MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510f

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013860	CCTGC	2	10	8219	8228	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013860	GGCCG	2	10	15213	15222	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013860	ATGGT	2	10	36500	36509	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013860	AGGAC	2	10	38337	38346	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013860	CATAG	2	10	40047	40056	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013860	CGGCA	2	10	47497	47506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013860	GTCGG	2	10	47578	47587	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013860	GATCC	2	10	47598	47607	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013860	TCCCC	2	10	50587	50596	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10	NC_013860	TTCCC	2	10	56477	56486	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_013860	TCGCG	2	10	57229	57238	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013860	TGTCG	2	10	59214	59223	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013860	ATCAC	2	10	70019	70028	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013860	TGTCG	2	10	71364	71373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013860	GGCAA	2	10	79185	79194	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013860	CTTGC	2	10	79198	79207	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013860	TGTCG	2	10	102344	102353	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013860	GCGCC	2	10	111096	111105	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_013860	TGGCA	2	10	129609	129618	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013860	CCTGT	2	10	132795	132804	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013860	CGGGA	2	10	145106	145115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013860	GAGGC	2	10	148694	148703	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013860	GCGCC	2	10	151729	151738	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_013860	GGGCC	2	10	154250	154259	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013860	TCCGG	2	10	157166	157175	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013860	ATCGC	2	10	158631	158640	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013860	AAAAG	2	10	196772	196781	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013860	TGATC	2	10	196817	196826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013860	AGCGG	2	10	232878	232887	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013860	GTCCT	2	10	233058	233067	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013860	CCGTC	2	10	233088	233097	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_013860	GGCTC	2	10	238632	238641	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013860	ATTTC	2	10	238663	238672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013860	TGTGC	2	10	241808	241817	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.