MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 471

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013416	CT	3	6	343	348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013416	AT	4	8	3972	3979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013416	AT	4	8	4005	4012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013416	GC	4	8	4280	4287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013416	AC	3	6	4967	4972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013416	TA	3	6	7522	7527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013416	TC	3	6	9262	9267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013416	CA	3	6	28141	28146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013416	TA	3	6	33077	33082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013416	TC	3	6	42350	42355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013416	GT	3	6	48907	48912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013416	TA	3	6	57552	57557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013416	TA	3	6	57976	57981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013416	GA	3	6	60314	60319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013416	AT	3	6	64310	64315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013416	CA	3	6	64368	64373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013416	CA	3	6	80071	80076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013416	TA	3	6	80078	80083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013416	CT	3	6	89541	89546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013416	TC	3	6	89585	89590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013416	AC	3	6	89873	89878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013416	TC	3	6	89980	89985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013416	TC	3	6	91058	91063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013416	TC	3	6	91193	91198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013416	GT	3	6	91891	91896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013416	TG	3	6	93372	93377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013416	GT	3	6	93543	93548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013416	GT	3	6	93712	93717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013416	AC	3	6	94477	94482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013416	CA	3	6	95061	95066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013416	AT	3	6	102497	102502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013416	AT	3	6	106628	106633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013416	AT	3	6	123926	123931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013416	CT	3	6	128699	128704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013416	TC	3	6	132712	132717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013416	AC	3	6	138532	138537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013416	TC	3	6	139593	139598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013416	TG	3	6	139689	139694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013416	GC	3	6	139737	139742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013416	GC	3	6	141799	141804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013416	CT	3	6	144119	144124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013416	GC	3	6	146909	146914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013416	GA	3	6	158315	158320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013416	AG	3	6	159031	159036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013416	AG	3	6	166507	166512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013416	CT	3	6	168348	168353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013416	GA	3	6	170907	170912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013416	CA	3	6	195300	195305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013416	CA	3	6	197350	197355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013416	TA	3	6	201649	201654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013416	TA	3	6	211831	211836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013416	AT	3	6	215057	215062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013416	TG	3	6	237344	237349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013416	TA	3	6	238308	238313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013416	CT	3	6	238576	238581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013416	TC	3	6	238620	238625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013416	AC	3	6	238908	238913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013416	TC	3	6	239015	239020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013416	TC	3	6	240098	240103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013416	TC	3	6	240233	240238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013416	GT	3	6	240931	240936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013416	TG	3	6	242412	242417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013416	GT	3	6	242583	242588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013416	GT	3	6	242752	242757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013416	AC	3	6	243517	243522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013416	CA	3	6	244101	244106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013416	GA	3	6	255687	255692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013416	CA	3	6	259111	259116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013416	GC	3	6	261850	261855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013416	TA	3	6	264672	264677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013416	GA	3	6	281427	281432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013416	TA	3	6	281487	281492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013416	GA	3	6	286648	286653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013416	TA	4	8	287365	287372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013416	TA	3	6	300113	300118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013416	GT	3	6	310215	310220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013416	TG	3	6	310233	310238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013416	TG	3	6	314515	314520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013416	TA	3	6	323064	323069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013416	GA	3	6	355456	355461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013416	TA	3	6	355518	355523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013416	CA	3	6	372800	372805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013416	GT	4	8	381875	381882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013416	CG	3	6	381899	381904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013416	CT	3	6	399866	399871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013416	CT	4	8	423180	423187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013416	AT	3	6	423287	423292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013416	AT	3	6	423315	423320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013416	GA	3	6	441912	441917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013416	AG	3	6	446433	446438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013416	AT	3	6	447450	447455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013416	GA	3	6	454214	454219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013416	TC	3	6	458731	458736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013416	GC	3	6	461776	461781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013416	AT	3	6	465317	465322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013416	CG	3	6	472115	472120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013416	GA	3	6	472893	472898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013416	GC	3	6	473724	473729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013416	TA	3	6	473768	473773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013416	AT	3	6	476031	476036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013416	CA	3	6	476088	476093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013416	TC	3	6	502021	502026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013416	CT	3	6	503911	503916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013416	TC	3	6	503941	503946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013416	TA	3	6	507401	507406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013416	TA	3	6	507825	507830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013416	AG	3	6	510226	510231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013416	AT	3	6	511818	511823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013416	TA	3	6	513616	513621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013416	AG	3	6	515318	515323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013416	TA	3	6	516898	516903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013416	CA	3	6	516985	516990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013416	TA	3	6	517323	517328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013416	AG	3	6	521157	521162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013416	AG	3	6	522263	522268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013416	TG	3	6	524461	524466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013416	GT	3	6	525045	525050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013416	AC	3	6	525810	525815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013416	AC	3	6	525979	525984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013416	CA	3	6	526150	526155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013416	AC	3	6	527445	527450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013416	GA	3	6	528143	528148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013416	GA	3	6	528278	528283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013416	GA	3	6	529361	529366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013416	GA	3	6	529756	529761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013416	GA	3	6	529799	529804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013416	GA	3	6	530817	530822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013416	TA	3	6	531815	531820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013416	TA	3	6	542271	542276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013416	TG	3	6	560006	560011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013416	TA	3	6	562775	562780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013416	AG	3	6	573720	573725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013416	AC	3	6	583048	583053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013416	TA	3	6	583647	583652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013416	AT	3	6	587929	587934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013416	TA	3	6	590282	590287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013416	CA	3	6	597442	597447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013416	CT	3	6	597451	597456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013416	CG	3	6	597469	597474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013416	GA	5	10	599411	599420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013416	AG	4	8	599448	599455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013416	GA	3	6	599588	599593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013416	AT	3	6	605694	605699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013416	CA	3	6	605744	605749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013416	TA	3	6	615383	615388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013416	CT	3	6	631979	631984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013416	TA	3	6	633480	633485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013416	GT	3	6	643914	643919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013416	GA	3	6	646191	646196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013416	AC	3	6	658424	658429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013416	TA	3	6	661476	661481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013416	GT	3	6	661506	661511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013416	TA	3	6	664622	664627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013416	CA	3	6	664844	664849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.