MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510c

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013857	GTCCG	2	10	2015	2024	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_013857	CGGGG	2	10	8942	8951	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013857	CGGCG	2	10	14184	14193	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013857	CTTCC	2	10	27522	27531	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_013857	CGGGA	2	10	33896	33905	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013857	TCCCC	2	10	47322	47331	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_013857	CTCAT	2	10	54893	54902	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013857	ACGAT	2	10	61998	62007	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013857	ACCTT	2	10	62318	62327	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013857	AGGGA	2	10	62340	62349	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013857	CCGCT	2	10	68200	68209	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_013857	AGCGG	2	10	68221	68230	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013857	GGGTG	2	10	82517	82526	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013857	GGTCA	2	10	83854	83863	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013857	CCGCC	2	10	89193	89202	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16	NC_013857	GGCGG	2	10	89218	89227	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013857	GTCGC	2	10	89249	89258	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013857	GACCG	2	10	95547	95556	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013857	GCCGC	2	10	107179	107188	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_013857	CCTGC	2	10	127775	127784	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_013857	GCACG	2	10	134176	134185	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013857	ATCCG	3	15	137348	137362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013857	CCCGG	2	10	163986	163995	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_013857	GGGGT	2	10	165120	165129	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013857	TGGAG	2	10	178762	178771	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013857	TCCGG	2	10	184886	184895	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013857	TCAGG	2	10	187201	187210	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013857	AGGCG	2	10	201397	201406	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013857	GCCTG	2	10	203176	203185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_013857	TCCGG	2	10	232134	232143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013857	AGGAA	2	10	232341	232350	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013857	CGCCT	2	10	234198	234207	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_013857	CACGG	2	10	242587	242596	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013857	CAGTC	2	10	264860	264869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013857	AAGCC	2	10	270840	270849	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013857	TCGGC	2	10	284187	284196	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_013857	CTTCG	2	10	289599	289608	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_013857	TTTCA	2	10	291009	291018	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013857	GGAGA	2	10	299452	299461	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013857	CCGCC	2	10	304400	304409	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
41	NC_013857	CTTCC	2	10	308081	308090	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_013857	GCGAA	2	10	344126	344135	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013857	TCCGC	2	10	347132	347141	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_013857	CCCCA	2	10	351147	351156	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_013857	GCCGG	2	10	354399	354408	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013857	CCTTC	2	10	356154	356163	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_013857	CGACC	2	10	365843	365852	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_013857	CCGGT	2	10	366914	366923	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013857	CCGGG	2	10	377208	377217	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013857	CGGCC	2	10	398745	398754	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_013857	TGGAG	2	10	410608	410617	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013857	ACGGC	2	10	418020	418029	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013857	CGTTC	2	10	419911	419920	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_013857	CATCA	2	10	429628	429637	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_013857	GGTTC	2	10	460450	460459	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013857	CCGGA	2	10	464188	464197	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_013857	GGGAT	2	10	484236	484245	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013857	TTCAA	2	10	485410	485419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013857	CCTCT	2	10	485428	485437	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_013857	ACGCG	2	10	486328	486337	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013857	TGATT	2	10	486375	486384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013857	TCCCG	2	10	487328	487337	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_013857	CACGA	2	10	488220	488229	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_013857	CCGAA	2	10	488267	488276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_013857	CCGAA	2	10	489114	489123	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013857	ATTAT	2	10	491698	491707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013857	CCGCG	2	10	505601	505610	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_013857	CCGCC	2	10	506476	506485	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
69	NC_013857	GCGCT	2	10	509371	509380	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_013857	TTGGC	2	10	517010	517019	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013857	TCCGG	2	10	524029	524038	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013857	TTTCC	2	10	526447	526456	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_013857	CGGCG	2	10	535498	535507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013857	GAATT	2	10	543458	543467	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013857	AAAGG	2	10	544377	544386	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013857	GCACC	2	10	553511	553520	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_013857	CCGCT	2	10	575088	575097	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_013857	TGGGC	2	10	575170	575179	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013857	GCCCC	2	10	575418	575427	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
80	NC_013857	CAATC	2	10	611975	611984	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_013857	CCCCG	2	10	615315	615324	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
82	NC_013857	CGTCG	2	10	618849	618858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013857	GCCAA	2	10	643459	643468	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013857	CGGGA	2	10	660222	660231	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013857	CGGCG	2	10	667058	667067	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.