MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510a

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013855	CCTGC	2	10	1156	1165	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013855	CAGGG	2	10	18571	18580	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013855	AAGCC	2	10	22827	22836	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013855	GGCGC	2	10	53863	53872	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013855	CGCGG	2	10	66053	66062	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013855	CCGCG	2	10	69424	69433	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_013855	CGGGT	2	10	70516	70525	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013855	CCTCG	2	10	111685	111694	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013855	CCGTC	2	10	134275	134284	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_013855	TCACT	2	10	135100	135109	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013855	ATGGC	2	10	145293	145302	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013855	AGGCA	2	10	145332	145341	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013855	AAGGG	2	10	146794	146803	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013855	TTGCC	2	10	162569	162578	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013855	GGAGG	2	10	175818	175827	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013855	TTACG	2	10	178100	178109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013855	GTTCG	2	10	194759	194768	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013855	CGCTG	2	10	195242	195251	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013855	CCTGC	2	10	239737	239746	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_013855	GGCGG	2	10	244968	244977	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013855	TTGAT	2	10	253423	253432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013855	TGTCG	2	10	257639	257648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013855	GATCG	2	10	257935	257944	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013855	GGAAT	2	10	261735	261744	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013855	GGAAC	2	10	275655	275664	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013855	GAACA	2	10	321202	321211	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013855	GTCGG	2	10	338664	338673	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013855	CGGCG	2	10	338707	338716	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013855	GAGGG	2	10	345172	345181	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013855	CCGTG	2	10	351361	351370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013855	CGGTA	2	10	352938	352947	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013855	CAGCT	2	10	355041	355050	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013855	ATCCC	2	10	355464	355473	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_013855	CGACC	2	10	372724	372733	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_013855	CGCGA	2	10	376991	377000	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013855	GCCCG	2	10	377028	377037	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_013855	TCCCG	2	10	382433	382442	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_013855	TCGCT	2	10	386392	386401	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013855	GCCGC	2	10	386480	386489	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_013855	GACGG	2	10	387156	387165	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013855	GGCAC	2	10	405132	405141	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013855	TCCGA	2	10	405183	405192	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013855	CGGGG	2	10	409095	409104	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013855	GTCCG	2	10	413731	413740	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013855	GGTGG	2	10	420957	420966	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013855	TTTCG	2	10	422100	422109	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013855	CCTTC	2	10	422674	422683	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_013855	GGTCC	2	10	426028	426037	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013855	CTTTT	2	10	433724	433733	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013855	CAGGG	2	10	447726	447735	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013855	TCCCG	2	10	452935	452944	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_013855	GCCGT	2	10	453174	453183	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013855	GCGAG	2	10	455476	455485	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013855	CTTCG	2	10	455536	455545	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_013855	TGCGC	2	10	455772	455781	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_013855	AAGAT	2	10	456631	456640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013855	GGGAG	2	10	467644	467653	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013855	GATCG	2	10	476861	476870	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013855	TTCCA	2	10	487211	487220	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_013855	AAGCG	2	10	504238	504247	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013855	CGTCC	2	10	506816	506825	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_013855	ACGCA	2	10	509764	509773	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013855	GGCGG	2	10	509791	509800	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013855	TGGGG	2	10	517340	517349	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013855	CCGAA	2	10	517459	517468	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013855	CCGGA	2	10	529671	529680	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013855	GCGTT	2	10	535859	535868	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013855	GGAAG	2	10	538014	538023	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013855	AACGA	2	10	564736	564745	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013855	TCCGA	2	10	564976	564985	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013855	TTCGG	2	10	565374	565383	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013855	TTCGG	2	10	566221	566230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013855	TCGTG	2	10	566268	566277	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013855	ACGGG	2	10	567150	567159	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013855	AATCA	2	10	568109	568118	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013855	AGAGG	2	10	569056	569065	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013855	TTGAA	2	10	569074	569083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013855	ATCCC	2	10	570248	570257	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_013855	GTCGG	2	10	573693	573702	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013855	GGCCC	2	10	583088	583097	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_013855	TGCAG	2	10	590817	590826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013855	GGGAT	2	10	610651	610660	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013855	CGGCG	2	10	610694	610703	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013855	GCCCC	2	10	620428	620437	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
85	NC_013855	GCCGG	2	10	656496	656505	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_013855	TTCTC	2	10	666717	666726	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013855	CAGCT	2	10	671649	671658	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_013855	CGGGG	2	10	674204	674213	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013855	ATTTT	2	10	675274	675283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013855	TTCAG	2	10	678179	678188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013855	GAAGC	2	10	693182	693191	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013855	ACCGG	2	10	693343	693352	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_013855	GACGC	2	10	719234	719243	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_013855	GCGCC	2	10	726184	726193	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_013855	ATCCA	2	10	728313	728322	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_013855	CCGAT	2	10	770075	770084	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013855	GCCCG	2	10	799994	800003	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_013855	GATAT	2	10	801837	801846	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013855	AACCG	2	10	802405	802414	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_013855	ACGTC	2	10	802508	802517	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013855	GCCCC	2	10	809244	809253	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
102	NC_013855	CGCAT	2	10	814884	814893	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_013855	TGACG	2	10	820305	820314	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013855	CGGCC	2	10	820600	820609	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_013855	ACCCC	2	10	827888	827897	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
106	NC_013855	GGCGG	2	10	850751	850760	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013855	CGGAT	2	10	882251	882260	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013855	CGCGC	2	10	884156	884165	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_013855	TTCAA	2	10	900181	900190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013855	CCTCT	2	10	900199	900208	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_013855	ACGCG	2	10	901099	901108	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_013855	TGATT	2	10	901146	901155	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013855	CACGA	2	10	902670	902679	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_013855	CCGAA	2	10	902717	902726	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_013855	CCGAA	2	10	903564	903573	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_013855	GATGG	2	10	927129	927138	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013855	GCCCC	2	10	927465	927474	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
118	NC_013855	GAAAG	2	10	928596	928605	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013855	CCCCG	3	15	932899	932913	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
120	NC_013855	GCAAC	2	10	936055	936064	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_013855	AGTTG	2	10	936707	936716	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013855	TGGTG	2	10	936761	936770	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013855	CCGGC	2	10	945532	945541	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_013855	CGCCC	2	10	948976	948985	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_013855	TGTCG	2	10	950363	950372	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013855	TGTCG	2	10	956365	956374	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013855	GCACG	2	10	960276	960285	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_013855	ACGGC	2	10	968353	968362	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_013855	GGGAT	2	10	971492	971501	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013855	TTCAA	2	10	972666	972675	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013855	CCTCT	2	10	972684	972693	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_013855	ACGCG	2	10	973584	973593	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_013855	TGATT	2	10	973631	973640	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013855	TCCCG	2	10	974584	974593	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_013855	CACGA	2	10	975477	975486	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_013855	CCGAA	2	10	975524	975533	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_013855	CCGAA	2	10	976371	976380	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_013855	GATCG	2	10	976768	976777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013855	GAAAA	2	10	987135	987144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013855	CTTTT	2	10	987174	987183	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013855	ACGGA	2	10	1004082	1004091	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013855	GGGCC	2	10	1044228	1044237	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
143	NC_013855	TCCCT	2	10	1050425	1050434	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
144	NC_013855	TCGTT	2	10	1054041	1054050	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013855	CCGGG	2	10	1056661	1056670	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_013855	GCGGG	2	10	1059726	1059735	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013855	GCCGC	2	10	1062109	1062118	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
148	NC_013855	CCGGT	2	10	1065497	1065506	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_013855	ACTGG	2	10	1068982	1068991	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_013855	GGACC	2	10	1069415	1069424	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_013855	CCTGA	2	10	1069487	1069496	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_013855	GCCGG	2	10	1083657	1083666	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
153	NC_013855	GGGCC	2	10	1083675	1083684	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
154	NC_013855	CATGG	2	10	1083752	1083761	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_013855	CCCCA	2	10	1083960	1083969	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
156	NC_013855	CGGGA	2	10	1088907	1088916	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
157	NC_013855	TACCA	2	10	1096829	1096838	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
158	NC_013855	CCCCG	2	10	1098428	1098437	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
159	NC_013855	GGGAT	2	10	1102222	1102231	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013855	CCGTT	2	10	1102371	1102380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_013855	CGCCC	2	10	1103588	1103597	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
162	NC_013855	GCCCC	2	10	1103612	1103621	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
163	NC_013855	CCCGC	2	10	1107832	1107841	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
164	NC_013855	GGACG	2	10	1109376	1109385	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
165	NC_013855	GGTCC	2	10	1109393	1109402	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
166	NC_013855	GCCCC	2	10	1110296	1110305	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
167	NC_013855	CTTGC	2	10	1115963	1115972	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
168	NC_013855	CGGGA	2	10	1116017	1116026	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
169	NC_013855	CCTGT	2	10	1121766	1121775	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
170	NC_013855	GCGGG	2	10	1127179	1127188	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
171	NC_013855	GCGCC	2	10	1137836	1137845	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
172	NC_013855	GCGCC	2	10	1161977	1161986	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
173	NC_013855	TAATA	2	10	1176853	1176862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013855	GCCGG	2	10	1184879	1184888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
175	NC_013855	CGGGG	2	10	1184894	1184903	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
176	NC_013855	CGGCC	2	10	1185614	1185623	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
177	NC_013855	CCGCC	2	10	1186767	1186776	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
178	NC_013855	AGGCG	2	10	1193065	1193074	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
179	NC_013855	GTCCG	2	10	1194525	1194534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
180	NC_013855	CCCGT	2	10	1200026	1200035	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
181	NC_013855	CGACG	2	10	1218345	1218354	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
182	NC_013855	GGGGC	2	10	1266786	1266795	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
183	NC_013855	GGCCC	2	10	1275098	1275107	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
184	NC_013855	CGCAA	2	10	1275237	1275246	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
185	NC_013855	TACGT	2	10	1275296	1275305	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NC_013855	GGGAT	2	10	1275561	1275570	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013855	TTCAA	2	10	1276736	1276745	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_013855	CCTCT	2	10	1276754	1276763	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
189	NC_013855	TGATT	2	10	1277702	1277711	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_013855	TCCCG	2	10	1278660	1278669	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
191	NC_013855	CACGA	2	10	1279557	1279566	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
192	NC_013855	CCGAA	2	10	1279604	1279613	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_013855	CCGAA	2	10	1280451	1280460	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
194	NC_013855	CAACC	2	10	1302471	1302480	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
195	NC_013855	TCGTC	2	10	1313659	1313668	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
196	NC_013855	CGGGC	2	10	1313713	1313722	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
197	NC_013855	GCATC	2	10	1320194	1320203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
198	NC_013855	CTGGA	2	10	1327399	1327408	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_013855	GGGCA	2	10	1340124	1340133	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
200	NC_013855	ATCCA	2	10	1344881	1344890	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
201	NC_013855	GGTTC	2	10	1356867	1356876	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
202	NC_013855	CACCG	2	10	1360021	1360030	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
203	NC_013855	CAGGT	2	10	1369796	1369805	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
204	NC_013855	ACATC	2	10	1371872	1371881	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
205	NC_013855	ACGTG	2	10	1372526	1372535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
206	NC_013855	GGTCC	2	10	1372580	1372589	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
207	NC_013855	CCGGC	2	10	1390385	1390394	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
208	NC_013855	CCTCC	2	10	1424056	1424065	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
209	NC_013855	ATTCA	2	10	1431814	1431823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
210	NC_013855	CCTCG	2	10	1449951	1449960	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.