MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 9692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014378	TAA	2	6	1339841	1339846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_014378	TCT	2	6	1339863	1339868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_014378	TAA	3	9	1339903	1339911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_014378	TCT	2	6	1339934	1339939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_014378	CAC	2	6	1339996	1340001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_014378	TGG	2	6	1340095	1340100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_014378	AATT	2	8	1340206	1340213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_014378	ATTT	2	8	1341268	1341275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_014378	CTT	2	6	1341379	1341384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_014378	CT	3	6	1341421	1341426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_014378	TCC	2	6	1341438	1341443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_014378	GTT	2	6	1341447	1341452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_014378	TCAC	2	8	1341489	1341496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_014378	TTCCT	2	10	1341531	1341540	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5515	NC_014378	TGT	2	6	1341553	1341558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_014378	ATC	3	9	1341563	1341571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_014378	ACTC	2	8	1341634	1341641	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_014378	TTC	2	6	1341727	1341732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_014378	TGC	2	6	1341735	1341740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_014378	TTC	2	6	1341749	1341754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_014378	CTT	2	6	1341769	1341774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_014378	CTC	2	6	1341794	1341799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_014378	TCG	2	6	1341812	1341817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_014378	GCA	2	6	1341834	1341839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_014378	ACA	2	6	1341856	1341861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_014378	TAT	2	6	1341919	1341924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_014378	TTA	2	6	1342065	1342070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_014378	TCA	2	6	1342241	1342246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_014378	CGTA	2	8	1342250	1342257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_014378	CTT	3	9	1342289	1342297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_014378	CCT	2	6	1343624	1343629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_014378	TAG	2	6	1343652	1343657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_014378	CTA	2	6	1343701	1343706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_014378	AGGA	2	8	1343791	1343798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_014378	TA	3	6	1343829	1343834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_014378	ACC	2	6	1343838	1343843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_014378	TCAT	2	8	1343885	1343892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5538	NC_014378	ACC	2	6	1343926	1343931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_014378	CTA	2	6	1343951	1343956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_014378	CCT	2	6	1344163	1344168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_014378	CCTAG	2	10	1344224	1344233	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5542	NC_014378	ACT	2	6	1345408	1345413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_014378	AT	3	6	1345440	1345445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_014378	ACT	2	6	1345516	1345521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_014378	CT	3	6	1345552	1345557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_014378	A	6	6	1345563	1345568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_014378	CAT	2	6	1345571	1345576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_014378	TAT	2	6	1345593	1345598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_014378	TAA	2	6	1345615	1345620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_014378	TCC	2	6	1345632	1345637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_014378	CAT	2	6	1345744	1345749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_014378	AGC	2	6	1345794	1345799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_014378	CTA	2	6	1345813	1345818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_014378	CCAG	2	8	1345839	1345846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_014378	A	6	6	1345883	1345888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_014378	AGA	2	6	1345909	1345914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_014378	A	6	6	1345979	1345984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_014378	AAGA	2	8	1346028	1346035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_014378	AAAT	2	8	1347298	1347305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_014378	TTACT	2	10	1347319	1347328	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5561	NC_014378	ATAAA	2	10	1347331	1347340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_014378	AT	3	6	1347351	1347356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_014378	TTA	2	6	1347384	1347389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_014378	TAA	2	6	1347413	1347418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_014378	A	6	6	1347434	1347439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_014378	TA	3	6	1347480	1347485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_014378	CTC	3	9	1349886	1349894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_014378	T	6	6	1349895	1349900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_014378	TAC	2	6	1349922	1349927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_014378	A	6	6	1349928	1349933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_014378	ATT	2	6	1349935	1349940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_014378	A	6	6	1349953	1349958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_014378	TAA	2	6	1349994	1349999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_014378	TCC	2	6	1351002	1351007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_014378	ATAA	2	8	1351018	1351025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_014378	AGGAAT	2	12	1351064	1351075	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_014378	TAT	2	6	1351112	1351117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_014378	ATTA	2	8	1351130	1351137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_014378	A	8	8	1351171	1351178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_014378	ATA	2	6	1351185	1351190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_014378	TA	3	6	1351248	1351253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_014378	TTATG	2	10	1351260	1351269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_014378	ATTTT	2	10	1351281	1351290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_014378	AGG	2	6	1351292	1351297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_014378	TA	3	6	1352290	1352295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_014378	GCA	2	6	1353328	1353333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_014378	CT	3	6	1353367	1353372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_014378	TAA	2	6	1353392	1353397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_014378	GAT	2	6	1353493	1353498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5591	NC_014378	TAC	2	6	1353577	1353582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_014378	CCG	2	6	1353644	1353649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_014378	A	6	6	1353698	1353703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_014378	TAA	2	6	1354547	1354552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_014378	TTTA	2	8	1354625	1354632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_014378	AAC	2	6	1355283	1355288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_014378	TTTAA	2	10	1356705	1356714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_014378	CCT	2	6	1356772	1356777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_014378	TAA	2	6	1356809	1356814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_014378	GATA	2	8	1356845	1356852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_014378	AAAATT	2	12	1356870	1356881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_014378	AAAT	2	8	1356944	1356951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_014378	AT	3	6	1356953	1356958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_014378	TAA	2	6	1356966	1356971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_014378	TAT	2	6	1356995	1357000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_014378	ATT	2	6	1357074	1357079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_014378	TA	3	6	1357120	1357125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_014378	AAT	2	6	1357130	1357135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_014378	ACC	2	6	1358001	1358006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_014378	TAAAA	2	10	1358057	1358066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_014378	A	7	7	1358063	1358069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_014378	AT	3	6	1358073	1358078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_014378	CAG	2	6	1358135	1358140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_014378	TAAA	2	8	1358141	1358148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_014378	TC	3	6	1358193	1358198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_014378	TCTGT	2	10	1358294	1358303	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5617	NC_014378	AT	3	6	1358321	1358326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_014378	AT	3	6	1358362	1358367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_014378	TAT	2	6	1358370	1358375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_014378	GCG	2	6	1358484	1358489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_014378	A	6	6	1358562	1358567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_014378	ACT	2	6	1358610	1358615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_014378	CCT	2	6	1359260	1359265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_014378	TTTAT	2	10	1359274	1359283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_014378	CTG	2	6	1359311	1359316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_014378	A	7	7	1359321	1359327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_014378	CCT	2	6	1359709	1359714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_014378	GCT	2	6	1359733	1359738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_014378	ATT	3	9	1359747	1359755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_014378	AAT	2	6	1359765	1359770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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