MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcanobacterium haemolyticum DSM 20595 chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014218	GACGCT	2	12	16362	16373	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014218	GGCGCC	2	12	60804	60815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014218	TGATCT	2	12	92017	92028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014218	AGTAAT	2	12	98944	98955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014218	CACAAC	2	12	128797	128808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014218	GCAGGA	2	12	251164	251175	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014218	CTAGGC	2	12	271847	271858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014218	CGGCTG	2	12	316039	316050	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014218	CGGCTG	2	12	316063	316074	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014218	CTGTGG	2	12	385812	385823	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014218	GAGTAA	2	12	386217	386228	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014218	GTACTG	2	12	470798	470809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014218	GGGTGT	2	12	493533	493544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014218	GTGTGG	2	12	495434	495445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014218	TTAACG	2	12	527572	527583	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014218	ACTTTT	2	12	531049	531060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014218	TATCTG	2	12	540391	540402	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014218	CCTTTC	2	12	554193	554204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014218	TTTTGG	2	12	582615	582626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014218	GGTAAA	2	12	585293	585304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014218	CTTCGT	2	12	594866	594877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014218	TGGTGT	2	12	615489	615500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014218	TGCGGG	2	12	615969	615980	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014218	TATGTC	2	12	696387	696398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014218	CGCTAT	2	12	754614	754625	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014218	ACCTTA	2	12	789906	789917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014218	CGGTAA	2	12	823406	823417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014218	ACAGAT	2	12	897515	897526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014218	CGGATG	2	12	897913	897924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014218	GAAGAT	2	12	912118	912129	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014218	CAGATT	2	12	952847	952858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014218	AGCCCG	2	12	1007394	1007405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014218	GGTACG	2	12	1008327	1008338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014218	ACAACC	2	12	1022786	1022797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014218	GTCTTT	2	12	1069412	1069423	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014218	ACACCA	2	12	1073053	1073064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014218	GCAGAA	2	12	1074582	1074593	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014218	CACCCA	2	12	1074964	1074975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014218	CAAAAC	2	12	1109308	1109319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014218	TTATTT	2	12	1110179	1110190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014218	ACATTG	2	12	1149155	1149166	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014218	TGAGGT	2	12	1172577	1172588	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014218	TACACC	2	12	1202273	1202284	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014218	TGTGGG	2	12	1202744	1202755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014218	CCCACA	2	12	1202775	1202786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014218	CCTGGG	2	12	1247099	1247110	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014218	GTAACA	2	12	1344201	1344212	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014218	TACCAC	2	12	1345409	1345420	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014218	GAAAAC	2	12	1349358	1349369	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014218	ATTTCT	2	12	1458293	1458304	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014218	TTCACT	2	12	1546617	1546628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014218	GCGGGG	2	12	1546633	1546644	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014218	ACACCA	2	12	1609875	1609886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014218	GCAGAA	2	12	1611402	1611413	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014218	CACCCA	2	12	1611786	1611797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014218	CCTGCG	2	12	1655093	1655104	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014218	CAACCT	2	12	1670988	1670999	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014218	GGTGAA	2	12	1682826	1682837	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014218	CTGACG	2	12	1694851	1694862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014218	TCTTGA	2	12	1700579	1700590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014218	TCTGAA	2	12	1790596	1790607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014218	CTCCAG	2	12	1790645	1790656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014218	CGCAAG	2	12	1790709	1790720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014218	AGGAAG	2	12	1806811	1806822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014218	ACACCA	2	12	1814416	1814427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014218	GATATA	2	12	1868439	1868450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014218	GAACTG	2	12	1868579	1868590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014218	TGGGGT	2	12	1878547	1878558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014218	ACCCCA	2	12	1878579	1878590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014218	CGAGAC	2	12	1885292	1885303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014218	TCCATA	2	12	1901449	1901460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014218	GTGTAC	2	12	1913532	1913543	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014218	TATTTC	3	18	1914237	1914254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014218	TTTCCT	2	12	1914788	1914799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014218	AGTGGA	2	12	1938241	1938252	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014218	ACCAAC	2	12	1957401	1957412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014218	ACAAAG	2	12	1958161	1958172	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014218	TCACTT	2	12	1968778	1968789	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.