MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 1467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014378	TATT	2	8	53	60	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014378	TATT	2	8	265	272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014378	ACTT	2	8	1795	1802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014378	TGAT	2	8	10185	10192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014378	AATT	2	8	10265	10272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014378	GTGA	2	8	11050	11057	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014378	GCTG	2	8	11958	11965	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014378	GCCT	2	8	12380	12387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014378	GCGA	2	8	12734	12741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014378	GAAA	2	8	12900	12907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014378	CATT	2	8	13632	13639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014378	CAGG	2	8	14768	14775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014378	CGTA	2	8	14849	14856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014378	AATA	2	8	15484	15491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014378	TAAA	2	8	15535	15542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014378	ATTA	2	8	15663	15670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014378	TAAT	2	8	15872	15879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014378	AATT	2	8	16478	16485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014378	CTTT	2	8	17829	17836	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014378	TCCT	2	8	17844	17851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014378	GGAA	2	8	22403	22410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014378	ATTA	2	8	22559	22566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014378	CTTG	2	8	23473	23480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014378	CTAT	2	8	23502	23509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014378	TAAA	2	8	25184	25191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014378	CTTT	2	8	25227	25234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014378	TTAG	2	8	26781	26788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014378	ATAA	3	12	30697	30708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014378	CAAT	2	8	32043	32050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014378	TAAT	2	8	32176	32183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014378	TAAT	2	8	32191	32198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014378	TTAA	2	8	32209	32216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014378	TTTA	2	8	32524	32531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014378	TCCC	2	8	33108	33115	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_014378	TAAG	2	8	33263	33270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014378	GTAA	2	8	33339	33346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014378	TAAT	2	8	36579	36586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014378	TTAA	2	8	36913	36920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014378	TTTA	2	8	40281	40288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014378	ATGA	2	8	40462	40469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014378	GGTT	2	8	42962	42969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014378	TTAA	2	8	47840	47847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014378	GTCA	2	8	50194	50201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014378	TAAT	2	8	51678	51685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014378	AATT	2	8	51840	51847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014378	GAAA	2	8	54185	54192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014378	CTAG	2	8	58483	58490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014378	TTAA	2	8	59515	59522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014378	GATA	2	8	59602	59609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014378	TTTC	2	8	59635	59642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014378	TACA	2	8	60063	60070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014378	CAGC	2	8	64751	64758	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014378	TTTG	2	8	70958	70965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014378	TTCA	2	8	71132	71139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014378	CCGT	2	8	71227	71234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014378	GAGT	2	8	71489	71496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014378	AACG	2	8	71561	71568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014378	TAAT	2	8	73876	73883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014378	ATAA	2	8	77497	77504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014378	AATT	2	8	77530	77537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014378	ATTT	2	8	77797	77804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014378	TTCA	2	8	85264	85271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014378	CCGT	2	8	85359	85366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014378	AGTG	2	8	85387	85394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014378	AACG	2	8	85458	85465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014378	TAAT	2	8	89434	89441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014378	TAGA	2	8	94848	94855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014378	CATA	2	8	95484	95491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014378	AGAT	2	8	104557	104564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014378	TTAA	2	8	106394	106401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014378	ATTA	2	8	108944	108951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014378	TCTA	2	8	108959	108966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014378	ATTA	2	8	109720	109727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014378	ATTA	2	8	110739	110746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014378	ATTA	2	8	112811	112818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014378	ATGA	2	8	113356	113363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014378	AATT	2	8	113461	113468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014378	CAAA	2	8	115318	115325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014378	TAAT	2	8	115446	115453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014378	AGGG	2	8	119528	119535	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014378	TTTA	2	8	122376	122383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014378	GTGA	2	8	122421	122428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014378	ATTA	2	8	127346	127353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014378	TAAA	2	8	130332	130339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014378	TGAG	2	8	130624	130631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014378	CGAA	2	8	130641	130648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014378	GAAA	2	8	130692	130699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014378	TAAA	2	8	130828	130835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014378	AGGG	2	8	131796	131803	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014378	ATTT	2	8	132987	132994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014378	AATT	2	8	137291	137298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014378	TGAA	2	8	137366	137373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014378	AATT	2	8	137450	137457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014378	GTGA	2	8	138235	138242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014378	GCTG	2	8	139143	139150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014378	GCCT	2	8	139565	139572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014378	GCGA	2	8	139919	139926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014378	GAAA	2	8	140085	140092	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014378	CATT	2	8	140817	140824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014378	CAGG	2	8	141953	141960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014378	CGTA	2	8	142034	142041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014378	AATA	2	8	142669	142676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014378	TAAA	2	8	142720	142727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014378	ATTA	2	8	142848	142855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014378	GTAA	2	8	143068	143075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014378	TTAT	2	8	143878	143885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014378	TTAA	2	8	144029	144036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014378	GTAA	2	8	144077	144084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014378	TTAG	2	8	155279	155286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014378	TAAG	2	8	156907	156914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014378	ACTG	2	8	156967	156974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014378	AGTA	2	8	157005	157012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014378	AGTT	2	8	162625	162632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014378	TGAT	2	8	163334	163341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014378	AGTA	2	8	163347	163354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014378	CTGC	2	8	167286	167293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014378	GTTA	2	8	168365	168372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014378	AGAT	2	8	168494	168501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014378	TTCT	2	8	175531	175538	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014378	TTGA	2	8	190301	190308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014378	AGGG	2	8	193703	193710	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014378	GAAA	2	8	198526	198533	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014378	TTTA	2	8	199430	199437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014378	TAAA	2	8	199542	199549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014378	AGTG	2	8	199852	199859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014378	CGAA	2	8	199871	199878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014378	ATGA	2	8	199919	199926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014378	ATTA	2	8	200066	200073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014378	ATTC	2	8	204281	204288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014378	AAAT	2	8	206494	206501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014378	TAAT	2	8	211250	211257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014378	AAGT	2	8	211465	211472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014378	TACT	2	8	211644	211651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014378	CTAA	2	8	211879	211886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014378	AATT	2	8	214149	214156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014378	ATTA	2	8	221262	221269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014378	TAGA	2	8	221319	221326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014378	AGAA	2	8	223371	223378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014378	CCCG	2	8	223518	223525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_014378	GTAT	2	8	226248	226255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014378	CTAA	2	8	228521	228528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014378	TAAT	2	8	233666	233673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014378	ACAA	2	8	235805	235812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014378	AATG	2	8	235847	235854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014378	TAAA	2	8	235978	235985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014378	GCTG	2	8	236121	236128	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014378	TGAG	2	8	236466	236473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014378	GTCG	2	8	236597	236604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014378	TTAT	2	8	236734	236741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014378	CTAA	2	8	237065	237072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014378	ATGA	2	8	237212	237219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014378	GGAA	2	8	237478	237485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014378	AATT	2	8	237549	237556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_014378	ACGG	2	8	805526	805533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_014378	TAAA	2	8	805768	805775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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