MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 6827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013740	GTT	2	6	311067	311072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013740	ACGA	2	8	311110	311117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_013740	GACA	2	8	311208	311215	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_013740	GA	3	6	311222	311227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013740	GCC	2	6	311263	311268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_013740	TC	4	8	311293	311300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_013740	TCG	2	6	311334	311339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_013740	TCA	2	6	311454	311459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_013740	GGC	2	6	311472	311477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013740	A	7	7	311588	311594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013740	ATC	2	6	312821	312826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013740	T	6	6	312866	312871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013740	GGC	2	6	312907	312912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_013740	AGG	2	6	314414	314419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013740	AACA	2	8	314420	314427	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_013740	CAG	2	6	315160	315165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_013740	GC	3	6	315166	315171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_013740	CCG	2	6	315233	315238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_013740	TAA	2	6	315257	315262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013740	AGG	2	6	315274	315279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013740	TAC	2	6	315282	315287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_013740	CATTT	2	10	315867	315876	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1023	NC_013740	CTG	2	6	316267	316272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013740	GTAC	2	8	316273	316280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_013740	T	6	6	316313	316318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013740	A	9	9	316327	316335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013740	C	7	7	316357	316363	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1028	NC_013740	TAG	2	6	316367	316372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013740	A	6	6	316388	316393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_013740	AG	3	6	316431	316436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013740	GCG	2	6	316459	316464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_013740	GA	3	6	316604	316609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013740	GGT	2	6	316611	316616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013740	CTG	2	6	319253	319258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_013740	AAG	2	6	320468	320473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_013740	A	6	6	320996	321001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013740	T	7	7	321016	321022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013740	T	6	6	321093	321098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013740	C	6	6	321103	321108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1040	NC_013740	T	6	6	321543	321548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013740	CCT	2	6	322161	322166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_013740	AGTT	2	8	322174	322181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013740	A	6	6	322203	322208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013740	A	6	6	322220	322225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013740	TAGT	2	8	322238	322245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013740	ACTA	2	8	322250	322257	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_013740	T	6	6	322295	322300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013740	AT	3	6	322339	322344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013740	AAT	2	6	322358	322363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013740	GCT	3	9	330205	330213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_013740	GCA	2	6	330217	330222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_013740	TG	3	6	330256	330261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013740	CA	3	6	330269	330274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_013740	TAA	2	6	330313	330318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_013740	A	6	6	330326	330331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013740	AGG	2	6	331162	331167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013740	AGGA	2	8	331775	331782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013740	A	7	7	332409	332415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013740	GAA	2	6	332443	332448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_013740	ACA	2	6	332750	332755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013740	CTA	2	6	332843	332848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_013740	TCAAT	2	10	332857	332866	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_013740	AG	3	6	332916	332921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013740	GCA	2	6	333007	333012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013740	GGCTCC	2	12	333060	333071	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_013740	GGT	2	6	333079	333084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013740	AGG	2	6	333112	333117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013740	T	6	6	333125	333130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013740	CTTTT	2	10	333188	333197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1070	NC_013740	AGG	2	6	333205	333210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013740	AGG	2	6	335267	335272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013740	GAT	2	6	339748	339753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1074	NC_013740	GCT	2	6	339924	339929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1076	NC_013740	GT	3	6	339951	339956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013740	TAA	2	6	340013	340018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013740	AAC	2	6	340033	340038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_013740	TGC	2	6	341450	341455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_013740	CTA	2	6	341479	341484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1083	NC_013740	A	7	7	341510	341516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013740	A	6	6	341522	341527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013740	AAT	2	6	341533	341538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_013740	TAAA	2	8	341701	341708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_013740	A	6	6	345962	345967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_013740	T	6	6	345978	345983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013740	T	6	6	346764	346769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1100	NC_013740	CAA	2	6	348579	348584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013740	TCT	3	9	350662	350670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013740	GGA	2	6	350722	350727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013740	CCTT	2	8	352907	352914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_013740	CCT	2	6	352959	352964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_013740	ATC	2	6	352985	352990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_013740	AAC	2	6	352994	352999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_013740	CAG	2	6	353031	353036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_013740	TCC	2	6	353951	353956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_013740	TTGTA	2	10	354013	354022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013740	TA	3	6	354028	354033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013740	CAG	2	6	354055	354060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1114	NC_013740	AAC	2	6	354122	354127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013740	GA	3	6	354206	354211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013740	TAG	2	6	357684	357689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013740	ATT	2	6	357721	357726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013740	TAA	3	9	357741	357749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013740	ACT	2	6	357762	357767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013740	AATA	2	8	357771	357778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013740	GGA	2	6	357811	357816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013740	GAGAA	2	10	359093	359102	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013740	ACCA	2	8	359116	359123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_013740	T	6	6	359134	359139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013740	TCA	2	6	360289	360294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013740	T	8	8	360423	360430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_013740	TTG	2	6	364049	364054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013740	G	6	6	364087	364092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_013740	T	7	7	364099	364105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013740	C	7	7	364110	364116	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1132	NC_013740	GAT	2	6	364166	364171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_013740	CTTT	2	8	374329	374336	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_013740	AGG	2	6	374345	374350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_013740	GAA	2	6	377967	377972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_013740	CTGT	2	8	378843	378850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1138	NC_013740	GAA	2	6	378895	378900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_013740	AAGGA	2	10	406691	406700	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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