MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510b

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013856	GCCGC	2	10	1921	1930	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013856	GAGTT	2	10	13094	13103	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013856	TCCTC	2	10	31553	31562	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_013856	GCTGT	2	10	59751	59760	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013856	AATTA	2	10	62823	62832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013856	GGGTC	2	10	63051	63060	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013856	TCTCA	2	10	71245	71254	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013856	CATGC	2	10	79886	79895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013856	CGCGC	2	10	99264	99273	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_013856	TTGCC	2	10	140610	140619	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013856	ATGAG	2	10	143676	143685	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013856	CCGTG	2	10	158601	158610	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013856	GAAGG	2	10	161614	161623	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013856	CGCTC	2	10	165947	165956	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_013856	GCAGG	2	10	168483	168492	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013856	GTGAT	2	10	173801	173810	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013856	CGTTC	2	10	177306	177315	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013856	ATCGG	2	10	181505	181514	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013856	TGAAC	2	10	181809	181818	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013856	GGCGA	2	10	184897	184906	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013856	CGCCT	2	10	184967	184976	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_013856	GGCAA	2	10	191074	191083	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013856	GCGTC	2	10	192939	192948	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013856	GAACC	2	10	194857	194866	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013856	CGTTA	2	10	195334	195343	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013856	TGGCG	2	10	197967	197976	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013856	ACCCC	2	10	205549	205558	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
28	NC_013856	TCGGC	2	10	221560	221569	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013856	GACCA	2	10	223989	223998	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_013856	ACGGC	2	10	226632	226641	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013856	CGGAT	2	10	232898	232907	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013856	TCTCG	2	10	236673	236682	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013856	CTTGG	2	10	245607	245616	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013856	CAACC	2	10	257369	257378	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_013856	TCCGG	2	10	257633	257642	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013856	GTGCG	2	10	267878	267887	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013856	GATCG	2	10	268745	268754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013856	CGGGG	2	10	292313	292322	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013856	AGCGG	2	10	300601	300610	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013856	AATTG	2	10	312695	312704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013856	CGGCC	2	10	322841	322850	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_013856	CCCAG	2	10	334906	334915	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_013856	GGGGC	2	10	335028	335037	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013856	GCGCA	2	10	339369	339378	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013856	TCTGG	2	10	339581	339590	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013856	TTTCG	2	10	340639	340648	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013856	TCCTT	2	10	341508	341517	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013856	TCCCG	2	10	358663	358672	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_013856	TCCCC	2	10	364593	364602	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
50	NC_013856	TGTCG	2	10	366315	366324	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013856	CGGGG	2	10	366382	366391	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013856	CTAAC	2	10	366464	366473	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013856	CGGGC	2	10	368664	368673	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_013856	CGCGC	2	10	376169	376178	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_013856	TACAT	2	10	379723	379732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013856	CCGCT	2	10	391376	391385	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_013856	CCGGC	2	10	402457	402466	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_013856	CGGAC	2	10	402595	402604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013856	TCCAC	2	10	416460	416469	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_013856	ACTGG	2	10	423851	423860	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013856	CCGGC	2	10	431097	431106	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_013856	GGCCG	2	10	432242	432251	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013856	GGCAG	2	10	442431	442440	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013856	GGCGA	2	10	450858	450867	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013856	CGCCT	2	10	450928	450937	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_013856	GGATG	2	10	475388	475397	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013856	ATGAA	2	10	484410	484419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013856	CGCTA	2	10	498148	498157	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_013856	CGGGG	2	10	498425	498434	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013856	CGATC	2	10	502653	502662	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013856	CCGCC	2	10	508926	508935	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
72	NC_013856	ATCGG	2	10	509047	509056	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013856	CCGGC	2	10	509094	509103	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_013856	CATCG	2	10	509444	509453	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013856	TTGGT	2	10	515141	515150	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013856	AATTT	2	10	515327	515336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013856	TCCCG	2	10	522031	522040	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_013856	GACAG	2	10	525526	525535	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013856	GATCA	2	10	525548	525557	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013856	GGCGG	2	10	528248	528257	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013856	TCCCG	2	10	537750	537759	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_013856	CGGGA	2	10	537884	537893	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013856	GCCGC	2	10	543092	543101	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_013856	GGCCC	2	10	548422	548431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_013856	CGGCC	2	10	569318	569327	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_013856	CTGTT	2	10	571814	571823	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013856	CCGTC	2	10	586398	586407	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_013856	TAATT	2	10	587726	587735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013856	GATGG	2	10	598429	598438	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013856	GGGAT	2	10	603155	603164	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013856	TTCAA	2	10	604329	604338	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013856	CCTCT	2	10	604347	604356	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_013856	ACGCG	2	10	605247	605256	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_013856	TGATT	2	10	605294	605303	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013856	TCCCG	2	10	606247	606256	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_013856	CACGA	2	10	607139	607148	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013856	CCGAA	2	10	607186	607195	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013856	CCGAA	2	10	608033	608042	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013856	TCCCT	2	10	612936	612945	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_013856	GTATT	2	10	632036	632045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013856	GAGCG	2	10	642131	642140	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013856	GGCCC	2	10	648523	648532	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_013856	GCCCG	2	10	660322	660331	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_013856	CCGCA	2	10	667747	667756	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_013856	CGGCA	2	10	668558	668567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_013856	ATCCC	2	10	678050	678059	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_013856	ACGGC	2	10	679903	679912	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_013856	GGCTT	2	10	689384	689393	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013856	GACGG	2	10	689560	689569	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013856	CCAAT	2	10	698680	698689	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_013856	CGCCC	2	10	714569	714578	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
112	NC_013856	TCGCC	2	10	723422	723431	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.