MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013209	GCTTG	2	10	169	178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013209	GTACG	2	10	937	946	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013209	AATAA	2	10	2603	2612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013209	TTTGA	2	10	59031	59040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013209	CTGAA	2	10	67913	67922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013209	CAAGG	2	10	71136	71145	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013209	AAGGT	2	10	79292	79301	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013209	TTTTC	2	10	83188	83197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013209	GCTCT	2	10	84520	84529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013209	AGGGA	2	10	84576	84585	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013209	CAGAA	2	10	87578	87587	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013209	GCGTT	2	10	89967	89976	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013209	AGGGC	2	10	96648	96657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013209	AAAAC	2	10	112799	112808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013209	AACAG	2	10	120933	120942	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013209	GCATA	2	10	126079	126088	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013209	CAGGA	2	10	136034	136043	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013209	CCTAT	2	10	140554	140563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013209	TAGAT	2	10	150647	150656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013209	ATTTT	2	10	150715	150724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013209	CAAAA	2	10	157372	157381	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013209	TAAAG	2	10	163736	163745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013209	TAGAG	2	10	163998	164007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013209	GTAAA	2	10	181423	181432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013209	TTCCA	2	10	205975	205984	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013209	GAATG	2	10	223657	223666	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013209	AAAAG	2	10	230260	230269	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013209	ACCGC	2	10	280863	280872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_013209	CTGTC	2	10	291042	291051	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_013209	ATCCT	2	10	300755	300764	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013209	CTTTA	2	10	303642	303651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013209	ATAGT	2	10	345652	345661	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013209	TATAT	2	10	345711	345720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013209	GGGCA	2	10	348111	348120	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013209	ACGGC	2	10	349103	349112	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013209	AAAGG	2	10	350892	350901	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013209	TTGCG	2	10	352886	352895	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013209	TCAAC	2	10	354748	354757	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013209	TCTAC	2	10	354758	354767	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013209	TTTCT	2	10	358163	358172	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013209	CTTTA	2	10	363586	363595	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013209	CACCC	2	10	368171	368180	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_013209	ATTAA	2	10	368186	368195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013209	AACAC	2	10	379221	379230	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013209	ATGGC	2	10	391765	391774	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013209	AAACA	2	10	413288	413297	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013209	TGAAC	2	10	413496	413505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013209	GGGGC	2	10	419590	419599	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013209	GGGCA	2	10	424169	424178	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013209	AGGGT	2	10	433027	433036	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013209	ACAGA	2	10	458360	458369	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013209	AACAG	2	10	465436	465445	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013209	GGGGT	2	10	473921	473930	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013209	AACAA	2	10	477231	477240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013209	GCCAC	2	10	487195	487204	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_013209	CGGAA	2	10	491301	491310	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013209	GCCGG	2	10	501962	501971	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_013209	GGGTG	2	10	503243	503252	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013209	TTGCG	2	10	505190	505199	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013209	GGGGA	2	10	533466	533475	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013209	GGCGT	2	10	535009	535018	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013209	GAAAA	2	10	565225	565234	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013209	AGAAA	2	10	583128	583137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013209	AAAGA	2	10	606452	606461	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013209	GTCTG	2	10	616569	616578	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013209	TGCGG	2	10	618027	618036	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013209	CATGT	2	10	636260	636269	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013209	GGCAG	2	10	637381	637390	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013209	GTGGC	2	10	643183	643192	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013209	TGTGG	2	10	645091	645100	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013209	TTTGT	2	10	650006	650015	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013209	TTTTC	2	10	656005	656014	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013209	CAGGG	2	10	662790	662799	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013209	GGAAG	2	10	680889	680898	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013209	GTTAC	2	10	699806	699815	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013209	CGTTT	2	10	725052	725061	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013209	ACGTA	2	10	732341	732350	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013209	GGGAA	2	10	771687	771696	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013209	GCTGT	2	10	771887	771896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013209	TTTCT	2	10	785438	785447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013209	CGAGA	2	10	799660	799669	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013209	GGTGT	2	10	821567	821576	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013209	CTTGC	2	10	851512	851521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013209	TTTCT	2	10	855119	855128	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013209	GGGTG	2	10	866436	866445	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013209	CAAGC	2	10	867607	867616	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013209	AATTT	2	10	867980	867989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013209	AAAGG	2	10	868294	868303	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013209	TTTTC	2	10	875885	875894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013209	AGATA	2	10	888814	888823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013209	CTGAA	2	10	889177	889186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013209	AAGGA	2	10	912525	912534	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013209	AGCTA	2	10	937324	937333	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013209	TCTCA	2	10	950836	950845	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013209	GCACA	2	10	1051342	1051351	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_013209	GTTGT	2	10	1068951	1068960	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013209	TGCAC	2	10	1092802	1092811	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013209	AAAAG	2	10	1096074	1096083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013209	GTGAA	2	10	1108225	1108234	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013209	GAAAA	2	10	1155088	1155097	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013209	AAAAT	2	10	1176991	1177000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013209	TCTGT	2	10	1177046	1177055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013209	TAAAA	2	10	1177146	1177155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013209	TTCCT	2	10	1186067	1186076	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_013209	GCAAG	2	10	1238027	1238036	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013209	TCCTG	2	10	1243023	1243032	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_013209	TCTTT	2	10	1248563	1248572	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013209	GTTTT	2	10	1253620	1253629	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013209	TCTTT	2	10	1257721	1257730	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013209	CACAA	2	10	1306298	1306307	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_013209	CTGCC	2	10	1334090	1334099	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_013209	ACGAT	2	10	1347768	1347777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013209	CCTTG	2	10	1366799	1366808	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_013209	AACGA	2	10	1368829	1368838	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013209	CACAA	2	10	1390638	1390647	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_013209	AACAG	2	10	1403866	1403875	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013209	TAATA	2	10	1404505	1404514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013209	ACGCA	2	10	1419575	1419584	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_013209	AAGGA	2	10	1462396	1462405	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013209	TAAAA	2	10	1462417	1462426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013209	AGGAA	2	10	1473609	1473618	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013209	AAAAC	2	10	1474828	1474837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013209	AAAAT	2	10	1477902	1477911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013209	GCTAG	2	10	1488383	1488392	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013209	AATAA	2	10	1517199	1517208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013209	ATTTC	2	10	1519028	1519037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013209	TTTCT	2	10	1523145	1523154	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013209	TTTCT	2	10	1527466	1527475	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013209	TGGTG	2	10	1531343	1531352	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013209	TGTTC	2	10	1531356	1531365	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013209	GGGAT	2	10	1536602	1536611	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013209	GCCCA	2	10	1540614	1540623	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_013209	CACGA	2	10	1540681	1540690	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_013209	CCCAT	2	10	1542011	1542020	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_013209	CCTTT	2	10	1547817	1547826	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_013209	TATTT	2	10	1562840	1562849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013209	CACAA	2	10	1566419	1566428	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_013209	ATAGC	2	10	1566545	1566554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013209	TTATT	2	10	1585427	1585436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013209	TTAAA	2	10	1596874	1596883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013209	ATTAA	2	10	1596886	1596895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013209	TAAAT	2	10	1604587	1604596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013209	TACGC	2	10	1617738	1617747	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_013209	TATAT	2	10	1630235	1630244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013209	AAATT	2	10	1663619	1663628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013209	ATTTT	2	10	1673760	1673769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013209	TAAAT	2	10	1673834	1673843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013209	TATTT	2	10	1673955	1673964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013209	TAAAA	2	10	1674190	1674199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013209	CGATA	2	10	1680234	1680243	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_013209	ATAAA	2	10	1680244	1680253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013209	ATTTT	2	10	1683261	1683270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013209	ATTTT	2	10	1687836	1687845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013209	CTTAC	2	10	1717418	1717427	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_013209	GGGAT	2	10	1729685	1729694	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013209	GCCCA	2	10	1733697	1733706	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
157	NC_013209	CACGA	2	10	1733764	1733773	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_013209	CCCAT	2	10	1735094	1735103	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
159	NC_013209	AGAAA	2	10	1754012	1754021	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013209	GAAAA	2	10	1784253	1784262	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013209	CCCCG	2	10	1787457	1787466	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
162	NC_013209	TGCCT	2	10	1829970	1829979	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
163	NC_013209	CAGAG	2	10	1873448	1873457	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_013209	CTTTT	2	10	1888555	1888564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_013209	TGCCG	2	10	1908598	1908607	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
167	NC_013209	TCTTT	2	10	1911396	1911405	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_013209	TCGGA	2	10	1913081	1913090	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
169	NC_013209	ACCGC	2	10	1919486	1919495	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
170	NC_013209	CGACC	2	10	1921773	1921782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
171	NC_013209	GTACG	2	10	1922192	1922201	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_013209	GCTGG	2	10	1922465	1922474	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
173	NC_013209	CCCTG	2	10	1922689	1922698	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
174	NC_013209	ACGGT	2	10	1923567	1923576	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_013209	TAACG	2	10	1929469	1929478	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
176	NC_013209	AGAAA	2	10	1941314	1941323	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_013209	ACGAC	2	10	1961711	1961720	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
180	NC_013209	TATAA	2	10	1963528	1963537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013209	CACTA	2	10	1963621	1963630	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
182	NC_013209	CGAAT	2	10	1963808	1963817	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_013209	ATATA	2	10	1969558	1969567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013209	CAACA	2	10	1980349	1980358	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_013209	GCCCT	2	10	1993609	1993618	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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188	NC_013209	GGCTT	2	10	2012886	2012895	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
189	NC_013209	CCCTG	2	10	2016650	2016659	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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192	NC_013209	ACATA	2	10	2026385	2026394	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_013209	CGGCG	2	10	2032050	2032059	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
194	NC_013209	CATAG	2	10	2032284	2032293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
195	NC_013209	CTATG	2	10	2041720	2041729	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
196	NC_013209	ATTTT	2	10	2042322	2042331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_013209	CCTTT	2	10	2048128	2048137	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_013209	CCGCT	2	10	2053759	2053768	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
199	NC_013209	CTGAC	2	10	2056763	2056772	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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201	NC_013209	TGACC	2	10	2085708	2085717	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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222	NC_013209	ATGAA	2	10	2346812	2346821	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_013209	CTGCT	2	10	2431023	2431032	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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261	NC_013209	TAAGT	2	10	2757220	2757229	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_013209	CTGCA	2	10	2763911	2763920	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
263	NC_013209	GGGAT	2	10	2764213	2764222	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_013209	CACGA	2	10	2768292	2768301	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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270	NC_013209	TACAA	2	10	2839264	2839273	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_013209	CACAT	2	10	2840096	2840105	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
272	NC_013209	CATTA	2	10	2858527	2858536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_013209	AAAAG	2	10	2867098	2867107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_013209	GCAAA	2	10	2893785	2893794	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.