MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013851	CCAG	2	8	751538	751545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_013851	CCG	2	6	751567	751572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_013851	TGCG	2	8	751663	751670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_013851	GCT	2	6	751692	751697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013851	AGT	2	6	751730	751735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013851	GC	3	6	751744	751749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_013851	CCG	2	6	751787	751792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_013851	GGT	2	6	751797	751802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013851	AGGG	2	8	751861	751868	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013851	CGG	2	6	751928	751933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_013851	G	6	6	751940	751945	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013851	GGGC	2	8	752008	752015	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_013851	CCA	2	6	752145	752150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_013851	GCG	2	6	752227	752232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013851	TCC	2	6	752278	752283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_013851	ATG	2	6	752287	752292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013851	CCGG	2	8	752317	752324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_013851	ATCG	2	8	752481	752488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_013851	GAA	2	6	752493	752498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013851	CGT	2	6	752511	752516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_013851	GCCA	2	8	752548	752555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_013851	GGGA	2	8	754344	754351	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013851	CG	3	6	754360	754365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_013851	GCTC	2	8	755774	755781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_013851	CGG	2	6	755816	755821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_013851	TCC	2	6	757060	757065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_013851	CGGC	2	8	757108	757115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_013851	CGGT	2	8	757169	757176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_013851	CGGT	2	8	757200	757207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_013851	ACC	2	6	757361	757366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_013851	CAG	2	6	757501	757506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_013851	CGT	2	6	757607	757612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_013851	T	6	6	757612	757617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_013851	CG	4	8	757686	757693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_013851	GGC	2	6	757720	757725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_013851	CGC	2	6	757789	757794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_013851	GC	3	6	757903	757908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_013851	ATTC	2	8	758581	758588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_013851	GTT	2	6	758697	758702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013851	CTG	2	6	758887	758892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_013851	AGG	2	6	759022	759027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013851	GCC	2	6	759188	759193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_013851	TGGC	2	8	759259	759266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_013851	GAACG	2	10	759302	759311	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1545	NC_013851	CG	3	6	759322	759327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_013851	CTGC	2	8	759375	759382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_013851	ACCG	2	8	759692	759699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_013851	GTCG	2	8	759804	759811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_013851	ACGG	2	8	760036	760043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_013851	CGG	2	6	760098	760103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_013851	TCG	3	9	760110	760118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_013851	GC	3	6	760189	760194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_013851	GCC	2	6	760344	760349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_013851	AGG	2	6	760360	760365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013851	GGC	2	6	760371	760376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_013851	GAT	2	6	760418	760423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1558	NC_013851	GAAA	2	8	760910	760917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013851	GGC	2	6	760921	760926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_013851	T	6	6	761021	761026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_013851	CGA	2	6	761091	761096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013851	GGAAC	2	10	761131	761140	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1563	NC_013851	CG	3	6	761156	761161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_013851	GCT	2	6	761266	761271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_013851	TCC	2	6	761328	761333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_013851	CGG	2	6	761380	761385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_013851	CGA	2	6	761454	761459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_013851	CGG	2	6	761502	761507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_013851	GCG	2	6	761533	761538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_013851	TGG	2	6	761585	761590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013851	TATC	2	8	761630	761637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_013851	CGAT	2	8	761883	761890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_013851	ACC	2	6	761940	761945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_013851	CAA	2	6	761995	762000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013851	CCA	2	6	762006	762011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_013851	G	6	6	762113	762118	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_013851	TGG	2	6	762318	762323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013851	CAA	2	6	762413	762418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1584	NC_013851	GTTC	2	8	768851	768858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_013851	TCA	2	6	771521	771526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1587	NC_013851	CCTC	2	8	771743	771750	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1591	NC_013851	GCT	2	6	776290	776295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1594	NC_013851	GTCC	2	8	778176	778183	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_013851	TGT	2	6	778211	778216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_013851	CAG	2	6	779862	779867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1602	NC_013851	ATC	2	6	782836	782841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_013851	ATC	2	6	782859	782864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_013851	GTC	2	6	782878	782883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_013851	GCG	2	6	784840	784845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_013851	CAT	2	6	785992	785997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_013851	ACG	2	6	786004	786009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_013851	CGT	2	6	788202	788207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_013851	GGA	2	6	791736	791741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013851	CTCGT	2	10	791759	791768	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1611	NC_013851	CGGCT	2	10	791800	791809	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1612	NC_013851	CGG	2	6	791847	791852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1615	NC_013851	GCC	2	6	791878	791883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_013851	GAG	2	6	791938	791943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013851	GCG	2	6	792977	792982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_013851	GTC	2	6	793011	793016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013851	CCG	2	6	794867	794872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_013851	TCCA	2	8	794892	794899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_013851	TCCA	2	8	794958	794965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_013851	ATC	2	6	794979	794984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_013851	CA	3	6	795697	795702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_013851	G	6	6	797622	797627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_013851	GA	3	6	798273	798278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_013851	CGCA	2	8	800766	800773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_013851	GCC	2	6	800803	800808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1630	NC_013851	TCC	2	6	805178	805183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_013851	GAA	2	6	805190	805195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013851	CG	3	6	805217	805222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_013851	GTC	2	6	806743	806748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_013851	GGC	2	6	806785	806790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1636	NC_013851	GCG	2	6	808610	808615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1638	NC_013851	CGA	2	6	808728	808733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1905	NC_013851	CAC	2	6	970174	970179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1907	NC_013851	GC	3	6	971384	971389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1908	NC_013851	GGAC	2	8	971715	971722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1911	NC_013851	CTC	2	6	976290	976295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1912	NC_013851	A	6	6	976317	976322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_013851	GCG	2	6	976380	976385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_013851	GCGGT	2	10	978824	978833	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1924	NC_013851	CG	3	6	979928	979933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1925	NC_013851	GGCG	2	8	979939	979946	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1926	NC_013851	CG	3	6	979945	979950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1933	NC_013851	A	6	6	980734	980739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_013851	CTC	2	6	980752	980757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1941	NC_013851	TCC	2	6	981605	981610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1942	NC_013851	CCG	2	6	981617	981622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1944	NC_013851	T	6	6	981737	981742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_013851	CCG	2	6	981768	981773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1947	NC_013851	CG	3	6	985876	985881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1948	NC_013851	CGG	2	6	985913	985918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1949	NC_013851	CT	3	6	988410	988415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1950	NC_013851	GGC	2	6	988449	988454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1951	NC_013851	TGG	3	9	990802	990810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1952	NC_013851	GT	4	8	990812	990819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_013851	TTC	2	6	995235	995240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1954	NC_013851	CG	3	6	995312	995317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1955	NC_013851	GTC	2	6	995353	995358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1957	NC_013851	CGACG	2	10	995461	995470	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1958	NC_013851	ACC	2	6	995603	995608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1959	NC_013851	GGC	2	6	995630	995635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1973	NC_013851	GCG	2	6	1003291	1003296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1977	NC_013851	CGC	2	6	1003408	1003413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1991	NC_013851	GTT	2	6	1011499	1011504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1992	NC_013851	TCGA	2	8	1011517	1011524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1993	NC_013851	GCG	2	6	1011569	1011574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1994	NC_013851	GAT	2	6	1012000	1012005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_013851	CGG	2	6	1022514	1022519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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