MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013851	GCC	2	6	533307	533312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_013851	GACCC	2	10	533323	533332	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1003	NC_013851	GCC	2	6	533475	533480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_013851	ATC	2	6	539811	539816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_013851	CAC	2	6	539882	539887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_013851	GCGA	2	8	539912	539919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_013851	CACG	2	8	540016	540023	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_013851	CCG	3	9	540090	540098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_013851	CAG	2	6	540115	540120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013851	GT	3	6	540215	540220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013851	GGC	2	6	540350	540355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013851	TGT	2	6	540362	540367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013851	GCAG	2	8	540401	540408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_013851	AGTG	2	8	540470	540477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013851	AAG	2	6	540583	540588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013851	TGG	3	9	540641	540649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013851	TGG	2	6	540665	540670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013851	G	6	6	540669	540674	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013851	GGA	2	6	540714	540719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013851	GGT	2	6	540741	540746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013851	ATGT	2	8	540747	540754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013851	TGG	3	9	540761	540769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013851	GGC	2	6	540789	540794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013851	GGT	2	6	540810	540815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013851	CGG	2	6	540833	540838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_013851	ACCGG	2	10	540849	540858	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1027	NC_013851	G	6	6	540857	540862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_013851	TGG	2	6	540881	540886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013851	GC	3	6	540910	540915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_013851	GAA	2	6	540965	540970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013851	GCAT	2	8	540973	540980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_013851	ATTA	2	8	540992	540999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013851	CCA	2	6	541033	541038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_013851	GCC	3	9	541068	541076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_013851	GCG	2	6	541083	541088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013851	CGG	2	6	541719	541724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_013851	CGG	2	6	541902	541907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_013851	CCA	2	6	541957	541962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_013851	CAGC	2	8	541963	541970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_013851	GTG	2	6	542488	542493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013851	CGG	2	6	542497	542502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_013851	GAC	2	6	542551	542556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_013851	AGC	2	6	542580	542585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013851	CG	3	6	543809	543814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_013851	CG	3	6	543841	543846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_013851	C	6	6	543859	543864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1047	NC_013851	CGA	2	6	543899	543904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_013851	CGT	2	6	543939	543944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_013851	TCCA	2	8	544431	544438	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_013851	GGATT	2	10	544453	544462	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_013851	GCC	2	6	545422	545427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_013851	ATTG	2	8	546700	546707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013851	CTGC	2	8	546742	546749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_013851	CTCGT	2	10	546770	546779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1055	NC_013851	CGC	2	6	546782	546787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_013851	GGC	2	6	546813	546818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013851	TCC	2	6	548715	548720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_013851	A	6	6	549874	549879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013851	CGG	2	6	549920	549925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_013851	GGA	2	6	554011	554016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013851	GCG	2	6	554056	554061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_013851	AGC	2	6	554088	554093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013851	GGGGTG	2	12	554102	554113	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013851	GGC	2	6	554148	554153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013851	CGA	2	6	554237	554242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_013851	GA	3	6	554287	554292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013851	A	6	6	556712	556717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013851	T	6	6	556784	556789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013851	GTT	2	6	556790	556795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013851	A	6	6	556796	556801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013851	TGC	2	6	556863	556868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_013851	ATT	2	6	556919	556924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013851	AATA	2	8	556945	556952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013851	CCAT	2	8	556959	556966	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_013851	AT	3	6	557044	557049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_013851	TC	3	6	557124	557129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_013851	TTGC	2	8	557130	557137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_013851	TAA	2	6	557155	557160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013851	GAA	2	6	557229	557234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013851	TGC	2	6	557248	557253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_013851	TCT	2	6	557277	557282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013851	T	6	6	557320	557325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013851	T	6	6	557373	557378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013851	AGA	2	6	557439	557444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013851	CTT	2	6	557455	557460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013851	T	6	6	557525	557530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013851	TGGC	2	8	557609	557616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_013851	CCTT	2	8	557619	557626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_013851	CAA	2	6	557641	557646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013851	ATT	2	6	557685	557690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013851	ATTT	2	8	557774	557781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013851	GTA	2	6	557905	557910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013851	ATA	2	6	557985	557990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_013851	TG	3	6	558001	558006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013851	T	7	7	558019	558025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013851	GATG	2	8	558078	558085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_013851	A	6	6	558087	558092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013851	TCA	2	6	558102	558107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_013851	G	7	7	558258	558264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_013851	TTC	2	6	558343	558348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013851	T	7	7	558361	558367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013851	TGC	2	6	558426	558431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_013851	TG	3	6	558435	558440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013851	TTC	2	6	558448	558453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_013851	AAT	2	6	558468	558473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013851	ACC	2	6	558490	558495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_013851	AACT	2	8	558536	558543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_013851	ATA	2	6	558702	558707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013851	CG	3	6	558712	558717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_013851	CAA	2	6	558790	558795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_013851	ATTTTA	2	12	558853	558864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013851	GCC	2	6	558928	558933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_013851	TAT	2	6	559007	559012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013851	CT	3	6	559040	559045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_013851	ATCT	2	8	559071	559078	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_013851	GAT	2	6	562343	562348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013851	GC	3	6	562350	562355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_013851	CAT	2	6	564185	564190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_013851	G	6	6	564191	564196	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013851	GTC	3	9	564376	564384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_013851	GCC	2	6	564418	564423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_013851	GGC	2	6	567038	567043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_013851	ACC	2	6	567132	567137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_013851	GCG	2	6	569183	569188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_013851	GCC	2	6	569194	569199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_013851	CGG	2	6	569220	569225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_013851	TC	3	6	569237	569242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_013851	CTCC	2	8	569510	569517	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1129	NC_013851	GACG	2	8	569535	569542	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_013851	CTC	2	6	569845	569850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_013851	GGAT	2	8	571467	571474	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013851	GC	3	6	571476	571481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_013851	CGAT	2	8	571489	571496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_013851	GGTTT	2	10	574305	574314	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_013851	GC	3	6	574318	574323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_013851	TGG	2	6	574354	574359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_013851	ACA	2	6	575159	575164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1392	NC_013851	TCGC	2	8	648990	648997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1393	NC_013851	CG	3	6	649061	649066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1394	NC_013851	GTC	2	6	650757	650762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1399	NC_013851	TCGA	2	8	657251	657258	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1400	NC_013851	GCGG	2	8	657908	657915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1401	NC_013851	GC	3	6	657987	657992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1402	NC_013851	CGC	2	6	658000	658005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1403	NC_013851	TCG	2	6	658006	658011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_013851	GGT	2	6	659414	659419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_013851	GATGG	2	10	659425	659434	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_013851	GCCG	2	8	659449	659456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1408	NC_013851	GCG	2	6	659463	659468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_013851	ACGG	2	8	660628	660635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1410	NC_013851	GTC	2	6	660654	660659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_013851	TGA	2	6	660668	660673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_013851	AGC	2	6	660709	660714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_013851	CTC	2	6	661618	661623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1414	NC_013851	AACG	2	8	663356	663363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1415	NC_013851	TG	3	6	664412	664417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_013851	GCC	2	6	664423	664428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1420	NC_013851	GTTC	2	8	669039	669046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1421	NC_013851	GCCG	2	8	669066	669073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1422	NC_013851	T	6	6	669080	669085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_013851	TCGA	2	8	669122	669129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1424	NC_013851	CCG	2	6	669138	669143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1427	NC_013851	GCCG	2	8	673277	673284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1428	NC_013851	TCGT	2	8	677530	677537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1429	NC_013851	AGA	2	6	687538	687543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_013851	GC	3	6	688487	688492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1431	NC_013851	TGT	2	6	689092	689097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_013851	ACG	2	6	689099	689104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_013851	CCT	2	6	689108	689113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1434	NC_013851	TG	3	6	689150	689155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_013851	ACC	2	6	689170	689175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1436	NC_013851	CCG	2	6	689189	689194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1438	NC_013851	GTC	2	6	689357	689362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_013851	CCTG	2	8	697153	697160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1443	NC_013851	ATC	2	6	697228	697233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_013851	GC	3	6	702818	702823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1452	NC_013851	GTC	2	6	703158	703163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1468	NC_013851	GCC	2	6	720005	720010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1479	NC_013851	TCAA	2	8	738148	738155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1480	NC_013851	GGC	2	6	738177	738182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1483	NC_013851	GCCG	2	8	742535	742542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1486	NC_013851	GTC	2	6	744634	744639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1488	NC_013851	GCC	2	6	744676	744681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1491	NC_013851	CGT	2	6	747402	747407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1493	NC_013851	GCCGG	2	10	751217	751226	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1494	NC_013851	CG	3	6	751227	751232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1495	NC_013851	CCA	2	6	751282	751287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1500	NC_013851	GC	4	8	751458	751465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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