MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510f

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013860	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013860	TGT	2	6	13	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013860	GAG	2	6	149	154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013860	CAC	2	6	202	207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013860	GAG	2	6	381	386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013860	ATG	2	6	1710	1715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013860	CGT	2	6	8317	8322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013860	AGG	2	6	8324	8329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013860	GCC	2	6	10014	10019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013860	GGT	2	6	10048	10053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013860	CCT	2	6	10419	10424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013860	GGT	2	6	13703	13708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013860	ATT	2	6	13727	13732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013860	TCA	2	6	16485	16490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013860	CCT	2	6	16555	16560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013860	CCG	2	6	20489	20494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013860	GCG	2	6	23485	23490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013860	GGC	2	6	23500	23505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013860	TGG	2	6	23751	23756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013860	GCC	2	6	23762	23767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013860	GTA	2	6	23886	23891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013860	CTT	2	6	23895	23900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013860	TTC	2	6	23954	23959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013860	CTG	2	6	25966	25971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013860	CCT	2	6	26093	26098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013860	TTC	2	6	26378	26383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013860	CCG	2	6	28849	28854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013860	TGC	2	6	29492	29497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013860	TCC	2	6	31870	31875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013860	GCC	2	6	31876	31881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013860	GTC	2	6	31944	31949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013860	TGG	2	6	36349	36354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013860	TAT	2	6	36537	36542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013860	CGG	2	6	38224	38229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013860	ATC	2	6	45728	45733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013860	CAG	2	6	45748	45753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013860	GGC	2	6	45762	45767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013860	CGT	2	6	45857	45862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013860	CGT	2	6	47536	47541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013860	GAA	2	6	47620	47625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013860	ATC	2	6	47698	47703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013860	TTG	2	6	50608	50613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013860	AGG	2	6	55419	55424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013860	CGG	3	9	56492	56500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013860	GGC	2	6	57244	57249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013860	AAC	2	6	57349	57354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013860	GGA	2	6	57355	57360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013860	AGA	2	6	57361	57366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013860	GGA	2	6	58870	58875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013860	GTT	2	6	58895	58900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013860	GCA	2	6	58933	58938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013860	GCC	2	6	59002	59007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013860	TAG	2	6	59032	59037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013860	CGG	2	6	59051	59056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013860	GAG	2	6	59079	59084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013860	GGT	2	6	59090	59095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013860	GGC	2	6	60366	60371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013860	GAG	2	6	61176	61181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013860	GCG	2	6	61340	61345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013860	TGA	2	6	61456	61461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013860	GGC	2	6	61477	61482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013860	GAC	2	6	61504	61509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013860	CGA	2	6	61536	61541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013860	CGA	2	6	61560	61565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013860	TCT	2	6	61572	61577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013860	CCA	3	9	63084	63092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013860	CGC	2	6	63108	63113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013860	GCG	2	6	63121	63126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013860	CGA	2	6	63129	63134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013860	ATC	2	6	63160	63165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013860	GGC	2	6	63207	63212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013860	CGG	2	6	63243	63248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013860	CGG	2	6	63266	63271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013860	GTG	2	6	63335	63340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013860	AGG	2	6	63398	63403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013860	CGA	2	6	69472	69477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013860	CGA	2	6	69557	69562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013860	AGC	2	6	69572	69577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013860	TCC	2	6	69581	69586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013860	GCG	2	6	69594	69599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013860	CAG	2	6	69676	69681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013860	CAC	2	6	69696	69701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_013860	CGA	2	6	69739	69744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013860	GCA	2	6	69787	69792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013860	CCG	2	6	69842	69847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013860	CAG	2	6	69914	69919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013860	GAT	2	6	69920	69925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013860	GAA	2	6	70003	70008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013860	CAG	3	9	70112	70120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013860	ATC	2	6	71290	71295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013860	GGC	2	6	72516	72521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013860	CTG	2	6	75833	75838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013860	CAT	2	6	75933	75938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013860	ATC	2	6	75952	75957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013860	ATC	2	6	75977	75982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013860	GAT	2	6	76693	76698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013860	GCC	2	6	76806	76811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013860	GAT	2	6	76812	76817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013860	AGC	2	6	76822	76827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013860	TCG	2	6	76860	76865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013860	CGA	2	6	76867	76872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013860	CCG	2	6	76893	76898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013860	GCG	2	6	76941	76946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013860	CGT	2	6	76980	76985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013860	GCC	2	6	76994	76999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013860	CGG	2	6	97509	97514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013860	TGC	2	6	97602	97607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013860	TGG	2	6	97654	97659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013860	ACC	3	9	97665	97673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_013860	TGG	2	6	97710	97715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013860	CAC	2	6	97735	97740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013860	ACG	2	6	97761	97766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013860	CCT	2	6	97873	97878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013860	CTT	2	6	97888	97893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013860	CGA	2	6	97894	97899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013860	GCA	2	6	98013	98018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013860	AGA	2	6	98029	98034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013860	CGG	2	6	98038	98043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013860	GAA	2	6	98095	98100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013860	ATT	2	6	98209	98214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013860	TGA	2	6	98216	98221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013860	CGG	2	6	98340	98345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013860	GGC	2	6	98994	98999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013860	ATG	2	6	101714	101719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013860	ATT	2	6	101769	101774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013860	TCG	2	6	101919	101924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013860	CGG	2	6	101961	101966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013860	TTC	2	6	102155	102160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013860	GAC	2	6	102225	102230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013860	CGG	2	6	102268	102273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013860	CCG	2	6	105425	105430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013860	GGC	2	6	106006	106011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013860	GGC	2	6	106369	106374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013860	GCG	2	6	106380	106385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013860	CGG	2	6	106398	106403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013860	GCG	2	6	106496	106501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013860	CTT	2	6	107467	107472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013860	ACA	2	6	107502	107507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013860	CGG	2	6	107514	107519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.