MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013205	GC	3	6	1485633	1485638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_013205	GGGCCG	2	12	1485640	1485651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_013205	TGA	2	6	1485709	1485714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_013205	GAAA	2	8	1485742	1485749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_013205	GGC	2	6	1485761	1485766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_013205	GT	3	6	1485786	1485791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013205	TGCCGT	2	12	1485842	1485853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_013205	GC	3	6	1485870	1485875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_013205	TTC	2	6	1492326	1492331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_013205	AGG	2	6	1492353	1492358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_013205	ATC	2	6	1492359	1492364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_013205	CTT	2	6	1492653	1492658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_013205	TG	3	6	1492664	1492669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_013205	AGG	2	6	1492726	1492731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_013205	ACC	2	6	1494953	1494958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_013205	AGGCG	2	10	1495973	1495982	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4017	NC_013205	AGG	2	6	1496009	1496014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_013205	T	6	6	1497804	1497809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013205	AG	3	6	1502587	1502592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_013205	GA	3	6	1502593	1502598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013205	TGT	2	6	1503919	1503924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_013205	CT	3	6	1503962	1503967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_013205	CGG	2	6	1503991	1503996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_013205	GAG	2	6	1509227	1509232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_013205	GGA	2	6	1512081	1512086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_013205	CGG	2	6	1514038	1514043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_013205	GC	3	6	1514062	1514067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_013205	TCAA	2	8	1514088	1514095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_013205	CGG	2	6	1514185	1514190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_013205	CGGGT	2	10	1514319	1514328	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4031	NC_013205	T	8	8	1514384	1514391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_013205	CGGG	3	12	1514420	1514431	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_013205	TCG	2	6	1516209	1516214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_013205	CCG	2	6	1516228	1516233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_013205	GCG	2	6	1516252	1516257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_013205	CGG	2	6	1516296	1516301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_013205	AAGG	2	8	1517344	1517351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_013205	GAC	2	6	1519848	1519853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_013205	CAT	2	6	1520835	1520840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_013205	GA	4	8	1520864	1520871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013205	GGAGT	2	10	1520972	1520981	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_013205	AGGG	2	8	1522828	1522835	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_013205	TGC	2	6	1527907	1527912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_013205	GTTT	2	8	1527943	1527950	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_013205	GAA	2	6	1528063	1528068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_013205	GT	3	6	1528080	1528085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_013205	ACA	2	6	1529845	1529850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_013205	TCG	2	6	1529922	1529927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_013205	AGG	2	6	1529937	1529942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_013205	GCG	2	6	1531555	1531560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_013205	GCG	2	6	1531565	1531570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_013205	AGG	2	6	1531647	1531652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_013205	CGC	2	6	1532904	1532909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_013205	GGC	2	6	1532914	1532919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_013205	TCG	2	6	1532939	1532944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_013205	CT	3	6	1532966	1532971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_013205	GCG	2	6	1533022	1533027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_013205	AGG	2	6	1533163	1533168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_013205	CCCT	2	8	1533744	1533751	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4060	NC_013205	GGA	2	6	1533760	1533765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_013205	GC	3	6	1533769	1533774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_013205	G	6	6	1534856	1534861	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_013205	G	6	6	1535998	1536003	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013205	CTC	2	6	1538874	1538879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_013205	ACC	2	6	1538939	1538944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_013205	CGAG	2	8	1547457	1547464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_013205	GTCG	2	8	1547484	1547491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_013205	CGA	2	6	1547504	1547509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_013205	CGC	2	6	1547553	1547558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_013205	GTAG	2	8	1547579	1547586	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_013205	TCC	2	6	1547668	1547673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_013205	CGG	2	6	1547711	1547716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_013205	GCC	2	6	1547750	1547755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_013205	CGG	2	6	1547908	1547913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_013205	CAT	2	6	1547932	1547937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_013205	CCG	2	6	1548102	1548107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_013205	GACT	2	8	1548114	1548121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_013205	CAG	2	6	1548147	1548152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_013205	TGGA	2	8	1548185	1548192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_013205	GGAG	3	12	1548297	1548308	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_013205	ATA	2	6	1548316	1548321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_013205	TC	3	6	1548324	1548329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_013205	TC	3	6	1548357	1548362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_013205	GTAG	2	8	1548442	1548449	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013205	TG	3	6	1548489	1548494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_013205	TCGG	2	8	1548498	1548505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_013205	GC	3	6	1548587	1548592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_013205	CGC	2	6	1548746	1548751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_013205	TGC	2	6	1548770	1548775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_013205	ACG	2	6	1548833	1548838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_013205	CCG	2	6	1548844	1548849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_013205	TC	3	6	1548855	1548860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_013205	TCC	2	6	1548937	1548942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_013205	CTG	2	6	1548944	1548949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_013205	GCT	2	6	1549010	1549015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_013205	CTT	2	6	1549025	1549030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_013205	GAT	2	6	1549056	1549061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013205	CCA	2	6	1549067	1549072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_013205	TGCG	2	8	1549182	1549189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_013205	CAC	2	6	1549197	1549202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_013205	ACGC	2	8	1549206	1549213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_013205	CTCG	2	8	1549269	1549276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_013205	GCC	2	6	1549359	1549364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_013205	GGAAG	2	10	1549614	1549623	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_013205	TG	3	6	1549708	1549713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_013205	TCCG	2	8	1549723	1549730	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_013205	A	6	6	1549810	1549815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013205	CCT	2	6	1549893	1549898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_013205	TAG	2	6	1549920	1549925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_013205	CTT	2	6	1549939	1549944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_013205	GAC	2	6	1549956	1549961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_013205	ACC	2	6	1549971	1549976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_013205	ACTCTA	2	12	1549984	1549995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_013205	AGG	2	6	1550017	1550022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_013205	ATT	2	6	1550179	1550184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013205	AG	3	6	1550208	1550213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_013205	AGG	2	6	1550257	1550262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_013205	CCG	2	6	1551089	1551094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_013205	CCGC	2	8	1551107	1551114	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4120	NC_013205	GAC	2	6	1551134	1551139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_013205	CTA	2	6	1551403	1551408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_013205	CGA	2	6	1551436	1551441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_013205	AGG	2	6	1551447	1551452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_013205	CGT	2	6	1551744	1551749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_013205	GTC	2	6	1553550	1553555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_013205	CTCG	2	8	1553574	1553581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_013205	CG	3	6	1553603	1553608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_013205	ACC	2	6	1554128	1554133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_013205	CCG	2	6	1554350	1554355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_013205	GAG	2	6	1554367	1554372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_013205	C	6	6	1555677	1555682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4132	NC_013205	GC	3	6	1555755	1555760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_013205	AAG	2	6	1555828	1555833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_013205	TA	3	6	1556579	1556584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_013205	TAT	2	6	1556590	1556595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4139	NC_013205	GTT	2	6	1557927	1557932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4150	NC_013205	GCTTG	2	10	1558361	1558370	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4151	NC_013205	GATA	2	8	1558414	1558421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4231	NC_013205	CTT	2	6	1574811	1574816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4257	NC_013205	GAA	2	6	1577843	1577848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_013205	AC	3	6	1579194	1579199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4261	NC_013205	GGA	2	6	1579317	1579322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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