MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013209	TATTTT	2	12	157463	157474	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013209	TTTTGC	2	12	163909	163920	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013209	TGTGTA	2	12	185229	185240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013209	TATTTA	2	12	185346	185357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013209	GTCGGA	2	12	196772	196783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013209	ACCTTT	2	12	230042	230053	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013209	CGACCG	2	12	278785	278796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013209	TGCCAC	2	12	291052	291063	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013209	GGGCGG	2	12	309577	309588	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013209	AGAAAA	2	12	318243	318254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013209	TTCTGG	2	12	349057	349068	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013209	GGCGCG	2	12	419531	419542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013209	TATGCA	2	12	473974	473985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013209	AAACCA	2	12	521869	521880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013209	AAAATT	2	12	530978	530989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013209	TAAAAA	2	12	533163	533174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013209	TGCCAA	2	12	645198	645209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013209	GTGCGT	2	12	723394	723405	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013209	AAAAGG	2	12	753048	753059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013209	TGAACG	2	12	766369	766380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013209	TAAAGC	2	12	774384	774395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013209	GCGCAA	2	12	791223	791234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013209	TGCGCG	2	12	866634	866645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013209	GAAGGT	2	12	867506	867517	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013209	AGACGG	2	12	963628	963639	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013209	CCTTTC	2	12	1022642	1022653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013209	GCCGGG	2	12	1042784	1042795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013209	TTTTCT	2	12	1055352	1055363	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013209	GGGGAT	2	12	1088913	1088924	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013209	TGTTGG	2	12	1089491	1089502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013209	GGGCAG	2	12	1191163	1191174	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013209	ACGGAA	2	12	1219203	1219214	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013209	GGAACG	2	12	1243193	1243204	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013209	TATTCG	2	12	1317943	1317954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013209	AAACAT	2	12	1334028	1334039	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013209	TTCAGG	2	12	1334101	1334112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013209	CAAAAA	2	12	1347809	1347820	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013209	CAAAAA	2	12	1368733	1368744	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013209	TTGGGG	2	12	1369267	1369278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013209	TTTTTG	2	12	1462481	1462492	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013209	CTCGCC	2	12	1538143	1538154	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013209	TTTGAT	2	12	1728461	1728472	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013209	CTCGCC	2	12	1731226	1731237	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013209	CCGAAA	2	12	1803477	1803488	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013209	TTTTTA	2	12	1835330	1835341	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013209	GAGCCC	2	12	1844727	1844738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013209	CGGTTC	2	12	1850237	1850248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013209	TATGGA	2	12	1917368	1917379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013209	CGATCC	2	12	1919812	1919823	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013209	GATGCC	2	12	1919861	1919872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013209	TGAAGA	2	12	1922541	1922552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013209	AGCTAT	2	12	1931666	1931677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013209	GTTTTT	2	12	1982456	1982467	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013209	ATCACG	2	12	2016501	2016512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013209	TATTTT	2	12	2026467	2026478	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013209	TGATCA	2	12	2030584	2030595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013209	CTACGC	2	12	2094635	2094646	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013209	AACCCT	2	12	2223692	2223703	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013209	AATATA	2	12	2253642	2253653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013209	CTCGCC	2	12	2283450	2283461	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013209	TGCGGT	2	12	2309201	2309212	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013209	GAAAAA	2	12	2349892	2349903	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013209	GGGAAG	2	12	2371198	2371209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013209	ATCCTT	2	12	2411799	2411810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013209	TCGTTA	2	12	2416636	2416647	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013209	AAAATA	2	12	2427482	2427493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013209	AATTGG	2	12	2479609	2479620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013209	GCGCCA	2	12	2503187	2503198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013209	CAGAAA	2	12	2539588	2539599	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013209	AGCTTC	2	12	2587879	2587890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013209	ACGTCA	2	12	2606776	2606787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013209	CTCGCC	2	12	2609294	2609305	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_013209	ACCTGC	2	12	2644449	2644460	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013209	CCGGAT	2	12	2677635	2677646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013209	TCGCTG	2	12	2701064	2701075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013209	GCTTGC	2	12	2701210	2701221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013209	CTCGCC	2	12	2765754	2765765	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013209	TCTTAC	2	12	2786653	2786664	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013209	ATTTTA	2	12	2788767	2788778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013209	CTTTTT	2	12	2805757	2805768	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013209	GCTTCT	2	12	2843798	2843809	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013209	TCCTTT	2	12	2868594	2868605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.