MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus profundus DSM 5631 chromosome

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013741	TCCCAT	2	12	28044	28055	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013741	CCTTAC	2	12	54054	54065	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013741	CAATGG	2	12	84100	84111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013741	AAATTT	2	12	162482	162493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013741	TTAAAA	2	12	164644	164655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013741	GTTAAA	2	12	261589	261600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013741	AAACCT	2	12	321692	321703	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013741	CCTCCC	2	12	322288	322299	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
9	NC_013741	AAATTT	2	12	330302	330313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013741	TTAAAT	2	12	382498	382509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013741	GAATGA	2	12	385964	385975	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013741	TTGCAT	2	12	387390	387401	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013741	TAAGAA	2	12	461010	461021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013741	TGCGAT	2	12	466295	466306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013741	ATTTTT	2	12	571228	571239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013741	TTACGA	2	12	640473	640484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013741	TGCCGT	2	12	673969	673980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013741	GTTGAA	2	12	752774	752785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013741	TGTTTT	2	12	792424	792435	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013741	TTATTT	2	12	793426	793437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013741	ACTTTT	2	12	797506	797517	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013741	TTAGCT	2	12	815689	815700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013741	TCCGGG	2	12	830532	830543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013741	TAGCTA	2	12	958492	958503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013741	ATAGCT	2	12	958529	958540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013741	CATAAG	2	12	959080	959091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013741	ATAGCT	2	12	963838	963849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013741	AACTTG	2	12	972825	972836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013741	TAAAGA	2	12	984847	984858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013741	GTGGGG	2	12	988786	988797	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013741	AAGTGG	2	12	992879	992890	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013741	TTGCGG	2	12	993267	993278	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013741	AGTTTG	2	12	997744	997755	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013741	TAATAG	2	12	1007797	1007808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013741	TCAAAT	2	12	1038918	1038929	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013741	GAGTTT	2	12	1046676	1046687	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013741	CTTCGG	2	12	1048995	1049006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013741	ATGTGA	2	12	1057388	1057399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013741	AAGAAA	2	12	1078332	1078343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013741	AAGTTA	2	12	1120636	1120647	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013741	AAATAA	2	12	1167233	1167244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013741	CTAAAC	2	12	1167891	1167902	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013741	AGTTCT	2	12	1198720	1198731	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013741	CTTTTC	2	12	1247550	1247561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013741	TCCAGT	2	12	1278643	1278654	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013741	AAAAAG	2	12	1294593	1294604	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013741	CTTTGA	2	12	1299004	1299015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013741	TCTTAG	2	12	1303978	1303989	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013741	TAAAAA	2	12	1317637	1317648	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013741	TTGAAA	2	12	1336273	1336284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013741	TGATCG	2	12	1368136	1368147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013741	CATGTC	2	12	1429347	1429358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013741	GGATTA	2	12	1483973	1483984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013741	TGCTCT	2	12	1513962	1513973	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013741	TTTATC	2	12	1528351	1528362	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013741	GATTAA	2	12	1541182	1541193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013741	TTAAAA	2	12	1544187	1544198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.