAAA	2	8	329958	329965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014817	ACTG	2	8	330026	330033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014817	CGAT	2	8	339400	339407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014817	CGGG	2	8	344501	344508	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014817	GCGG	2	8	344742	344749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014817	CACG	2	8	344843	344850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014817	AGGG	2	8	345389	345396	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014817	GAAT	2	8	345803	345810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014817	TTTA	2	8	345811	345818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014817	TCCG	2	8	352262	352269	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014817	TCGC	2	8	359286	359293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014817	TGGC	2	8	359667	359674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014817	GCGG	2	8	370853	370860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014817	TTGT	2	8	370861	370868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014817	GAAC	2	8	370887	370894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014817	GCCC	2	8	382647	382654	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_014817	GATT	2	8	398295	398302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014817	GCAA	2	8	398443	398450	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014817	TGCG	2	8	399433	399440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014817	TGAG	2	8	408750	408757	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014817	GTTT	2	8	414705	414712	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014817	CAAA	2	8	414881	414888	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014817	CGGA	2	8	415289	415296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014817	GTGC	2	8	423248	423255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014817	GACC	2	8	427612	427619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014817	GATT	2	8	427673	427680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014817	TCCC	2	8	439090	439097	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_014817	AAAG	2	8	440342	440349	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014817	AATG	2	8	446204	446211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014817	ACAA	2	8	449111	449118	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014817	TTGG	2	8	450607	450614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014817	TCAC	2	8	458768	458775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014817	GACG	2	8	458931	458938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014817	GGTC	2	8	458949	458956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014817	CGTG	2	8	459465	459472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014817	AAAT	2	8	459605	459612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014817	TATC	2	8	460089	460096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014817	AGTA	2	8	471433	471440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014817	CAGA	2	8	478426	478433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.