MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aminobacterium colombiense DSM 12261 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014011	TACAC	2	10	7359	7368	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014011	TCTTT	2	10	9210	9219	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014011	TCCAC	2	10	18130	18139	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_014011	TTTTC	2	10	18201	18210	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014011	AAAGG	2	10	30518	30527	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014011	TTTTC	2	10	32216	32225	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014011	CTTTT	2	10	46310	46319	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014011	TTCTA	2	10	46361	46370	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014011	GAAAA	2	10	50026	50035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014011	GCTTT	2	10	59458	59467	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014011	TTCCT	2	10	86949	86958	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014011	TATGG	2	10	87019	87028	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014011	TTCCT	2	10	91711	91720	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014011	ATACT	2	10	91971	91980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014011	TGGAT	2	10	101261	101270	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014011	ACAGA	2	10	105872	105881	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014011	GATGT	2	10	106943	106952	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014011	TTTTG	2	10	112486	112495	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014011	CTCTT	2	10	112979	112988	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014011	TAAAT	2	10	123788	123797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014011	ATTTT	2	10	124135	124144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014011	GTGGC	2	10	128976	128985	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014011	AGAAT	2	10	139793	139802	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014011	TCTAT	2	10	145506	145515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014011	CATAC	2	10	174595	174604	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014011	TTGTT	2	10	181894	181903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014011	AAACA	2	10	181971	181980	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014011	GGGGC	2	10	215843	215852	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014011	GGTAC	2	10	239719	239728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014011	TTATA	2	10	263106	263115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014011	TCGTG	2	10	300896	300905	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014011	GTTGT	2	10	301772	301781	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014011	TTTCT	2	10	317145	317154	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014011	TATCA	2	10	350207	350216	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014011	CGAAG	2	10	384026	384035	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014011	AAATA	2	10	385471	385480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014011	TTCAG	2	10	390513	390522	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014011	ATCAA	2	10	397263	397272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014011	TCGTG	2	10	418922	418931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014011	GTTGT	2	10	419798	419807	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014011	TAAAA	2	10	425323	425332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014011	CGAAG	2	10	430893	430902	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014011	AAGGG	2	10	430942	430951	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014011	TGATT	2	10	447219	447228	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014011	ATATT	2	10	449874	449883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014011	TAGAG	2	10	468789	468798	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014011	ATATA	2	10	487180	487189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014011	TGAGG	2	10	490974	490983	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014011	GTAGG	2	10	493686	493695	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014011	AATAC	2	10	500063	500072	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014011	ATTTC	2	10	514083	514092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014011	ATAAA	2	10	515396	515405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014011	CAATA	2	10	526009	526018	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014011	GATCA	2	10	532145	532154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014011	ATTTT	2	10	539415	539424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014011	TAAAG	2	10	539652	539661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014011	TTTTC	2	10	555463	555472	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014011	AGGTC	2	10	555540	555549	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014011	GCCTT	2	10	555956	555965	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014011	TTTGC	2	10	566838	566847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014011	CTTTT	2	10	567293	567302	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014011	TATAA	2	10	584682	584691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014011	CCTTT	2	10	596536	596545	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014011	GTTGT	2	10	651551	651560	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014011	ATTTA	2	10	661616	661625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014011	ATTAA	2	10	731968	731977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014011	AGGTA	2	10	734128	734137	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014011	AAAGA	2	10	734470	734479	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014011	TGATT	2	10	736550	736559	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014011	AGAGA	2	10	736698	736707	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014011	GAGAG	2	10	738471	738480	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014011	TCGTG	2	10	795975	795984	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014011	GCTAT	2	10	796482	796491	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014011	GTTGT	2	10	797053	797062	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014011	TATGG	2	10	800127	800136	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014011	TAAGG	2	10	823218	823227	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014011	AAAAG	2	10	828157	828166	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014011	TCTTT	2	10	834790	834799	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014011	TGTTA	2	10	837609	837618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014011	TATCA	2	10	837755	837764	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014011	TAAAA	2	10	846873	846882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014011	TTTTA	2	10	847221	847230	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014011	TTTCT	2	10	878681	878690	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014011	AAGAA	2	10	878814	878823	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014011	CAAAG	2	10	879929	879938	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014011	GCTTG	2	10	880836	880845	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014011	AATCC	2	10	897236	897245	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014011	TATCA	2	10	897313	897322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014011	GTGCC	2	10	941919	941928	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014011	TTAAG	2	10	943440	943449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014011	CTTTT	2	10	946068	946077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014011	CATCC	2	10	947088	947097	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_014011	TATCC	2	10	951379	951388	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014011	TCATA	2	10	955353	955362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014011	CTTGT	2	10	955818	955827	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014011	CTTCT	2	10	962373	962382	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014011	TAACA	2	10	967106	967115	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014011	TCATC	2	10	968194	968203	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014011	TTTTC	2	10	975756	975765	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014011	CAAGA	2	10	976047	976056	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014011	TGTGA	2	10	977570	977579	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014011	GAAAT	2	10	980997	981006	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014011	AAGTT	2	10	981260	981269	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014011	ACTTA	2	10	984698	984707	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014011	TTACA	2	10	992770	992779	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014011	TTTCT	2	10	1045200	1045209	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014011	CCCTT	2	10	1056303	1056312	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_014011	TGCAT	2	10	1074580	1074589	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014011	ATCTG	2	10	1106892	1106901	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014011	TTTAG	2	10	1116910	1116919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014011	TTTAA	2	10	1118098	1118107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014011	ATATT	2	10	1160524	1160533	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014011	TTAAT	2	10	1160592	1160601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014011	ACTAA	2	10	1167742	1167751	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014011	CAACT	2	10	1168713	1168722	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014011	TCACC	2	10	1169970	1169979	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_014011	TTCCC	2	10	1193373	1193382	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_014011	CCTCA	2	10	1222321	1222330	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_014011	TACTG	2	10	1224673	1224682	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014011	ATTTT	2	10	1226928	1226937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014011	CACTC	2	10	1232599	1232608	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_014011	GAACA	2	10	1244828	1244837	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014011	ATCGT	2	10	1268444	1268453	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014011	TAAAA	2	10	1272425	1272434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014011	TAAAA	2	10	1273670	1273679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014011	CACTG	2	10	1278758	1278767	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014011	AAAAG	2	10	1280293	1280302	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014011	CTATT	2	10	1280450	1280459	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014011	TTATA	2	10	1285897	1285906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014011	GAATA	2	10	1299441	1299450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014011	TCTAA	2	10	1304548	1304557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014011	GTAAC	2	10	1304701	1304710	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014011	TTTCT	2	10	1313111	1313120	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014011	TTTCT	2	10	1326127	1326136	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014011	AAAAT	2	10	1344690	1344699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014011	AAAAC	2	10	1359633	1359642	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014011	TGATT	2	10	1359879	1359888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014011	ATTGT	2	10	1366994	1367003	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014011	CATAA	2	10	1381427	1381436	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014011	TTTAA	2	10	1384482	1384491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014011	TAGGC	2	10	1390761	1390770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014011	AACTT	2	10	1393399	1393408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014011	ATAAC	2	10	1395334	1395343	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014011	ATATT	2	10	1459337	1459346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014011	TTTTA	2	10	1464668	1464677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014011	ATATG	2	10	1482297	1482306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014011	CTCAA	2	10	1512029	1512038	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014011	TTTTA	2	10	1541429	1541438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014011	TATAT	2	10	1546911	1546920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014011	TATAT	2	10	1581771	1581780	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014011	TCAGG	2	10	1593787	1593796	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_014011	TTAAA	2	10	1594773	1594782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014011	GTTTC	2	10	1613976	1613985	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_014011	GAGGT	2	10	1615170	1615179	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014011	ATGTC	2	10	1630098	1630107	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_014011	AAATT	2	10	1645203	1645212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014011	TATCA	2	10	1651999	1652008	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_014011	TATTC	2	10	1653437	1653446	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_014011	TTAAT	2	10	1665034	1665043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014011	TATAA	2	10	1672587	1672596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014011	ATTAA	2	10	1695704	1695713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014011	TCTCT	2	10	1698235	1698244	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_014011	ATATA	2	10	1729439	1729448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014011	ACTTA	2	10	1729450	1729459	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_014011	TAATA	2	10	1730824	1730833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014011	ATCCT	2	10	1760778	1760787	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
167	NC_014011	TAAAA	2	10	1781982	1781991	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014011	GGTGT	2	10	1788506	1788515	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014011	TGTGA	2	10	1791303	1791312	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014011	TTTTG	2	10	1809732	1809741	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014011	ATTGA	2	10	1810547	1810556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014011	CTTTT	2	10	1811874	1811883	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_014011	CTCTC	2	10	1823581	1823590	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
174	NC_014011	CTTTA	2	10	1880206	1880215	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_014011	GATCA	2	10	1905570	1905579	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
176	NC_014011	TAAAT	2	10	1914577	1914586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014011	GAAGA	2	10	1931045	1931054	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014011	TTTTG	2	10	1932940	1932949	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014011	TGGAG	2	10	1946606	1946615	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014011	CTAGG	2	10	1946787	1946796	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
181	NC_014011	CGCCA	2	10	1950871	1950880	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
182	NC_014011	TTTCA	2	10	1956074	1956083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.