MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013851	GGC	2	6	1616413	1616418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_013851	GC	4	8	1618462	1618469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_013851	CGG	2	6	1620029	1620034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_013851	CGG	2	6	1620051	1620056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_013851	GAT	2	6	1620067	1620072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013851	GCT	2	6	1620125	1620130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_013851	ACG	2	6	1620163	1620168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_013851	GC	3	6	1620192	1620197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_013851	ATCGA	2	10	1620209	1620218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3010	NC_013851	GGC	2	6	1620248	1620253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_013851	GCC	2	6	1620257	1620262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_013851	GCA	2	6	1620265	1620270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_013851	CCT	2	6	1621515	1621520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_013851	TC	3	6	1622459	1622464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_013851	TCGA	2	8	1622518	1622525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_013851	AAT	2	6	1622560	1622565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_013851	CGGTA	2	10	1622634	1622643	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3018	NC_013851	GCCC	2	8	1622675	1622682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3019	NC_013851	ATG	2	6	1623104	1623109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_013851	CGGA	2	8	1623119	1623126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3021	NC_013851	GA	3	6	1623125	1623130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_013851	TG	3	6	1632032	1632037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_013851	GGC	2	6	1632104	1632109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_013851	GCT	2	6	1632116	1632121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_013851	CGG	2	6	1632134	1632139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_013851	TCGA	2	8	1633774	1633781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_013851	CG	3	6	1633836	1633841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_013851	A	7	7	1633860	1633866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_013851	CGG	2	6	1633871	1633876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_013851	TC	3	6	1633894	1633899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_013851	AGA	2	6	1633902	1633907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_013851	GA	3	6	1633906	1633911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_013851	GAG	2	6	1633913	1633918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013851	GAT	2	6	1633996	1634001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_013851	GAT	2	6	1634006	1634011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_013851	CGTT	2	8	1634052	1634059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_013851	GC	3	6	1635817	1635822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_013851	GGC	2	6	1635823	1635828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_013851	C	6	6	1635880	1635885	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3040	NC_013851	TCG	3	9	1637882	1637890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_013851	GC	3	6	1637908	1637913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_013851	GGC	2	6	1637998	1638003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_013851	GCC	2	6	1638008	1638013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_013851	TGA	2	6	1638087	1638092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3046	NC_013851	GGT	2	6	1638130	1638135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013851	GGCAT	2	10	1638149	1638158	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3048	NC_013851	AAT	2	6	1638186	1638191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_013851	GAG	2	6	1638206	1638211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3051	NC_013851	CCG	2	6	1638902	1638907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_013851	CG	3	6	1638981	1638986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_013851	CGCC	2	8	1639023	1639030	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3054	NC_013851	GCC	2	6	1639051	1639056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_013851	ACG	2	6	1639490	1639495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_013851	GAC	2	6	1639499	1639504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_013851	CGT	2	6	1640085	1640090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_013851	TTG	2	6	1640130	1640135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_013851	GCAG	2	8	1640170	1640177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_013851	A	6	6	1640684	1640689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_013851	GCC	2	6	1640728	1640733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_013851	GACG	2	8	1640748	1640755	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_013851	CGC	2	6	1641774	1641779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_013851	CGG	2	6	1641816	1641821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_013851	ACG	2	6	1641846	1641851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_013851	C	6	6	1641874	1641879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3067	NC_013851	GGA	2	6	1641886	1641891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_013851	GCC	2	6	1643319	1643324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_013851	CCCG	2	8	1643347	1643354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3070	NC_013851	GCC	2	6	1643400	1643405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_013851	GCG	2	6	1643420	1643425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3078	NC_013851	GAT	2	6	1645662	1645667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3080	NC_013851	C	7	7	1645800	1645806	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3081	NC_013851	TCGA	2	8	1647161	1647168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_013851	CAC	2	6	1647234	1647239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_013851	GC	3	6	1649872	1649877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_013851	TCGC	2	8	1650253	1650260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_013851	GCA	2	6	1650331	1650336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3087	NC_013851	TCCGC	2	10	1650415	1650424	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3088	NC_013851	T	7	7	1650468	1650474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_013851	G	6	6	1652524	1652529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_013851	TGT	2	6	1653326	1653331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_013851	GGA	2	6	1660171	1660176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_013851	TCG	2	6	1660961	1660966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3096	NC_013851	CTGA	2	8	1661032	1661039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_013851	GATC	2	8	1661067	1661074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_013851	ATC	2	6	1661155	1661160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_013851	GTC	2	6	1661210	1661215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_013851	TCG	2	6	1661268	1661273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_013851	ATC	2	6	1661326	1661331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_013851	CCG	2	6	1661332	1661337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_013851	TCGC	2	8	1661351	1661358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_013851	CG	3	6	1661372	1661377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_013851	G	6	6	1661453	1661458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3107	NC_013851	TCG	2	6	1661505	1661510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_013851	TCT	2	6	1661607	1661612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_013851	TGA	2	6	1661616	1661621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_013851	TGGT	2	8	1661643	1661650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_013851	GTT	2	6	1661668	1661673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_013851	CG	3	6	1661892	1661897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_013851	CG	4	8	1661950	1661957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_013851	CG	3	6	1661974	1661979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_013851	GCC	2	6	1664625	1664630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3117	NC_013851	ATC	2	6	1667252	1667257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3120	NC_013851	CGC	3	9	1671087	1671095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_013851	GAGC	2	8	1671129	1671136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_013851	CGCGC	2	10	1672545	1672554	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3123	NC_013851	TCCC	2	8	1672559	1672566	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3124	NC_013851	TGA	2	6	1672599	1672604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_013851	CCG	2	6	1672613	1672618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_013851	GCA	2	6	1672619	1672624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_013851	CCG	2	6	1673302	1673307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_013851	GTT	2	6	1673406	1673411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_013851	TTGA	2	8	1677528	1677535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_013851	GCCG	2	8	1679065	1679072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_013851	GGCC	2	8	1679104	1679111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_013851	GCG	2	6	1679781	1679786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_013851	CGT	2	6	1679792	1679797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3135	NC_013851	GAG	2	6	1684610	1684615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3139	NC_013851	TACA	2	8	1687797	1687804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3153	NC_013851	CGCC	2	8	1697027	1697034	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3193	NC_013851	CGC	2	6	1731319	1731324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3231	NC_013851	AGACC	2	10	1745281	1745290	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3250	NC_013851	CGG	2	6	1760973	1760978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_013851	CG	3	6	1761000	1761005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3252	NC_013851	TCAT	2	8	1761033	1761040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3253	NC_013851	CGC	2	6	1762372	1762377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_013851	CGG	2	6	1762401	1762406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_013851	GCC	2	6	1763046	1763051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3256	NC_013851	GTC	2	6	1763063	1763068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_013851	GC	3	6	1763077	1763082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3258	NC_013851	ACAG	2	8	1763146	1763153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3259	NC_013851	GC	3	6	1763160	1763165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_013851	CCAGCC	2	12	1763166	1763177	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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3262	NC_013851	CG	3	6	1763297	1763302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_013851	GAC	2	6	1763335	1763340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3265	NC_013851	GAATAA	2	12	1771585	1771596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3293	NC_013851	CCG	2	6	1795302	1795307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3389	NC_013851	A	6	6	1873420	1873425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3390	NC_013851	GA	3	6	1873453	1873458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3391	NC_013851	ATC	2	6	1873472	1873477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3392	NC_013851	GGC	2	6	1873723	1873728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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