MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI01

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013206	CG	3	6	1110	1115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013206	AT	3	6	3081	3086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013206	AC	3	6	23341	23346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013206	TG	3	6	23352	23357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013206	AG	3	6	24714	24719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013206	TG	3	6	25022	25027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013206	TA	3	6	28438	28443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013206	TA	3	6	28717	28722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013206	CG	3	6	28735	28740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013206	AT	3	6	38430	38435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013206	CA	3	6	50106	50111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013206	TG	3	6	50135	50140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013206	TG	3	6	50966	50971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013206	CG	3	6	53476	53481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013206	AT	3	6	53856	53861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013206	TC	3	6	59491	59496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013206	GT	3	6	59569	59574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013206	CG	3	6	59602	59607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013206	TG	3	6	59613	59618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013206	GT	3	6	59668	59673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013206	GA	3	6	65065	65070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013206	CT	3	6	65483	65488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013206	TA	3	6	65567	65572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013206	TA	3	6	67477	67482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013206	TG	3	6	67602	67607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013206	GC	3	6	68263	68268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013206	TA	3	6	68904	68909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013206	CG	3	6	68922	68927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013206	TC	3	6	69453	69458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013206	TG	3	6	72166	72171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013206	CT	3	6	76305	76310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013206	GT	3	6	76321	76326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013206	GC	3	6	77504	77509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013206	GC	3	6	78409	78414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013206	GA	3	6	78439	78444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013206	TC	3	6	89006	89011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013206	TC	4	8	89103	89110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013206	TA	3	6	89241	89246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.