MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013205	CGT	2	6	487550	487555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_013205	TCC	2	6	488168	488173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_013205	CAGG	2	8	488229	488236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_013205	AG	3	6	488783	488788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013205	GGGC	2	8	488805	488812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_013205	GCCA	2	8	489039	489046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_013205	CTG	2	6	489068	489073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_013205	GGT	2	6	489079	489084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013205	GGT	2	6	490306	490311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013205	C	6	6	491002	491007	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1511	NC_013205	T	6	6	491008	491013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013205	GGC	2	6	491101	491106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013205	AGG	2	6	491127	491132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013205	CGG	2	6	493546	493551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013205	CTG	2	6	494394	494399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_013205	GAT	2	6	494400	494405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013205	GTG	2	6	494408	494413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013205	GGTT	2	8	494461	494468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013205	GAA	2	6	494911	494916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013205	CGC	3	9	494938	494946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_013205	T	7	7	494963	494969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013205	GC	3	6	495004	495009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_013205	ATG	2	6	495024	495029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013205	TCC	2	6	497443	497448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_013205	TTC	2	6	497573	497578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_013205	TC	4	8	497586	497593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_013205	AAGG	2	8	501176	501183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_013205	GGAG	2	8	503943	503950	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013205	CCG	2	6	504573	504578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_013205	G	6	6	507738	507743	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013205	TGT	2	6	507776	507781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013205	GCC	2	6	507824	507829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_013205	GCT	2	6	507830	507835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_013205	GGC	2	6	507843	507848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_013205	GGGAA	2	10	509123	509132	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013205	AGG	2	6	510601	510606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013205	G	6	6	512040	512045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013205	GGC	2	6	513506	513511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_013205	GTGCC	2	10	513517	513526	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1540	NC_013205	GAG	2	6	513556	513561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013205	AGG	2	6	515366	515371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013205	CG	3	6	518581	518586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_013205	GGC	2	6	518655	518660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_013205	AGCA	2	8	518699	518706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_013205	TGC	2	6	518721	518726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_013205	CGG	2	6	518762	518767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_013205	CGGG	2	8	518806	518813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_013205	GGC	2	6	518859	518864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_013205	CGC	3	9	518876	518884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_013205	CCG	2	6	520881	520886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_013205	CCG	2	6	520926	520931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_013205	GTGA	2	8	520964	520971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013205	G	6	6	521985	521990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013205	GAG	2	6	522003	522008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013205	GCC	2	6	522518	522523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_013205	CGTC	2	8	527476	527483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_013205	TTC	2	6	527521	527526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_013205	GT	3	6	527553	527558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013205	CCT	2	6	528288	528293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_013205	GCC	2	6	528304	528309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_013205	GAA	2	6	528338	528343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013205	GCGG	2	8	529854	529861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_013205	CGG	2	6	529918	529923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_013205	GC	3	6	529937	529942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_013205	CGCT	2	8	529975	529982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_013205	CCT	2	6	530000	530005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_013205	TCAC	2	8	530007	530014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_013205	AGG	2	6	530049	530054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013205	AGG	2	6	531963	531968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013205	GC	3	6	533154	533159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_013205	GAT	2	6	533169	533174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013205	CCA	2	6	533280	533285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_013205	GACA	2	8	535779	535786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_013205	TG	3	6	535806	535811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013205	TGAGG	2	10	536129	536138	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013205	TGG	2	6	536140	536145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_013205	AGAA	2	8	536230	536237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013205	GCG	2	6	536258	536263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_013205	CCG	2	6	536271	536276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_013205	TGG	2	6	536281	536286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013205	CCCG	2	8	536296	536303	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1582	NC_013205	AGG	2	6	536407	536412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013205	GGAGAC	2	12	536418	536429	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1584	NC_013205	TGG	2	6	537002	537007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013205	CCT	2	6	537836	537841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_013205	CGG	2	6	538672	538677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_013205	GAA	2	6	538681	538686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013205	CAC	2	6	538707	538712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_013205	AGG	2	6	539720	539725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013205	CCGCG	2	10	540580	540589	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1591	NC_013205	GCG	2	6	540617	540622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_013205	GCC	2	6	540628	540633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_013205	GCG	2	6	540656	540661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_013205	GGCGC	2	10	540678	540687	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1595	NC_013205	CAC	2	6	540787	540792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_013205	CCG	2	6	540796	540801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_013205	GC	3	6	540834	540839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_013205	GACTG	2	10	540890	540899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1599	NC_013205	ATC	2	6	540900	540905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_013205	CAG	2	6	540995	541000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_013205	ATG	2	6	541050	541055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013205	ATG	2	6	541065	541070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013205	TGGA	2	8	541170	541177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013205	AG	3	6	541254	541259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013205	TCT	2	6	541261	541266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_013205	CT	3	6	541265	541270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_013205	CCG	2	6	541291	541296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_013205	GC	3	6	541306	541311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_013205	GC	3	6	541337	541342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_013205	TGT	2	6	541343	541348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013205	CG	3	6	541359	541364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_013205	GCG	2	6	541374	541379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_013205	CCGC	2	8	541386	541393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1614	NC_013205	ACG	2	6	541425	541430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_013205	GA	3	6	541488	541493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013205	CGC	2	6	541499	541504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_013205	CCG	2	6	541570	541575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_013205	GA	3	6	541632	541637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013205	GAA	2	6	541657	541662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013205	ATTGGG	2	12	541702	541713	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013205	GAC	2	6	542114	542119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_013205	ACCA	2	8	542241	542248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_013205	TAC	2	6	542339	542344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_013205	CTT	2	6	542351	542356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_013205	CT	3	6	542358	542363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_013205	GAAA	2	8	542367	542374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013205	AAG	2	6	542375	542380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_013205	GTG	2	6	542412	542417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013205	TTTC	2	8	542441	542448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_013205	TGA	2	6	545607	545612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013205	GGT	2	6	549538	549543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013205	CGA	3	9	549566	549574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_013205	GCG	2	6	549617	549622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_013205	CGA	2	6	549676	549681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_013205	CTG	2	6	549684	549689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_013205	CAT	2	6	549736	549741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_013205	CAA	2	6	550509	550514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_013205	GAT	2	6	550522	550527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1641	NC_013205	CTG	2	6	550631	550636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1643	NC_013205	CAT	2	6	550679	550684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1674	NC_013205	CTT	2	6	559937	559942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1757	NC_013205	CT	3	6	575879	575884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1758	NC_013205	TATCG	2	10	575887	575896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1767	NC_013205	CCT	2	6	576157	576162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1769	NC_013205	CAA	2	6	576215	576220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1770	NC_013205	ACT	2	6	576241	576246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1909	NC_013205	GAG	2	6	600566	600571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_013205	CGC	2	6	600572	600577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1911	NC_013205	CCT	2	6	600580	600585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1912	NC_013205	TTG	2	6	600589	600594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_013205	GAGG	2	8	600649	600656	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_013205	TAGG	2	8	602005	602012	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_013205	CAC	2	6	602013	602018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1918	NC_013205	TCC	2	6	603190	603195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1919	NC_013205	TGGA	2	8	603336	603343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1921	NC_013205	CGG	2	6	603468	603473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1924	NC_013205	AGC	2	6	603627	603632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1926	NC_013205	AG	3	6	603930	603935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1927	NC_013205	TCCC	2	8	603939	603946	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1930	NC_013205	TGC	2	6	604479	604484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1931	NC_013205	AG	3	6	604626	604631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_013205	ACG	2	6	604720	604725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1933	NC_013205	GAG	2	6	604733	604738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_013205	TGG	2	6	604816	604821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_013205	AGC	2	6	604921	604926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1938	NC_013205	C	6	6	605173	605178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1939	NC_013205	GGA	2	6	606318	606323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1941	NC_013205	GGC	2	6	607023	607028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1942	NC_013205	GTC	2	6	607044	607049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1945	NC_013205	GACG	2	8	607389	607396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1946	NC_013205	GACA	2	8	607440	607447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1951	NC_013205	CAT	2	6	607793	607798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1954	NC_013205	CCG	2	6	607863	607868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1957	NC_013205	GGGGT	2	10	608878	608887	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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1971	NC_013205	T	7	7	612088	612094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1977	NC_013205	TAT	2	6	615184	615189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1980	NC_013205	GGGA	2	8	615995	616002	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1981	NC_013205	GTC	2	6	616637	616642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1983	NC_013205	CA	3	6	616679	616684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1991	NC_013205	C	6	6	619432	619437	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1995	NC_013205	GCA	2	6	619666	619671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_013205	CGG	2	6	620772	620777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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