MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma centrale str. Israel chromosome

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013532	GTGCT	2	10	5163	5172	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013532	GAACC	2	10	11525	11534	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013532	CCCAG	2	10	23979	23988	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_013532	GCTGG	2	10	26021	26030	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013532	CCATA	2	10	27799	27808	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013532	GTCTC	2	10	36240	36249	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013532	GCTGG	2	10	37664	37673	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013532	AGGGT	2	10	38092	38101	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013532	GGTGC	2	10	38199	38208	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013532	CATAT	2	10	46758	46767	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013532	GGCTA	2	10	52367	52376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013532	CGTGC	2	10	77019	77028	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013532	CTTTC	2	10	115562	115571	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013532	CCAAA	2	10	116483	116492	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013532	TTCCT	2	10	129990	129999	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013532	GCCCA	2	10	130548	130557	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_013532	GCGTG	2	10	134752	134761	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013532	CTTGC	2	10	139129	139138	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013532	GCTGA	2	10	145156	145165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013532	GTGTG	2	10	151463	151472	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013532	TGAAC	2	10	157592	157601	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013532	TCAAT	2	10	177682	177691	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013532	GAACC	2	10	184527	184536	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013532	ACCGG	2	10	200405	200414	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013532	AGGTA	2	10	202634	202643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013532	TACCA	2	10	207805	207814	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013532	GCGAC	2	10	207839	207848	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013532	CGGCA	2	10	207867	207876	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013532	GTATC	2	10	227616	227625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013532	TGCAC	2	10	236009	236018	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013532	GGGTG	2	10	240639	240648	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013532	CGCCA	2	10	240962	240971	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_013532	GCTAC	2	10	255441	255450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013532	AGGTA	2	10	268873	268882	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013532	TCCCT	2	10	270155	270164	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_013532	CCTCC	2	10	270565	270574	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_013532	ACTGC	2	10	271787	271796	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_013532	GTAGA	2	10	272128	272137	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013532	GCTGG	2	10	272172	272181	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013532	CTTTG	2	10	274213	274222	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013532	GTGGG	2	10	297285	297294	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013532	TGGAG	2	10	297376	297385	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013532	GGCGC	2	10	301678	301687	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_013532	CTTCA	2	10	330340	330349	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013532	GCAGT	2	10	332851	332860	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013532	AAGCT	2	10	334102	334111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013532	ACTGG	2	10	334214	334223	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013532	CACTA	2	10	347567	347576	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013532	GCAGT	2	10	367645	367654	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013532	GGAGG	2	10	368804	368813	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013532	AGAGA	2	10	369146	369155	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013532	GATTA	2	10	369481	369490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013532	AGGAG	2	10	369581	369590	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013532	CAAAC	2	10	371323	371332	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_013532	AAAGC	2	10	383399	383408	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013532	AGGGG	2	10	403462	403471	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013532	TTGTG	2	10	420454	420463	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013532	CGAAA	2	10	420480	420489	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013532	CATTG	2	10	424931	424940	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013532	AGCGC	2	10	430315	430324	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013532	TGGGC	2	10	440428	440437	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013532	AGTCA	2	10	445959	445968	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013532	TTGCT	2	10	472491	472500	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013532	GCTGT	2	10	476741	476750	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013532	CGGTG	2	10	481303	481312	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013532	TTGTG	2	10	487613	487622	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013532	GCGCG	2	10	501424	501433	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013532	GGGGA	2	10	509243	509252	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013532	CCATG	2	10	517290	517299	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_013532	CTTGG	2	10	535545	535554	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013532	CAATA	2	10	540331	540340	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013532	TGTGG	2	10	570270	570279	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013532	CATCT	2	10	570853	570862	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013532	CGTAA	2	10	572541	572550	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013532	TGTGT	2	10	584190	584199	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013532	AGCGC	2	10	586198	586207	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013532	ACTTA	2	10	593714	593723	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013532	TGTGT	2	10	597105	597114	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013532	CTTCT	2	10	654742	654751	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013532	ACTAT	2	10	665325	665334	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013532	AGGGG	2	10	665490	665499	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013532	TGTGG	2	10	665539	665548	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013532	TGCGG	2	10	709628	709637	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013532	CTGCC	2	10	717092	717101	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_013532	GCTGC	2	10	717110	717119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_013532	GCTCC	2	10	725828	725837	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_013532	ATTTC	2	10	732449	732458	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013532	ACACC	2	10	732556	732565	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_013532	AGCCA	2	10	752770	752779	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_013532	AAAGG	2	10	758619	758628	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013532	TTGTG	2	10	767002	767011	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013532	TTTGC	2	10	768381	768390	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013532	CAACG	2	10	773832	773841	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_013532	CCGCC	2	10	777053	777062	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
95	NC_013532	GTTTT	2	10	781879	781888	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013532	AGTAG	2	10	791529	791538	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013532	GTTGT	2	10	792097	792106	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013532	CCCCA	2	10	800445	800454	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
99	NC_013532	CCGCA	2	10	800759	800768	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_013532	AGCAC	2	10	802941	802950	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013532	GTATA	2	10	805531	805540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013532	GCTTG	2	10	819329	819338	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013532	ATCGG	2	10	839365	839374	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013532	CTCTG	2	10	846971	846980	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_013532	CCGTC	2	10	850135	850144	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_013532	CAAGC	2	10	852786	852795	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_013532	TTCGG	2	10	856245	856254	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013532	ACGCT	2	10	864758	864767	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_013532	ACACC	2	10	907135	907144	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_013532	CTCTA	2	10	909120	909129	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_013532	TCCAA	2	10	923537	923546	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_013532	TCGCA	2	10	950253	950262	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013532	TGCAA	2	10	955890	955899	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013532	CAGAA	2	10	971821	971830	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013532	AGGGC	2	10	975350	975359	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013532	TGGGA	2	10	975756	975765	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013532	AGGGC	2	10	976026	976035	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013532	CCCCA	2	10	982038	982047	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
119	NC_013532	CACAA	2	10	985357	985366	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013532	CGCAC	2	10	996446	996455	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_013532	CACGA	2	10	1002396	1002405	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_013532	CTACG	2	10	1008762	1008771	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_013532	GGGTA	2	10	1019058	1019067	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013532	TCTGT	2	10	1049646	1049655	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013532	TGTTC	2	10	1059688	1059697	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013532	CCAGT	2	10	1072839	1072848	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_013532	AAAGT	2	10	1086562	1086571	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013532	TAAGT	2	10	1088429	1088438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013532	GGTAG	2	10	1105318	1105327	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013532	CACGG	2	10	1138818	1138827	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_013532	CCGGG	2	10	1138891	1138900	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_013532	CACAC	2	10	1139084	1139093	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_013532	GCACA	2	10	1139133	1139142	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_013532	CATAG	2	10	1139552	1139561	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013532	TTTCC	2	10	1169165	1169174	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_013532	AATCG	2	10	1169438	1169447	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013532	CGTGG	2	10	1173431	1173440	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013532	TGGCC	2	10	1173734	1173743	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_013532	AGATA	2	10	1176561	1176570	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013532	GGAGG	2	10	1176891	1176900	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013532	GAAGG	2	10	1177299	1177308	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013532	GTCTC	2	10	1178965	1178974	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_013532	GCAGT	2	10	1181524	1181533	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013532	GTCTC	2	10	1184642	1184651	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_013532	GTAGG	2	10	1185549	1185558	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013532	TGCAG	2	10	1186748	1186757	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013532	GCAAC	2	10	1188599	1188608	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_013532	AAGTC	2	10	1189685	1189694	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013532	GAGTG	2	10	1191726	1191735	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013532	ACTTT	2	10	1205641	1205650	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.