MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013926	GAAA	2	8	2153	2160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013926	AAAT	2	8	14190	14197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013926	TCCG	2	8	15007	15014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013926	AGGT	2	8	16175	16182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013926	TGGG	2	8	16649	16656	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013926	TGAA	2	8	22493	22500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013926	TTTA	2	8	39484	39491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013926	TAAA	2	8	42976	42983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013926	AAGA	2	8	48722	48729	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013926	TAAA	2	8	50239	50246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013926	AAAT	2	8	52344	52351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013926	CCCG	2	8	56536	56543	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_013926	GAAA	2	8	56586	56593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013926	ATAA	2	8	56686	56693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013926	TACC	2	8	57927	57934	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013926	TTTA	2	8	62580	62587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013926	ATTA	2	8	70005	70012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013926	GGAT	2	8	88152	88159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013926	TTTA	2	8	88170	88177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013926	TTCT	2	8	88178	88185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013926	GGAT	2	8	120653	120660	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013926	ATTT	2	8	122642	122649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013926	ATTT	2	8	125926	125933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013926	TATT	2	8	126571	126578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013926	AATT	2	8	130333	130340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013926	CATA	2	8	130463	130470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013926	TCCC	2	8	132772	132779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_013926	GAAA	2	8	138107	138114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013926	ATTT	2	8	138224	138231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013926	AAAT	2	8	138278	138285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013926	CAGG	2	8	138310	138317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013926	ATAA	2	8	138362	138369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013926	AGCA	2	8	139809	139816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013926	AAGG	2	8	141748	141755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013926	TTTA	2	8	142590	142597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013926	CTAT	2	8	144780	144787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013926	GACA	2	8	149109	149116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013926	AAAG	2	8	151116	151123	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013926	ATCA	2	8	155173	155180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013926	GAAT	2	8	171578	171585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013926	GCCC	2	8	193014	193021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_013926	GGGA	2	8	197693	197700	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013926	TCAT	2	8	199995	200002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013926	TTAA	2	8	234335	234342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013926	TCCC	2	8	245591	245598	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_013926	TTTA	2	8	247944	247951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013926	ATAA	2	8	251130	251137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013926	AAGA	2	8	251230	251237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013926	TTTA	2	8	252087	252094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013926	AAAT	2	8	254051	254058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013926	TTAT	2	8	262808	262815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013926	AAAT	2	8	264616	264623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013926	AATT	2	8	264901	264908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013926	AAAT	2	8	265010	265017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013926	TGAA	2	8	268012	268019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013926	ATCC	2	8	278088	278095	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013926	CAAA	2	8	279509	279516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013926	TAAA	2	8	321090	321097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013926	CATT	2	8	331347	331354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013926	TGAA	2	8	354391	354398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013926	TAGT	2	8	356375	356382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013926	TATT	2	8	366152	366159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013926	AATA	2	8	370303	370310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013926	AATT	2	8	380156	380163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013926	TTCA	2	8	380174	380181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013926	TGCA	2	8	393002	393009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013926	GAGT	2	8	394747	394754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013926	AAGG	2	8	401721	401728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013926	TATT	2	8	406021	406028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013926	TTAT	2	8	412055	412062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013926	AATC	2	8	417058	417065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013926	TTAA	2	8	429983	429990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013926	TTTA	2	8	436716	436723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013926	TGAT	2	8	436760	436767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013926	ATTT	2	8	449521	449528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013926	AGAA	2	8	452303	452310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013926	TTTG	2	8	453800	453807	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013926	CGGG	2	8	453997	454004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013926	AGAA	2	8	454200	454207	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013926	GAAA	2	8	454222	454229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013926	CCGG	2	8	454265	454272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013926	TTTA	2	8	455805	455812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013926	GTGG	2	8	478751	478758	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013926	CTTC	2	8	489340	489347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013926	ATTT	2	8	493240	493247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013926	TACT	2	8	493256	493263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013926	ATTT	2	8	496329	496336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013926	TTTA	2	8	499036	499043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013926	ATTT	2	8	500224	500231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013926	TTTC	2	8	507273	507280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013926	TAAA	2	8	508222	508229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013926	AATT	2	8	511643	511650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013926	CATT	2	8	512498	512505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013926	TAAA	2	8	524683	524690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013926	TAAA	2	8	529665	529672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013926	TAAT	2	8	530516	530523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013926	AAGG	2	8	533276	533283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013926	TTTA	2	8	534118	534125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013926	TAAT	2	8	536181	536188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013926	TTAA	2	8	539043	539050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013926	AAAG	2	8	540880	540887	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013926	AAAT	2	8	546045	546052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013926	CTTT	2	8	546213	546220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013926	ATAG	2	8	562687	562694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013926	TATT	2	8	571833	571840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013926	ATTA	2	8	574463	574470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013926	CGGG	2	8	574534	574541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013926	GTGA	2	8	578175	578182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013926	AAAT	2	8	579931	579938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013926	TATT	2	8	583523	583530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013926	TTTA	2	8	585699	585706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013926	TTTA	2	8	595019	595026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013926	TGAG	2	8	596210	596217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013926	ATAA	2	8	621024	621031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013926	TTAT	2	8	633690	633697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013926	ATGT	2	8	648033	648040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013926	TAAT	2	8	659099	659106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013926	TGAT	2	8	670844	670851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013926	TAAA	2	8	687167	687174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013926	ATTT	2	8	694815	694822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013926	AAGA	2	8	701144	701151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013926	AAAG	2	8	701291	701298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013926	CATA	2	8	701383	701390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013926	AAGG	2	8	701579	701586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013926	AGGA	2	8	702943	702950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013926	CTAA	2	8	703436	703443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013926	CGGG	2	8	705013	705020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013926	AAAG	2	8	705042	705049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013926	TCAA	2	8	705110	705117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013926	AGGG	2	8	705165	705172	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013926	GATA	2	8	713195	713202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013926	AAGG	2	8	725713	725720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013926	TTTA	2	8	726555	726562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013926	AGAA	2	8	731818	731825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013926	GAAT	2	8	738755	738762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013926	AAGG	2	8	738882	738889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013926	TATT	2	8	745829	745836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013926	ATAA	2	8	755865	755872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013926	TCCT	2	8	756707	756714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013926	GAAA	2	8	763876	763883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013926	TTAA	2	8	774513	774520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013926	CTTT	2	8	797702	797709	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013926	TTTC	2	8	797773	797780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013926	CTTT	2	8	797793	797800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013926	AAAG	2	8	797804	797811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013926	GATA	2	8	800699	800706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013926	TTAT	3	12	809349	809360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013926	ATGA	2	8	825956	825963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013926	TCAC	2	8	826078	826085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013926	AGAA	2	8	832550	832557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013926	CTTT	2	8	841996	842003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013926	CGGG	2	8	860881	860888	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.