MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510b

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013856	CCCTCC	2	12	21738	21749	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
2	NC_013856	GGGTAG	2	12	25030	25041	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013856	GGAGGG	2	12	32718	32729	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013856	TGGTTG	2	12	47730	47741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013856	TCCTTC	2	12	65678	65689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013856	TGCTCC	2	12	72990	73001	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013856	GCGCAG	2	12	93615	93626	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013856	GCGTCG	2	12	101502	101513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013856	CGACGC	2	12	140041	140052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013856	CATCGG	2	12	140731	140742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013856	TCGGCA	2	12	142196	142207	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013856	CAGGGC	2	12	143780	143791	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013856	CCAGGG	2	12	145056	145067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013856	CCAGGG	2	12	146290	146301	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013856	CCGGAG	2	12	152496	152507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013856	CCGTCT	2	12	189373	189384	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013856	GGCGTA	2	12	222010	222021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013856	CGTTCA	2	12	245733	245744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013856	GGCGCT	2	12	252814	252825	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013856	CGCTTC	2	12	252917	252928	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013856	GGCGCC	2	12	288597	288608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013856	GGGCCG	2	12	341567	341578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013856	TCTCCC	2	12	342550	342561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013856	TCCCCC	2	12	345547	345558	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
25	NC_013856	CCAATT	2	12	349300	349311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013856	GGGGGA	2	12	364553	364564	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013856	GCCACG	2	12	370810	370821	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013856	CCGCTT	2	12	410084	410095	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013856	TTTGAT	2	12	423869	423880	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013856	CCGGCC	2	12	480951	480962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013856	CCCGGA	2	12	509341	509352	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013856	CGCAGC	2	12	512227	512238	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013856	TTTCCG	2	12	520795	520806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013856	CGGAGC	2	12	568327	568338	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013856	CGACGC	2	12	593525	593536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013856	CCCGGA	2	12	603995	604006	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013856	GGAGGG	2	12	678240	678251	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013856	AGGAAC	2	12	702201	702212	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013856	CAGCCC	2	12	722337	722348	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013856	GCCGAT	2	12	723105	723116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013856	CTCGCG	2	12	723336	723347	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013856	GCCGAT	2	12	723489	723500	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.