MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013205	TTCC	2	8	1866790	1866797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_013205	CTC	2	6	1869271	1869276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_013205	ATG	2	6	1870050	1870055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013205	A	7	7	1870075	1870081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013205	CGGA	2	8	1870096	1870103	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_013205	TGA	2	6	1871200	1871205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_013205	GA	3	6	1871250	1871255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013205	CG	3	6	1871277	1871282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_013205	CG	4	8	1871301	1871308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_013205	TTG	2	6	1873201	1873206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013205	A	8	8	1873287	1873294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_013205	CGG	2	6	1874403	1874408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_013205	CGC	3	9	1874438	1874446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_013205	GGC	2	6	1874554	1874559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_013205	CGC	2	6	1874580	1874585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_013205	TCC	2	6	1879977	1879982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_013205	ACC	2	6	1880034	1880039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_013205	GAC	2	6	1880108	1880113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_013205	GCCC	2	8	1880151	1880158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5020	NC_013205	CCTTC	2	10	1880186	1880195	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5021	NC_013205	TCC	2	6	1880794	1880799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_013205	GAC	2	6	1880818	1880823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_013205	GAG	2	6	1880905	1880910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_013205	CA	3	6	1881093	1881098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_013205	A	6	6	1881098	1881103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_013205	CCCG	2	8	1881132	1881139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5027	NC_013205	CTC	2	6	1882506	1882511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_013205	CCA	3	9	1882525	1882533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_013205	TCC	2	6	1886584	1886589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_013205	TA	3	6	1888785	1888790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013205	CT	3	6	1891992	1891997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_013205	CGC	2	6	1892027	1892032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_013205	TCCC	2	8	1893745	1893752	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5034	NC_013205	CTG	2	6	1893758	1893763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_013205	AGCC	2	8	1893805	1893812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_013205	GTTC	2	8	1895111	1895118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_013205	CCT	2	6	1895120	1895125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_013205	AAGGCA	2	12	1895153	1895164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5039	NC_013205	CCTC	2	8	1895784	1895791	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5040	NC_013205	GACAA	2	10	1895811	1895820	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5041	NC_013205	CTTGT	2	10	1895830	1895839	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5042	NC_013205	TCC	2	6	1897172	1897177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_013205	CGA	2	6	1897200	1897205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_013205	GC	3	6	1897214	1897219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_013205	CAC	2	6	1897229	1897234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_013205	GGTG	2	8	1897281	1897288	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013205	AGG	2	6	1897315	1897320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_013205	AGA	2	6	1897346	1897351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_013205	GCT	2	6	1897354	1897359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_013205	CGC	2	6	1897413	1897418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_013205	ACC	2	6	1897467	1897472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_013205	CTC	2	6	1898993	1898998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_013205	TCCTG	2	10	1899490	1899499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5054	NC_013205	T	6	6	1899533	1899538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_013205	CA	3	6	1900798	1900803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_013205	CTT	2	6	1902063	1902068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_013205	ATG	2	6	1902501	1902506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_013205	GGC	2	6	1902537	1902542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013205	A	8	8	1902555	1902562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_013205	ATG	2	6	1903333	1903338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_013205	CGA	2	6	1903354	1903359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_013205	CTTCG	2	10	1903361	1903370	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5063	NC_013205	CCT	2	6	1903821	1903826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_013205	CTC	2	6	1905137	1905142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_013205	CCG	2	6	1905164	1905169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_013205	GC	3	6	1905264	1905269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_013205	AGG	2	6	1905310	1905315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_013205	GC	3	6	1906921	1906926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_013205	CGC	2	6	1906946	1906951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_013205	CAT	2	6	1906989	1906994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_013205	GC	3	6	1907016	1907021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_013205	TCC	2	6	1909429	1909434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_013205	CTT	2	6	1909438	1909443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_013205	A	6	6	1909460	1909465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_013205	CGGC	2	8	1909496	1909503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_013205	CGA	2	6	1909511	1909516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5078	NC_013205	TCCC	2	8	1912554	1912561	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5079	NC_013205	TCC	2	6	1913234	1913239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_013205	CG	3	6	1913272	1913277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_013205	GTGCAA	2	12	1913289	1913300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5082	NC_013205	ACGC	2	8	1913320	1913327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_013205	TC	3	6	1916730	1916735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_013205	GGAT	2	8	1916738	1916745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_013205	TCA	2	6	1916750	1916755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5087	NC_013205	CGC	2	6	1916797	1916802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5091	NC_013205	GTG	2	6	1916947	1916952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013205	CCG	2	6	1916980	1916985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5093	NC_013205	GCG	2	6	1916993	1916998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_013205	AGTC	2	8	1917069	1917076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_013205	T	7	7	1917203	1917209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_013205	TGT	2	6	1917214	1917219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_013205	CCG	2	6	1917258	1917263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_013205	CCT	2	6	1918768	1918773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_013205	CCG	2	6	1918794	1918799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_013205	CG	3	6	1919169	1919174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_013205	CG	3	6	1919210	1919215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_013205	TC	3	6	1922167	1922172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_013205	CG	3	6	1922302	1922307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_013205	TTC	2	6	1923803	1923808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5108	NC_013205	GAG	2	6	1924111	1924116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013205	GGGA	2	8	1924119	1924126	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_013205	CCT	2	6	1926337	1926342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_013205	TCCG	2	8	1927742	1927749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_013205	CT	3	6	1928449	1928454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_013205	GCG	2	6	1928500	1928505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_013205	TCG	2	6	1928511	1928516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_013205	CGC	2	6	1928522	1928527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_013205	TCCC	2	8	1928741	1928748	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5117	NC_013205	GTAT	2	8	1928775	1928782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_013205	CG	4	8	1928789	1928796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_013205	GGCGCG	2	12	1930963	1930974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_013205	GAG	2	6	1931147	1931152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013205	CGTG	2	8	1932481	1932488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_013205	CGC	2	6	1932564	1932569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_013205	GGC	2	6	1932583	1932588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5125	NC_013205	CG	3	6	1932607	1932612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_013205	TCC	2	6	1935817	1935822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_013205	CCGT	2	8	1936408	1936415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5131	NC_013205	ATG	2	6	1939638	1939643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_013205	CCGC	2	8	1940962	1940969	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5383	NC_013205	CGAG	2	8	2079177	2079184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5390	NC_013205	ACC	2	6	2081182	2081187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5391	NC_013205	TGT	2	6	2081202	2081207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5393	NC_013205	CGT	3	9	2081277	2081285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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