MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013740	TTTTCT	2	12	1270	1281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013740	CTGAGG	2	12	28119	28130	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013740	TGAAAT	2	12	28620	28631	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013740	CTGAGG	2	12	61154	61165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013740	TGAAAT	2	12	61656	61667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013740	GGCTGC	2	12	66169	66180	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013740	TTTTCT	2	12	69870	69881	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013740	TGCCTT	2	12	73984	73995	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013740	GCAAAT	2	12	107399	107410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013740	GGAAAA	2	12	254998	255009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013740	TTGACA	2	12	270383	270394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013740	TTCCCG	2	12	288442	288453	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013740	GGCTCC	2	12	333060	333071	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013740	AAGTTG	2	12	341577	341588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013740	CTGAGG	2	12	383815	383826	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013740	TGAAAT	2	12	384317	384328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013740	CTGGGC	2	12	459683	459694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013740	AGATGG	2	12	499154	499165	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013740	GGCTGC	2	12	527393	527404	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013740	GAAAAG	2	12	594988	594999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013740	CAAGAT	2	12	627535	627546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013740	CTGAGG	2	12	640651	640662	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013740	TGAAAT	2	12	641153	641164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013740	ATGGAG	2	12	680768	680779	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013740	TTTTAT	2	12	772610	772621	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013740	GGAATT	2	12	776687	776698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013740	AGTTGT	2	12	834492	834503	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013740	ATGCTT	2	12	865055	865066	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013740	TAAATG	2	12	865162	865173	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013740	ATGTTT	2	12	867007	867018	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013740	GACGGA	2	12	869612	869623	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013740	GGAATT	2	12	871660	871671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013740	TTCCGA	2	12	902361	902372	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013740	AAAATA	2	12	902546	902557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013740	CTTTGC	2	12	941162	941173	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013740	GCGCAA	2	12	951232	951243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013740	TCTTTC	2	12	961701	961712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013740	TAAAAT	2	12	1003812	1003823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013740	AAGAAA	2	12	1023100	1023111	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013740	CCCCTT	2	12	1086530	1086541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013740	TGGCTT	2	12	1096211	1096222	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013740	ATGGCC	2	12	1112223	1112234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013740	AGAGGG	2	12	1112674	1112685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013740	TTTTCC	2	12	1113110	1113121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013740	CAGGGC	2	12	1136542	1136553	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013740	ACTATA	2	12	1197857	1197868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013740	CGTTTC	2	12	1279754	1279765	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013740	AGATGA	2	12	1306537	1306548	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013740	ATTTTT	2	12	1306588	1306599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013740	TGGTTT	2	12	1327944	1327955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013740	TATAAC	2	12	1349423	1349434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013740	GGGGCA	2	12	1479740	1479751	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013740	CACCTT	2	12	1482470	1482481	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013740	GGTTCC	2	12	1493087	1493098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013740	GCCAGG	2	12	1529018	1529029	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013740	AAATAA	2	12	1590452	1590463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013740	AAATAA	2	12	1595579	1595590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013740	TTGCGC	2	12	1624905	1624916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013740	TCCCTC	2	12	1635597	1635608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013740	CACATC	2	12	1671112	1671123	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013740	GATTGG	2	12	1704991	1705002	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013740	ATTTAT	2	12	1707151	1707162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013740	ATTTCA	2	12	1712991	1713002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013740	GCCTCA	2	12	1713492	1713503	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013740	GCTGTA	2	12	1734917	1734928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013740	TTGCGC	2	12	1843077	1843088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013740	TATTTT	2	12	1847052	1847063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013740	CTCATG	2	12	1959633	1959644	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013740	GCAAAA	2	12	2056900	2056911	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013740	TAGTTT	2	12	2064698	2064709	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013740	ATTTCA	2	12	2073500	2073511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013740	GCCTCA	2	12	2074001	2074012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013740	CTCCGC	2	12	2186437	2186448	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013740	TACAAA	2	12	2187808	2187819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013740	TACCAT	2	12	2188600	2188611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013740	TTTTAT	2	12	2207827	2207838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013740	TCTCTT	2	12	2209816	2209827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013740	ATTTTT	2	12	2212820	2212831	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013740	CATGAT	2	12	2234854	2234865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013740	ATTTTT	2	12	2243159	2243170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013740	TTCCTT	2	12	2243489	2243500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013740	AAAAGA	2	12	2311864	2311875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.