MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei U32 chromosome

Total Repeats: 25997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014318	CCGCG	2	10	6463814	6463823	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16002	NC_014318	GCG	3	9	6463821	6463829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_014318	GCGG	2	8	6464310	6464317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16004	NC_014318	GAC	2	6	6464349	6464354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_014318	ACGCG	2	10	6464374	6464383	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16006	NC_014318	CGC	2	6	6464402	6464407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16007	NC_014318	CGC	2	6	6464477	6464482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16008	NC_014318	GCT	2	6	6464500	6464505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_014318	ACGG	2	8	6464891	6464898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16010	NC_014318	CG	4	8	6464919	6464926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16011	NC_014318	TCA	2	6	6464965	6464970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_014318	CT	4	8	6464999	6465006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16013	NC_014318	CCT	2	6	6465050	6465055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16014	NC_014318	GC	3	6	6465070	6465075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16015	NC_014318	ACGGCA	2	12	6466779	6466790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_014318	CCG	2	6	6467542	6467547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16017	NC_014318	CTG	2	6	6467588	6467593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_014318	CTG	2	6	6467605	6467610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_014318	GGA	2	6	6467658	6467663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_014318	CTG	2	6	6469492	6469497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_014318	G	6	6	6469534	6469539	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_014318	CTGC	2	8	6469614	6469621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16023	NC_014318	GC	4	8	6469727	6469734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16024	NC_014318	TGA	3	9	6469747	6469755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_014318	GCT	2	6	6469771	6469776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_014318	AGC	2	6	6469875	6469880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_014318	GCC	3	9	6469892	6469900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16028	NC_014318	CAG	2	6	6469904	6469909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16029	NC_014318	CGGGC	2	10	6469910	6469919	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16030	NC_014318	GGTG	2	8	6469929	6469936	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_014318	GTC	2	6	6469958	6469963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_014318	GGC	2	6	6470010	6470015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_014318	CCA	2	6	6470049	6470054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16034	NC_014318	CCA	2	6	6470070	6470075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16035	NC_014318	TCC	2	6	6470534	6470539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16036	NC_014318	GACGGC	2	12	6470541	6470552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_014318	GCG	2	6	6470578	6470583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_014318	GCA	2	6	6470652	6470657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_014318	CGGTC	2	10	6470673	6470682	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16040	NC_014318	GGC	2	6	6470964	6470969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_014318	CGG	2	6	6470991	6470996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_014318	CGG	2	6	6471007	6471012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_014318	CGA	2	6	6471648	6471653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_014318	GAC	2	6	6471675	6471680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_014318	CGA	2	6	6471715	6471720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_014318	AGG	2	6	6471726	6471731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_014318	CGG	2	6	6472612	6472617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_014318	TGT	2	6	6472629	6472634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_014318	CTC	2	6	6472690	6472695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16050	NC_014318	CGG	2	6	6472720	6472725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_014318	CCGGCA	2	12	6472734	6472745	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16052	NC_014318	GCC	2	6	6472863	6472868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16053	NC_014318	ATC	2	6	6472885	6472890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_014318	GGC	2	6	6475411	6475416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_014318	TAC	2	6	6475422	6475427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_014318	C	6	6	6475460	6475465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16057	NC_014318	GCC	2	6	6480526	6480531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16058	NC_014318	GTTC	2	8	6480552	6480559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16059	NC_014318	ATG	2	6	6480593	6480598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_014318	CCG	3	9	6480608	6480616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16061	NC_014318	ACC	2	6	6480619	6480624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16062	NC_014318	CTC	2	6	6483055	6483060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16063	NC_014318	CCG	2	6	6483080	6483085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16064	NC_014318	ACC	2	6	6483102	6483107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16065	NC_014318	CGG	3	9	6483152	6483160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_014318	CGC	3	9	6483513	6483521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16067	NC_014318	CTT	2	6	6484761	6484766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16068	NC_014318	CG	3	6	6492329	6492334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16069	NC_014318	CCT	2	6	6494786	6494791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16070	NC_014318	ACA	2	6	6494811	6494816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_014318	GACG	2	8	6494856	6494863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16072	NC_014318	CACCGG	2	12	6494866	6494877	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16073	NC_014318	AGGC	2	8	6494879	6494886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16074	NC_014318	GCC	2	6	6497299	6497304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16075	NC_014318	CGC	2	6	6497310	6497315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16079	NC_014318	GAG	2	6	6498851	6498856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_014318	CCACG	2	10	6498867	6498876	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16081	NC_014318	CGG	2	6	6498957	6498962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16082	NC_014318	CGC	2	6	6499465	6499470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16083	NC_014318	ACG	3	9	6499506	6499514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_014318	TTG	2	6	6499516	6499521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16086	NC_014318	CCTG	2	8	6503598	6503605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16087	NC_014318	CGGG	2	8	6503618	6503625	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16088	NC_014318	GCC	2	6	6504162	6504167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16089	NC_014318	CCGC	2	8	6504187	6504194	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16090	NC_014318	CGGGC	2	10	6504212	6504221	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16091	NC_014318	GCC	2	6	6504225	6504230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16092	NC_014318	GC	3	6	6504256	6504261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16093	NC_014318	CG	3	6	6504266	6504271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16094	NC_014318	CG	3	6	6504280	6504285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16095	NC_014318	CCGT	2	8	6504955	6504962	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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16097	NC_014318	GGT	2	6	6509567	6509572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_014318	GCCG	2	8	6509593	6509600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16099	NC_014318	TCA	2	6	6509666	6509671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16103	NC_014318	GGC	2	6	6509836	6509841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_014318	GC	3	6	6509844	6509849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16105	NC_014318	GCA	2	6	6509894	6509899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_014318	CGC	2	6	6510216	6510221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_014318	CAG	2	6	6510235	6510240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_014318	GC	3	6	6510241	6510246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16109	NC_014318	GCT	2	6	6510273	6510278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_014318	CGG	2	6	6510285	6510290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_014318	GGC	2	6	6510313	6510318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_014318	CG	3	6	6510448	6510453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16113	NC_014318	CGT	2	6	6512190	6512195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_014318	ACC	2	6	6512211	6512216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16115	NC_014318	CCA	2	6	6512233	6512238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16116	NC_014318	GC	4	8	6512246	6512253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_014318	TCC	2	6	6513096	6513101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16118	NC_014318	CCG	2	6	6513190	6513195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16119	NC_014318	GAC	2	6	6513197	6513202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_014318	TCC	2	6	6513232	6513237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16121	NC_014318	GTC	2	6	6513339	6513344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_014318	CGC	2	6	6513365	6513370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16123	NC_014318	C	6	6	6513376	6513381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16124	NC_014318	GC	3	6	6513427	6513432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16125	NC_014318	CGG	2	6	6513477	6513482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_014318	CG	3	6	6513502	6513507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16128	NC_014318	GCG	2	6	6515051	6515056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16248	NC_014318	GCA	2	6	6547523	6547528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16251	NC_014318	CT	3	6	6547864	6547869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16252	NC_014318	CTT	2	6	6547877	6547882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16253	NC_014318	A	6	6	6547926	6547931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16254	NC_014318	CTG	2	6	6547999	6548004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16257	NC_014318	ACCT	2	8	6548094	6548101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16258	NC_014318	AAT	2	6	6548105	6548110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16259	NC_014318	CCA	2	6	6548142	6548147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16261	NC_014318	CT	3	6	6548298	6548303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16262	NC_014318	GC	3	6	6548333	6548338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16499	NC_014318	GCTC	2	8	6646998	6647005	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16500	NC_014318	CGGAC	2	10	6647097	6647106	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

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