MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 465

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013203	TCAT	2	8	183	190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013203	GAAA	2	8	194	201	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013203	ACGT	2	8	17197	17204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013203	ACTT	2	8	17245	17252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013203	GCTG	2	8	17578	17585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013203	TGGC	2	8	17837	17844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013203	TAAA	2	8	22770	22777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013203	ATGC	2	8	28531	28538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013203	ATTC	2	8	28994	29001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013203	TTGA	2	8	36785	36792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013203	AGGC	2	8	40590	40597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013203	TGGG	2	8	47487	47494	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013203	TGTA	2	8	47741	47748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013203	GTTT	2	8	50080	50087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013203	TTAA	2	8	50140	50147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013203	ATAA	2	8	52885	52892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013203	CTTT	2	8	55127	55134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013203	GTTT	2	8	55281	55288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013203	TCTT	2	8	55439	55446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013203	TAAA	2	8	58436	58443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013203	CAAT	2	8	58460	58467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013203	CGCA	2	8	65846	65853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013203	AAAG	2	8	65951	65958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013203	AAGT	2	8	67810	67817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013203	TCTT	2	8	70680	70687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013203	TTAT	2	8	72525	72532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013203	AGGT	2	8	72752	72759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013203	GTCA	2	8	80955	80962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013203	GAGG	2	8	81207	81214	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013203	CTGA	2	8	81439	81446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013203	TTCT	2	8	83308	83315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013203	ACAA	2	8	85163	85170	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013203	ATTG	2	8	86263	86270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013203	CGTA	2	8	86937	86944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013203	ATTT	2	8	87765	87772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013203	TATT	2	8	87791	87798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013203	AGCC	2	8	90753	90760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013203	TGGC	2	8	90772	90779	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013203	TTTC	3	12	95109	95120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013203	GAAT	2	8	96119	96126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013203	TTTG	2	8	108402	108409	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013203	ATGT	2	8	111311	111318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013203	GTTG	2	8	117038	117045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013203	TTGG	2	8	117046	117053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013203	CAGT	2	8	118384	118391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013203	TTTC	2	8	119461	119468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013203	AACA	2	8	119496	119503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013203	CAGA	2	8	119629	119636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013203	GTCA	2	8	121749	121756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013203	ACCG	2	8	123231	123238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013203	TTTG	2	8	129392	129399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013203	AAGC	2	8	133885	133892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013203	CGGA	2	8	134800	134807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013203	CAAA	2	8	143893	143900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013203	TCAT	2	8	146079	146086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013203	ATTT	2	8	151451	151458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013203	TGCT	2	8	157187	157194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013203	CGCA	2	8	169227	169234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013203	GGAG	2	8	180473	180480	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013203	CAGA	2	8	183009	183016	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013203	AGTT	2	8	190057	190064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013203	ACAG	2	8	191636	191643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013203	TTGT	2	8	194162	194169	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013203	AATG	2	8	195834	195841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013203	ATAA	2	8	195868	195875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013203	GTTC	2	8	195995	196002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013203	AATG	2	8	197567	197574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013203	TTTA	2	8	201331	201338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013203	TGAT	2	8	201879	201886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013203	TTAG	2	8	201955	201962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013203	AAAT	2	8	204831	204838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013203	CCAC	2	8	207019	207026	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_013203	GTTT	2	8	209519	209526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013203	TGGG	2	8	209652	209659	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013203	GTCC	2	8	216980	216987	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013203	AAAC	2	8	221508	221515	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013203	TTTG	2	8	223255	223262	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013203	CATC	2	8	226262	226269	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013203	ACTA	2	8	226745	226752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013203	ATTT	2	8	230053	230060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013203	GAAG	2	8	231461	231468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013203	TGTC	2	8	231514	231521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013203	GGAC	2	8	231605	231612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013203	TACT	2	8	231734	231741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013203	CTGC	2	8	231779	231786	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013203	GTTG	2	8	232002	232009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013203	CTCG	2	8	232476	232483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013203	GTTC	2	8	232521	232528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013203	CAGG	2	8	233544	233551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013203	GCGG	2	8	233555	233562	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013203	TTAT	2	8	245579	245586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013203	AATA	2	8	245606	245613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013203	ATTA	2	8	246579	246586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013203	ATGT	2	8	249550	249557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013203	TAGT	2	8	253450	253457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013203	ATTG	2	8	259194	259201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013203	TTAT	2	8	260934	260941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013203	TTGT	2	8	261038	261045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013203	AGTG	2	8	267379	267386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013203	CTAT	2	8	270478	270485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013203	TGTT	2	8	270538	270545	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013203	AGTT	2	8	272979	272986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013203	TTGT	2	8	273044	273051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013203	GTAT	2	8	280609	280616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013203	TAGG	2	8	280677	280684	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013203	ATAG	2	8	282117	282124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013203	CAAA	2	8	282128	282135	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013203	CTGT	2	8	285983	285990	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013203	TTAC	2	8	286006	286013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013203	AAGG	2	8	286029	286036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013203	AAAC	2	8	288112	288119	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013203	ATTT	2	8	288590	288597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013203	GATA	2	8	288668	288675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013203	CTAA	2	8	290050	290057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013203	TATG	2	8	295202	295209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013203	TTCC	2	8	302705	302712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013203	TTTG	2	8	304394	304401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013203	ATTT	2	8	304493	304500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013203	CAAA	2	8	309532	309539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013203	TATC	2	8	309653	309660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013203	TTTG	2	8	309937	309944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013203	ACAG	2	8	313062	313069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013203	CTTC	2	8	323765	323772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013203	CTTT	2	8	323976	323983	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013203	TTAA	2	8	323987	323994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013203	ATTT	2	8	324055	324062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013203	TAAC	2	8	327070	327077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013203	ATCC	2	8	331399	331406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013203	GAGC	2	8	331458	331465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013203	ACTT	2	8	336767	336774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013203	CCGT	2	8	338541	338548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013203	AAGG	2	8	338572	338579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013203	CAAG	2	8	339907	339914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013203	ATGT	2	8	343979	343986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013203	TGAT	2	8	346755	346762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013203	TAAA	2	8	358830	358837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013203	GATA	2	8	362509	362516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013203	AATC	2	8	369296	369303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013203	CAGC	2	8	371854	371861	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013203	ATAA	2	8	373116	373123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013203	GTTT	2	8	375586	375593	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013203	TCAG	2	8	378986	378993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013203	ATGG	2	8	383782	383789	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013203	GTAT	2	8	388718	388725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013203	CTTT	2	8	388726	388733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013203	CTTT	2	8	397023	397030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013203	CATG	2	8	397180	397187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013203	TCCT	2	8	407574	407581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013203	CTTG	2	8	407663	407670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013203	ACAT	2	8	410136	410143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013203	TCGG	2	8	412282	412289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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442	NC_013203	CTAG	2	8	1472597	1472604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
443	NC_013203	GTAT	2	8	1472625	1472632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
444	NC_013203	TCAA	2	8	1479123	1479130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
445	NC_013203	GCAA	2	8	1481433	1481440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
446	NC_013203	TCAT	2	8	1487111	1487118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
447	NC_013203	GCGT	2	8	1489209	1489216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
448	NC_013203	AAGT	2	8	1491636	1491643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
449	NC_013203	CGGC	2	8	1495304	1495311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
450	NC_013203	AATA	2	8	1495376	1495383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_013203	TAGG	2	8	1495392	1495399	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_013203	ATTG	2	8	1495551	1495558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_013203	AAAC	2	8	1497979	1497986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_013203	AACT	2	8	1501150	1501157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
455	NC_013203	AGTT	2	8	1501168	1501175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
456	NC_013203	TCTA	2	8	1504990	1504997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
457	NC_013203	TTCT	2	8	1506904	1506911	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
458	NC_013203	GTAA	2	8	1514966	1514973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
459	NC_013203	ATTA	2	8	1521573	1521580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_013203	TTGC	2	8	1525928	1525935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
461	NC_013203	CTTT	2	8	1526012	1526019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
462	NC_013203	GAAA	2	8	1526020	1526027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
463	NC_013203	GTTG	2	8	1533368	1533375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
464	NC_013203	AAAG	2	8	1538859	1538866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
465	NC_013203	CAGT	2	8	1542135	1542142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.