MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013207	AT	3	6	643	648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013207	TG	3	6	669	674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013207	TG	3	6	738	743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013207	TC	3	6	761	766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013207	GT	3	6	1234	1239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013207	GT	3	6	1369	1374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013207	AC	3	6	1472	1477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013207	CA	3	6	1737	1742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013207	TC	3	6	1778	1783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013207	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013207	CT	3	6	7010	7015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013207	CA	3	6	7428	7433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013207	GA	3	6	7451	7456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013207	GT	3	6	8681	8686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013207	AC	3	6	12886	12891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013207	AT	3	6	12898	12903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013207	CA	3	6	14641	14646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013207	CG	3	6	15639	15644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013207	CG	3	6	15742	15747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013207	GC	3	6	15821	15826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013207	TC	3	6	16369	16374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013207	AT	3	6	16698	16703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013207	AC	3	6	17149	17154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013207	CG	3	6	17159	17164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013207	GT	3	6	17224	17229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013207	GA	3	6	25105	25110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013207	CG	3	6	25536	25541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013207	TC	3	6	25608	25613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013207	GT	3	6	25677	25682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013207	TG	3	6	26185	26190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013207	TG	4	8	27657	27664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013207	AT	3	6	27675	27680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013207	GA	3	6	27681	27686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013207	CG	3	6	28940	28945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013207	GA	3	6	28984	28989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013207	GA	3	6	29051	29056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013207	CT	3	6	29068	29073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013207	AG	3	6	33225	33230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013207	CG	3	6	33985	33990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013207	GA	3	6	34065	34070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013207	AC	3	6	34231	34236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013207	GC	4	8	34676	34683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013207	GT	3	6	39808	39813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013207	AG	3	6	46852	46857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013207	CA	3	6	52911	52916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013207	AC	3	6	55744	55749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013207	CT	3	6	65359	65364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013207	GC	3	6	75194	75199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013207	CG	3	6	77952	77957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013207	CT	3	6	85021	85026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013207	AC	3	6	85177	85182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.