MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510c

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013857	CGGG	2	8	5111	5118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013857	ACCG	2	8	8969	8976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013857	TCCC	2	8	10981	10988	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_013857	CCTC	2	8	12695	12702	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_013857	CGGG	2	8	15275	15282	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013857	GGCG	2	8	17242	17249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013857	GCTA	2	8	23623	23630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013857	AATA	2	8	23682	23689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013857	TGGT	2	8	23795	23802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013857	GTCT	2	8	25047	25054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013857	ATGT	2	8	51052	51059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013857	CGCC	2	8	52074	52081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_013857	GCCC	2	8	53563	53570	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_013857	CTGC	2	8	53634	53641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013857	GGGA	2	8	68317	68324	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013857	CCCT	2	8	68477	68484	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_013857	GGCA	2	8	68515	68522	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013857	CGCT	2	8	72476	72483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013857	CTCC	2	8	74444	74451	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_013857	GGGC	2	8	82479	82486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013857	CGAT	2	8	88162	88169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013857	TCTG	2	8	88401	88408	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013857	GCCG	2	8	88618	88625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013857	CGGC	2	8	88665	88672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013857	CGTC	2	8	88766	88773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013857	CCGC	2	8	89259	89266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_013857	CCGC	2	8	91073	91080	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_013857	GCCC	2	8	92254	92261	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_013857	GGCC	2	8	95278	95285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013857	CCGC	2	8	95511	95518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_013857	GGGT	2	8	95684	95691	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013857	GGGT	2	8	96850	96857	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013857	GGGC	2	8	96861	96868	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013857	CCGC	2	8	97166	97173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_013857	CTTT	2	8	107207	107214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013857	CCCG	2	8	109981	109988	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_013857	CCGC	2	8	110916	110923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_013857	TCGG	2	8	114798	114805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013857	TCGA	2	8	118243	118250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013857	GCGA	2	8	123757	123764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013857	GCCC	2	8	127013	127020	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_013857	CTGT	2	8	131407	131414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013857	GCTT	2	8	131455	131462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013857	CCGG	2	8	133016	133023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013857	GAAA	2	8	142937	142944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013857	CCGG	2	8	162497	162504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013857	AGGA	2	8	163967	163974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013857	ATCC	2	8	171879	171886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013857	CCGG	2	8	171905	171912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013857	GGCG	2	8	171990	171997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013857	TCCG	2	8	178636	178643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013857	CGGC	2	8	188822	188829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013857	GGGC	2	8	190047	190054	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013857	GCCG	2	8	190109	190116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013857	GCCT	2	8	190314	190321	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013857	TTCT	2	8	192294	192301	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013857	CCCG	2	8	198841	198848	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_013857	GGGA	2	8	198898	198905	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013857	TTCC	2	8	200445	200452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013857	TCGG	2	8	200460	200467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013857	TCCG	2	8	200477	200484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013857	GGGA	2	8	201322	201329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013857	ACGG	2	8	201351	201358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013857	CGGG	2	8	201362	201369	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013857	CCCT	2	8	204897	204904	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_013857	CCGT	2	8	216130	216137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013857	TTGT	2	8	217134	217141	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013857	GGAC	2	8	217606	217613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013857	CCCT	2	8	221501	221508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_013857	AGGC	2	8	221572	221579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013857	TCGG	2	8	227756	227763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013857	GGCC	2	8	227766	227773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013857	CCGG	2	8	230437	230444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013857	ATCC	2	8	231869	231876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013857	CCGG	2	8	231951	231958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013857	TCGG	2	8	232058	232065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013857	GCCT	2	8	232117	232124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013857	CTGT	2	8	232315	232322	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013857	GCCC	2	8	233624	233631	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_013857	ATCG	2	8	234227	234234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013857	GGCC	2	8	234954	234961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013857	AAAC	2	8	242662	242669	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013857	GCCG	2	8	246429	246436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013857	TTAT	2	8	249980	249987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013857	GTCG	2	8	255269	255276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013857	CGCC	2	8	256163	256170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_013857	GGCT	2	8	256308	256315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013857	GGTC	2	8	256614	256621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013857	CGGC	2	8	262737	262744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013857	GCGG	2	8	274432	274439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013857	GTAC	2	8	274478	274485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013857	CAGC	2	8	274687	274694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013857	CCTC	2	8	289676	289683	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_013857	CGAA	2	8	290722	290729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013857	TCGC	2	8	290802	290809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013857	GCCG	2	8	296938	296945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013857	GACG	2	8	296963	296970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013857	GAAA	2	8	297078	297085	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013857	CGCC	2	8	298321	298328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_013857	GCGG	2	8	299431	299438	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013857	TGAT	2	8	302282	302289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013857	GAGC	2	8	304136	304143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013857	GCCG	2	8	304348	304355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013857	CGGC	2	8	304389	304396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013857	CCGT	2	8	305248	305255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013857	CTTT	2	8	305268	305275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013857	CCGG	2	8	305308	305315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013857	CTCC	2	8	314208	314215	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_013857	TTCC	2	8	315383	315390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013857	TGTC	2	8	321880	321887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013857	CCGG	2	8	322042	322049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013857	CGAC	2	8	323557	323564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013857	CAAA	2	8	336607	336614	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013857	TCTA	2	8	339726	339733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013857	CTTC	2	8	339890	339897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013857	GCCT	2	8	339944	339951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013857	ACCG	2	8	344538	344545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013857	GCCG	3	12	344597	344608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013857	CTTG	2	8	350953	350960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013857	CCGC	2	8	351108	351115	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_013857	CCCT	2	8	352005	352012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
122	NC_013857	CCCT	2	8	354263	354270	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_013857	TTGT	2	8	354377	354384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013857	GATG	2	8	360865	360872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013857	AAAC	2	8	365621	365628	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013857	GGAT	2	8	369658	369665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013857	ATGG	2	8	376074	376081	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013857	CCGG	2	8	376161	376168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013857	CGCC	3	12	377448	377459	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_013857	CGGC	2	8	377502	377509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013857	TCCG	2	8	377908	377915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013857	GCCC	2	8	379721	379728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_013857	CGGA	2	8	386397	386404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013857	CCGG	2	8	386521	386528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013857	CTCC	2	8	389722	389729	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_013857	GCCC	2	8	398716	398723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_013857	ACGA	2	8	402341	402348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013857	GCCG	2	8	408126	408133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013857	CGCC	2	8	412106	412113	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_013857	AAAG	2	8	417849	417856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013857	CGCC	2	8	418168	418175	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_013857	GTCC	2	8	421530	421537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013857	CGCC	2	8	421675	421682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013857	GGCC	2	8	424941	424948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013857	GCGG	2	8	426831	426838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013857	CATG	2	8	429438	429445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013857	ATCG	2	8	429451	429458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013857	GACG	2	8	429548	429555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013857	TCGT	2	8	429799	429806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013857	ATTT	2	8	431069	431076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013857	CCAG	2	8	435837	435844	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013857	GCCG	2	8	435876	435883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.