MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 1055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013205	TCGT	2	8	52	59	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013205	TCCT	2	8	1621	1628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013205	TGGA	2	8	8681	8688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013205	TGAC	2	8	11521	11528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013205	AGCC	2	8	12232	12239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013205	GCGA	2	8	12672	12679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013205	AGCC	2	8	12769	12776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013205	GGCC	2	8	12808	12815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013205	GCGA	2	8	13095	13102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013205	GCGA	2	8	13452	13459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013205	ACCG	2	8	15148	15155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013205	GAAG	2	8	15270	15277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013205	GCGA	2	8	15428	15435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013205	GAGC	2	8	15540	15547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013205	AGCC	2	8	15557	15564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013205	GGGA	2	8	15641	15648	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013205	AGGT	2	8	15661	15668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013205	CAGC	2	8	15836	15843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013205	GGTT	2	8	17697	17704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013205	GCGT	2	8	21085	21092	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013205	ATGT	2	8	22996	23003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013205	TGCT	2	8	24756	24763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013205	TCCA	2	8	24780	24787	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013205	TTTC	2	8	24958	24965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013205	TGAG	2	8	27847	27854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013205	ACTC	2	8	27856	27863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013205	TCGC	2	8	29188	29195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013205	CGTC	2	8	29413	29420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013205	TGGA	2	8	29455	29462	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013205	CTTC	2	8	30339	30346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013205	TGGT	2	8	30632	30639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013205	GTAA	2	8	30716	30723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013205	ACGA	2	8	30820	30827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013205	GAGC	2	8	33982	33989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013205	CGTG	2	8	36767	36774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013205	CACT	2	8	38544	38551	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013205	GCGG	2	8	38959	38966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013205	GACC	2	8	39049	39056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013205	GTAT	2	8	39391	39398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013205	GCCA	2	8	40353	40360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013205	CCCA	2	8	40368	40375	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_013205	CCGT	2	8	55611	55618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013205	TGAC	2	8	65886	65893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013205	ACTC	2	8	67181	67188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013205	TTTG	2	8	69106	69113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013205	CGAG	2	8	72567	72574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013205	ATCC	2	8	72654	72661	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013205	TGGC	2	8	80855	80862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013205	TTGT	2	8	80885	80892	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013205	TGTC	2	8	80955	80962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013205	TCCT	2	8	84266	84273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013205	GATG	2	8	84359	84366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013205	GAAG	2	8	97329	97336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013205	CCGA	2	8	101032	101039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013205	GCTT	2	8	101081	101088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013205	CGTT	2	8	109901	109908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013205	TGCC	2	8	111217	111224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013205	GCCG	2	8	114537	114544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013205	CAGG	2	8	115191	115198	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013205	GCGG	2	8	121618	121625	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013205	CCGG	2	8	124777	124784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013205	GAAT	2	8	128164	128171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013205	AGAT	2	8	128181	128188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013205	TTCA	2	8	130665	130672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013205	CGTG	2	8	130737	130744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013205	CCGA	2	8	132164	132171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013205	AGGG	2	8	134082	134089	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013205	AGGG	2	8	134483	134490	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013205	GGTG	2	8	139220	139227	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013205	GTTC	2	8	143075	143082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013205	GAAG	2	8	143107	143114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013205	CGAG	2	8	151034	151041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013205	CGCC	2	8	152983	152990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_013205	TCGC	2	8	154009	154016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013205	CATC	2	8	157619	157626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013205	GGTC	2	8	164999	165006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013205	CGGG	2	8	165197	165204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013205	AAGA	2	8	167344	167351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013205	GCCA	2	8	172553	172560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013205	TCGA	2	8	175492	175499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013205	CGGG	2	8	176419	176426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013205	TGAT	2	8	182009	182016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013205	AAGG	2	8	182062	182069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013205	AGGG	2	8	188783	188790	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013205	CGGA	2	8	202900	202907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013205	CAGA	2	8	203075	203082	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013205	CGCA	2	8	203094	203101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013205	TGTA	2	8	208061	208068	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013205	CTGC	2	8	208732	208739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013205	GGCG	2	8	215113	215120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013205	TCTT	2	8	215121	215128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013205	GACA	2	8	219357	219364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013205	TGAA	2	8	219610	219617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013205	GGCG	2	8	225705	225712	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013205	TGAC	2	8	226660	226667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013205	AGCC	2	8	227371	227378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013205	GCGA	2	8	227811	227818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013205	AGCC	2	8	227908	227915	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013205	GGCC	2	8	227947	227954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013205	GCGA	2	8	228234	228241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013205	GCGA	2	8	228591	228598	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013205	ACCG	2	8	230287	230294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013205	GAAG	2	8	230409	230416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013205	GCGA	2	8	230567	230574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013205	GAGC	2	8	230679	230686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013205	AGCC	2	8	230696	230703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013205	GGGA	2	8	230780	230787	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013205	AGGT	2	8	230800	230807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013205	GCGT	2	8	230923	230930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013205	AGGC	2	8	231884	231891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013205	GCGA	2	8	236673	236680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013205	GGGC	2	8	236685	236692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013205	CTCG	2	8	237938	237945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013205	CGAA	2	8	238631	238638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013205	TTTG	2	8	239704	239711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013205	CAAC	2	8	247155	247162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013205	GCCT	2	8	250221	250228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013205	ATCC	2	8	250310	250317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013205	GCCC	2	8	259073	259080	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_013205	CATC	2	8	260326	260333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013205	GGTG	2	8	260388	260395	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013205	GATG	2	8	268785	268792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013205	AGAA	2	8	268901	268908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013205	GACA	2	8	268916	268923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013205	AGGG	2	8	268925	268932	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013205	TCAT	2	8	273433	273440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013205	CGGG	2	8	273569	273576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013205	CCAT	2	8	283409	283416	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013205	GAAA	2	8	284737	284744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013205	GCCG	2	8	289163	289170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013205	TGGA	2	8	290978	290985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013205	ATTG	2	8	292727	292734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013205	CAGG	2	8	293947	293954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013205	AGGC	2	8	294826	294833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013205	CCAA	2	8	294969	294976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013205	TGAC	2	8	296736	296743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013205	AGCC	2	8	297447	297454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013205	ATGG	2	8	297563	297570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013205	GCGA	2	8	297888	297895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013205	AGCC	2	8	297985	297992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013205	GGCC	2	8	298024	298031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013205	GCGA	2	8	298311	298318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013205	GCGA	2	8	298668	298675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013205	GGGA	2	8	299237	299244	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013205	GAAG	2	8	299425	299432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013205	ACCG	2	8	300366	300373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013205	GAAG	2	8	300488	300495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013205	GCGA	2	8	300645	300652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013205	CGAG	2	8	300684	300691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013205	GGGA	2	8	300786	300793	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013205	AGGT	2	8	300806	300813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013205	CCAG	2	8	300983	300990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_013205	GAAG	2	8	305624	305631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013205	TTTG	2	8	317324	317331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_013205	CGGC	2	8	360523	360530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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463	NC_013205	CGGG	2	8	1154085	1154092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_013205	GAAT	2	8	1155361	1155368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_013205	CATC	2	8	1177181	1177188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
484	NC_013205	GTCG	2	8	1177702	1177709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_013205	GGAT	2	8	1178164	1178171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_013205	GAAG	2	8	1178347	1178354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_013205	CCGC	2	8	1188340	1188347	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
492	NC_013205	TCCC	2	8	1188808	1188815	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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494	NC_013205	AACC	2	8	1190366	1190373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_013205	TTCC	2	8	1190736	1190743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_013205	GGGT	2	8	1190935	1190942	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
497	NC_013205	AGTG	2	8	1191063	1191070	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_013205	AGGG	2	8	1192905	1192912	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
499	NC_013205	GGGA	2	8	1199080	1199087	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
500	NC_013205	TGTC	2	8	1201901	1201908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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